Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G9NDH6

Protein Details
Accession G9NDH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-100ARQEQPRRSPSPPKKREPTPDLTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-92RRDARRDDDERPNRREREPYDDRRRGGGRERERRDDGFARQEQPRRSPSPPKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MAQVLFISSHRDREREDRYSSGRDRRGDREWDRDRGSYRRDARRDDDERPNRREREPYDDRRRGGGRERERRDDGFARQEQPRRSPSPPKKREPTPDLTDIVPVLERKRRLTQWDIKPPGYDLVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPTKLQAFMTQPGGQVTSAGLKASNSRQAKRLLVSNVPSSVTDDALISFFNLQLNGLNVIDSSDPCVLSQFSQDKAFAVLEFRNASDATVALALDGITMEADDAQNGTANGGNHGLVIRRPKDYVMPALPDEMPYDPEVISNVVPDTVHKLCITNIPSFLNEDQVIELLAAFGKPKAFVLVKDRSTEESRGIAFTEYLEPSTANEPALNSLNGMDVGGKKLKVTKASIGPTQVANFDVGITAISGLASQTSNDIERSSVIQLLNMVTPEELMDNDDYEEICEDVQDECSKFGKVVELKVPRPSGGSRQSTGVGKIYVKFDSEESATKALTALAGRKFADRTVVSTYFPEENFEVGAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.54
4 0.53
5 0.56
6 0.62
7 0.66
8 0.67
9 0.65
10 0.65
11 0.67
12 0.66
13 0.68
14 0.68
15 0.67
16 0.68
17 0.67
18 0.69
19 0.68
20 0.66
21 0.64
22 0.62
23 0.61
24 0.6
25 0.63
26 0.65
27 0.67
28 0.69
29 0.7
30 0.72
31 0.72
32 0.7
33 0.72
34 0.72
35 0.74
36 0.75
37 0.78
38 0.72
39 0.71
40 0.72
41 0.66
42 0.66
43 0.67
44 0.7
45 0.72
46 0.75
47 0.72
48 0.7
49 0.69
50 0.64
51 0.63
52 0.63
53 0.62
54 0.65
55 0.71
56 0.71
57 0.73
58 0.7
59 0.67
60 0.63
61 0.58
62 0.57
63 0.55
64 0.52
65 0.55
66 0.6
67 0.58
68 0.59
69 0.61
70 0.57
71 0.59
72 0.64
73 0.68
74 0.73
75 0.77
76 0.79
77 0.8
78 0.84
79 0.87
80 0.84
81 0.82
82 0.77
83 0.73
84 0.65
85 0.56
86 0.49
87 0.38
88 0.31
89 0.24
90 0.18
91 0.18
92 0.22
93 0.24
94 0.28
95 0.35
96 0.39
97 0.44
98 0.52
99 0.57
100 0.62
101 0.7
102 0.71
103 0.65
104 0.61
105 0.56
106 0.5
107 0.4
108 0.3
109 0.21
110 0.18
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.12
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.19
127 0.18
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.29
132 0.31
133 0.36
134 0.33
135 0.35
136 0.34
137 0.34
138 0.32
139 0.28
140 0.26
141 0.22
142 0.25
143 0.23
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.17
148 0.15
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.11
156 0.14
157 0.22
158 0.24
159 0.26
160 0.3
161 0.34
162 0.36
163 0.35
164 0.38
165 0.33
166 0.33
167 0.34
168 0.32
169 0.29
170 0.27
171 0.25
172 0.21
173 0.18
174 0.14
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.19
256 0.2
257 0.23
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.18
264 0.17
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.18
286 0.2
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.2
292 0.2
293 0.17
294 0.14
295 0.13
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.07
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.09
310 0.1
311 0.12
312 0.19
313 0.26
314 0.27
315 0.29
316 0.31
317 0.31
318 0.34
319 0.33
320 0.28
321 0.23
322 0.22
323 0.2
324 0.2
325 0.16
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.14
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.18
354 0.21
355 0.24
356 0.27
357 0.3
358 0.35
359 0.39
360 0.41
361 0.38
362 0.37
363 0.34
364 0.31
365 0.26
366 0.19
367 0.16
368 0.13
369 0.1
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.16
392 0.14
393 0.14
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.14
398 0.13
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.1
418 0.13
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.22
426 0.22
427 0.27
428 0.33
429 0.4
430 0.42
431 0.49
432 0.5
433 0.42
434 0.43
435 0.41
436 0.41
437 0.43
438 0.46
439 0.4
440 0.41
441 0.45
442 0.44
443 0.43
444 0.37
445 0.31
446 0.27
447 0.29
448 0.29
449 0.27
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.23
454 0.23
455 0.23
456 0.24
457 0.25
458 0.23
459 0.22
460 0.21
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.18
465 0.19
466 0.23
467 0.24
468 0.27
469 0.28
470 0.27
471 0.32
472 0.27
473 0.28
474 0.32
475 0.33
476 0.31
477 0.32
478 0.35
479 0.31
480 0.3
481 0.31
482 0.24
483 0.23