FuNGI

A0A4Q4V139

Protein Details

Accession

A0A4Q4V139

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-69	STESQTWDKARPRRSKRTRLARAPSTQEDH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-58	ARPRRSKRTR

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, extr 2, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSAFALRKRLLSAQTTSNPTASNITAEQPVKGDAALPTPSTESQTWDKARPRRSKRTRLARAPSTQEDHPEADSKELSQAAPVPGKAIPPDTAPSLPAESSPALALGGPRKLWHFCASTLRDLGKLSPYFRRLWNETPESDSTFRILYTSADGPKRALLQDLISPAEWNKEIARLVSKSASRPVSVMVTGPKSAGKSTFGKLLANRLVTQLPTGAKNKKIPDVAVLDLDPGQPEYGVPGQISLARLNEPVLQPSFCRPLPGDGFELIRSHSLASISPASDPDLYIEAARDLATHYRNILGNCSLIINTPGWIQGTGLDLLTSLISDLRPAEVIYMSQTGPAEAVDALQEACKTATFSTLPSQTTQYTSRTAAHLRAMQTMSYFHAETEVDQPLTKWNTNPLTTVPPWLVSYAGENRGIFGIMLYDYQTSPQLLADAINGTVLAAVEVENALGFRDLVDQETEAKGGDDDIHEADTKMDVDDDIDNDEQKRTGTSSLDELQKRLTVPTPEDLPLIGATHGTTLDPRYSQFLGLVLVRGIDVRNRALQLLTPIAAERIDKITARGGKIVLISGRFDPPSWAYTEDLLYRRATNSGRDINNTDNDEGEGDNNDDDDDDEPVEVVGDEGTEDSASEIEDAGSGVDTDATPTPWIEVLRGNQKRGAGSKVWRVRRDLGRGGNAAESPRPILSIPRRNCYMVSTCVNHSLPPPRDDLVVDDVPALLLLPLLLLLRGGDRRGPGEPPVFASAQPTPGLLVAALPIDQARAAGRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.52
3	0.5
4	0.46
5	0.42
6	0.38
7	0.37
8	0.29
9	0.26
10	0.21
11	0.22
12	0.27
13	0.26
14	0.26
15	0.23
16	0.24
17	0.21
18	0.19
19	0.19
20	0.13
21	0.16
22	0.18
23	0.17
24	0.17
25	0.2
26	0.21
27	0.23
28	0.23
29	0.24
30	0.27
31	0.35
32	0.38
33	0.43
34	0.51
35	0.54
36	0.64
37	0.69
38	0.74
39	0.77
40	0.84
41	0.87
42	0.89
43	0.92
44	0.93
45	0.93
46	0.93
47	0.9
48	0.88
49	0.84
50	0.8
51	0.74
52	0.65
53	0.6
54	0.54
55	0.47
56	0.41
57	0.38
58	0.32
59	0.3
60	0.29
61	0.24
62	0.24
63	0.23
64	0.21
65	0.17
66	0.21
67	0.22
68	0.24
69	0.23
70	0.22
71	0.21
72	0.23
73	0.23
74	0.21
75	0.18
76	0.18
77	0.2
78	0.22
79	0.22
80	0.21
81	0.22
82	0.21
83	0.2
84	0.18
85	0.19
86	0.15
87	0.15
88	0.15
89	0.12
90	0.1
91	0.1
92	0.13
93	0.14
94	0.16
95	0.16
96	0.17
97	0.2
98	0.22
99	0.26
100	0.28
101	0.27
102	0.27
103	0.36
104	0.39
105	0.41
106	0.42
107	0.4
108	0.36
109	0.34
110	0.33
111	0.3
112	0.29
113	0.28
114	0.32
115	0.34
116	0.36
117	0.4
118	0.46
119	0.44
120	0.48
121	0.54
122	0.52
123	0.5
124	0.52
125	0.49
126	0.46
127	0.42
128	0.36
129	0.28
130	0.23
131	0.21
132	0.16
133	0.14
134	0.1
135	0.13
136	0.17
137	0.21
138	0.23
139	0.24
140	0.24
141	0.26
142	0.28
143	0.24
144	0.22
145	0.17
146	0.17
147	0.19
148	0.21
149	0.2
150	0.17
151	0.18
152	0.16
153	0.18
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.15
158	0.15
159	0.16
160	0.21
161	0.19
162	0.21
163	0.25
164	0.27
165	0.26
166	0.32
167	0.33
168	0.28
169	0.27
170	0.27
171	0.24
172	0.22
173	0.21
174	0.19
175	0.19
176	0.18
177	0.19
178	0.18
179	0.17
180	0.18
181	0.17
182	0.17
183	0.19
184	0.2
185	0.25
186	0.25
187	0.27
188	0.26
189	0.32
190	0.32
191	0.31
192	0.3
193	0.26
194	0.26
195	0.23
196	0.23
197	0.19
198	0.16
199	0.18
200	0.23
201	0.26
202	0.3
203	0.36
204	0.38
205	0.41
206	0.41
207	0.38
208	0.37
209	0.36
210	0.32
211	0.28
212	0.25
213	0.2
214	0.18
215	0.17
216	0.13
217	0.09
218	0.08
219	0.06
220	0.06
221	0.08
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.11
228	0.13
229	0.11
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.15
235	0.14
236	0.16
237	0.16
238	0.16
239	0.15
240	0.19
241	0.23
242	0.19
243	0.21
244	0.19
245	0.23
246	0.25
247	0.27
248	0.25
249	0.22
250	0.23
251	0.21
252	0.21
253	0.16
254	0.14
255	0.11
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.14
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.11
291	0.09
292	0.1
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.05
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.18
349	0.16
350	0.19
351	0.2
352	0.18
353	0.17
354	0.18
355	0.18
356	0.19
357	0.19
358	0.18
359	0.19
360	0.2
361	0.19
362	0.21
363	0.2
364	0.18
365	0.17
366	0.16
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.12
375	0.12
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.14
380	0.16
381	0.16
382	0.13
383	0.18
384	0.21
385	0.22
386	0.22
387	0.2
388	0.23
389	0.22
390	0.24
391	0.18
392	0.16
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.08
397	0.1
398	0.12
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.14
403	0.14
404	0.14
405	0.1
406	0.07
407	0.06
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.05
413	0.06
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.09
447	0.1
448	0.09
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.05
455	0.06
456	0.07
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.15
482	0.19
483	0.26
484	0.26
485	0.25
486	0.24
487	0.25
488	0.24
489	0.22
490	0.21
491	0.17
492	0.19
493	0.21
494	0.23
495	0.22
496	0.21
497	0.2
498	0.17
499	0.14
500	0.13
501	0.1
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.09
510	0.09
511	0.1
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.14
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.12
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.1
527	0.11
528	0.13
529	0.14
530	0.15
531	0.14
532	0.15
533	0.16
534	0.16
535	0.14
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.12
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.13
546	0.19
547	0.22
548	0.23
549	0.23
550	0.21
551	0.21
552	0.21
553	0.22
554	0.17
555	0.14
556	0.15
557	0.15
558	0.17
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.17
563	0.18
564	0.18
565	0.18
566	0.17
567	0.18
568	0.19
569	0.21
570	0.21
571	0.21
572	0.2
573	0.2
574	0.19
575	0.22
576	0.22
577	0.22
578	0.27
579	0.33
580	0.34
581	0.36
582	0.39
583	0.39
584	0.42
585	0.41
586	0.34
587	0.27
588	0.25
589	0.22
590	0.19
591	0.16
592	0.12
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.05
628	0.05
629	0.07
630	0.08
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.1
635	0.12
636	0.13
637	0.12
638	0.15
639	0.2
640	0.31
641	0.35
642	0.37
643	0.37
644	0.4
645	0.42
646	0.41
647	0.41
648	0.36
649	0.38
650	0.46
651	0.52
652	0.58
653	0.58
654	0.61
655	0.64
656	0.66
657	0.68
658	0.66
659	0.64
660	0.61
661	0.59
662	0.55
663	0.49
664	0.42
665	0.36
666	0.29
667	0.24
668	0.19
669	0.18
670	0.17
671	0.15
672	0.23
673	0.31
674	0.4
675	0.44
676	0.49
677	0.52
678	0.53
679	0.53
680	0.5
681	0.45
682	0.41
683	0.42
684	0.39
685	0.38
686	0.43
687	0.43
688	0.38
689	0.38
690	0.41
691	0.4
692	0.39
693	0.4
694	0.34
695	0.35
696	0.35
697	0.34
698	0.31
699	0.27
700	0.25
701	0.21
702	0.2
703	0.18
704	0.17
705	0.13
706	0.06
707	0.04
708	0.04
709	0.03
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.05
715	0.09
716	0.11
717	0.13
718	0.15
719	0.17
720	0.21
721	0.23
722	0.25
723	0.28
724	0.3
725	0.3
726	0.31
727	0.33
728	0.31
729	0.29
730	0.31
731	0.27
732	0.26
733	0.25
734	0.21
735	0.18
736	0.17
737	0.17
738	0.12
739	0.1
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.08

A0A4Q4V139

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer