Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G9MHA1

Protein Details
Accession G9MHA1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-40AAPTEKKVVKKIIRRKRRPARPQVEPDFFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-31KKVVKKIIRRKRRPAR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 10.5, nucl 5.5, cysk 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MAVATTNSEVAAPTEKKVVKKIIRRKRRPARPQVEPDFFTNEPPPQTGTTFNIWYNKWAGGDHEAYQQTKSKGRCNVARDSGYTKADGVSGSYFCLFFARGLCPRGADCMYLHRLPGPYDVSAPNVDCFGRDKFSDYRDDMGGVGSFMRQNRTIYIGRIHVTDDIEEIVARHFAEWGPIERIRVLNSRGVGFVTYVNEANAEFAKEAMAHQSLDHDEILNVRWATADPNPMARAREARRIEEQAAEAIRRALPAEFVAEIEGKDPEARKRRKLESSYGLEGYEAPDEIHFAQGPSAVNPAGRRGFEVEYQERPLIEDGTVGETEPEAQEGNQQQPAQSAGVFSSSTLAALGRAKVAVASKPAAPASTGPLVAYDSDSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.33
4 0.4
5 0.48
6 0.49
7 0.58
8 0.68
9 0.71
10 0.78
11 0.86
12 0.9
13 0.91
14 0.93
15 0.94
16 0.95
17 0.93
18 0.92
19 0.92
20 0.91
21 0.87
22 0.78
23 0.7
24 0.65
25 0.56
26 0.49
27 0.43
28 0.37
29 0.31
30 0.3
31 0.3
32 0.25
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.27
37 0.28
38 0.3
39 0.33
40 0.31
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.25
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.24
49 0.23
50 0.27
51 0.29
52 0.29
53 0.3
54 0.33
55 0.31
56 0.35
57 0.36
58 0.37
59 0.42
60 0.49
61 0.53
62 0.53
63 0.59
64 0.6
65 0.59
66 0.55
67 0.52
68 0.49
69 0.44
70 0.39
71 0.31
72 0.23
73 0.21
74 0.18
75 0.15
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.11
86 0.14
87 0.17
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.23
93 0.21
94 0.18
95 0.15
96 0.2
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.22
101 0.23
102 0.22
103 0.25
104 0.21
105 0.17
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.17
120 0.19
121 0.22
122 0.27
123 0.26
124 0.26
125 0.24
126 0.25
127 0.2
128 0.18
129 0.15
130 0.1
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.21
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.15
214 0.12
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.17
220 0.23
221 0.22
222 0.31
223 0.32
224 0.34
225 0.37
226 0.39
227 0.4
228 0.34
229 0.31
230 0.25
231 0.24
232 0.21
233 0.16
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.09
251 0.11
252 0.18
253 0.28
254 0.34
255 0.41
256 0.49
257 0.56
258 0.64
259 0.68
260 0.68
261 0.67
262 0.68
263 0.64
264 0.57
265 0.5
266 0.4
267 0.35
268 0.27
269 0.19
270 0.12
271 0.08
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.24
292 0.26
293 0.33
294 0.32
295 0.32
296 0.36
297 0.35
298 0.31
299 0.3
300 0.28
301 0.21
302 0.17
303 0.14
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.07
314 0.07
315 0.13
316 0.17
317 0.21
318 0.25
319 0.25
320 0.24
321 0.25
322 0.27
323 0.22
324 0.19
325 0.15
326 0.11
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.13
342 0.16
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.2
347 0.23
348 0.24
349 0.23
350 0.22
351 0.2
352 0.22
353 0.23
354 0.22
355 0.19
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.19