FuNGI

A0A4R0RTT4

Protein Details

Accession

A0A4R0RTT4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
887-896	GRGRGRGRGG

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 8, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVLPVVEEQANEVENADGEKVTIPIDMSNPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEHMMVEIMKYTDRVVGMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEAHKAALIEWEARGQVVTDHERNKKQWDSNAITPGTPFMDLLATSLRYWVAAKMNSDPGWAELEVIISDASVPGEGEHKIMDYVRRQRVNPGHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPNFRVLREDVFAQQAPRNTCRICGQIGHMAAQCTNQREENTKPAHDIKPFIFLDVAILREYLDGELRLSHSFYDLERAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWKQELPRMGGYITDHGQLVLERVQIILEGLAKREDEIFRKRHEAETRQDQAAKRRKLMEKDLGATDAGPSSSLNLTSGPTAPATDFAANADSIGFGGPQTSETVQLAPAAAQALAGSNRDIVANRRAIRMANMSAAEMLKAEMQGLTPLKVSKSAPTNGSVAESAQGAVNGDIDGQPMDEDRAEALSHGVKRKLEDVKTEEADEGIGSEEDDAPADADQEPDYTLVVNGDGSVAQKDNVKLWEAGYRERYYRQKFGKELSDTAFRKEVTTKYVEGMAWVLHYYYQGTPSWTWYYPYHFAPFAADFEDVKDMKLEFSIGQPFRPFEQLMGVFPAASRMHIPSVFQPLMTEEDSPIIDFYPTSFQVDMNGKKMTWQGVALLPFIDETRLLDAMNAHYPKLSEDENRRNTWGNTVIYIPEEHPLYPSIEALYGKRKSDEPVPINPEKSKGLSGFLLPNPECMPGTPFPCPFSDVSMPDIKNDRSLSALYLFPEQITAHKSVLLPGVEVPPPVLSEEDRENVRQGGGRGRGRGRGGRGGYQDGNYGRPERGGSAAFGYQSSYNGQGRDHTRNFNSRGPSDYQRSSYESSGQRYEQSSSYGGGAQQQYTSYQAQSSYPPRQSYDSYDSGGYNARGGPPPQNYNSYGGRGGGRGGPPRGGYNNYDNSYNQSYNPQPAGYNNSRGGYQGSNRGGYGGYGGGNPGGGYGGYGGGGGGGYGGGGGGGYGGPQNGGGYNTGYNRGGSNGPMRGRGRGGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.64
4	0.67
5	0.64
6	0.61
7	0.59
8	0.55
9	0.47
10	0.43
11	0.36
12	0.31
13	0.26
14	0.19
15	0.14
16	0.11
17	0.1
18	0.11
19	0.1
20	0.08
21	0.08
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.1
26	0.09
27	0.1
28	0.13
29	0.16
30	0.18
31	0.26
32	0.27
33	0.28
34	0.28
35	0.27
36	0.29
37	0.27
38	0.28
39	0.23
40	0.24
41	0.23
42	0.22
43	0.23
44	0.18
45	0.16
46	0.13
47	0.1
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.32
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.41
63	0.39
64	0.43
65	0.4
66	0.37
67	0.33
68	0.28
69	0.26
70	0.21
71	0.19
72	0.17
73	0.14
74	0.1
75	0.11
76	0.11
77	0.13
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.19
82	0.28
83	0.36
84	0.38
85	0.4
86	0.4
87	0.42
88	0.41
89	0.38
90	0.3
91	0.27
92	0.27
93	0.22
94	0.23
95	0.21
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.77
116	0.72
117	0.68
118	0.71
119	0.65
120	0.57
121	0.56
122	0.48
123	0.39
124	0.38
125	0.33
126	0.28
127	0.29
128	0.28
129	0.2
130	0.19
131	0.19
132	0.15
133	0.15
134	0.13
135	0.1
136	0.1
137	0.14
138	0.21
139	0.25
140	0.33
141	0.4
142	0.47
143	0.49
144	0.55
145	0.58
146	0.57
147	0.58
148	0.6
149	0.6
150	0.61
151	0.65
152	0.58
153	0.5
154	0.44
155	0.39
156	0.31
157	0.23
158	0.16
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.12
170	0.14
171	0.17
172	0.19
173	0.21
174	0.24
175	0.3
176	0.3
177	0.3
178	0.27
179	0.22
180	0.22
181	0.2
182	0.17
183	0.11
184	0.12
185	0.11
186	0.1
187	0.09
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.11
202	0.15
203	0.22
204	0.31
205	0.39
206	0.44
207	0.44
208	0.52
209	0.59
210	0.62
211	0.63
212	0.63
213	0.63
214	0.64
215	0.68
216	0.64
217	0.63
218	0.56
219	0.46
220	0.39
221	0.31
222	0.26
223	0.25
224	0.21
225	0.14
226	0.13
227	0.13
228	0.11
229	0.09
230	0.08
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.19
243	0.19
244	0.21
245	0.22
246	0.23
247	0.19
248	0.22
249	0.23
250	0.21
251	0.23
252	0.26
253	0.28
254	0.29
255	0.32
256	0.28
257	0.3
258	0.31
259	0.31
260	0.29
261	0.26
262	0.27
263	0.28
264	0.29
265	0.29
266	0.27
267	0.24
268	0.23
269	0.24
270	0.23
271	0.2
272	0.21
273	0.21
274	0.22
275	0.25
276	0.29
277	0.34
278	0.36
279	0.34
280	0.37
281	0.4
282	0.43
283	0.41
284	0.41
285	0.33
286	0.37
287	0.35
288	0.32
289	0.26
290	0.21
291	0.21
292	0.19
293	0.19
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.1
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.11
310	0.1
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.13
315	0.14
316	0.13
317	0.12
318	0.12
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.04
328	0.03
329	0.04
330	0.05
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.07
346	0.05
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.15
353	0.18
354	0.23
355	0.24
356	0.27
357	0.28
358	0.28
359	0.27
360	0.23
361	0.22
362	0.2
363	0.17
364	0.13
365	0.12
366	0.11
367	0.11
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.12
385	0.14
386	0.16
387	0.23
388	0.27
389	0.29
390	0.35
391	0.36
392	0.4
393	0.45
394	0.46
395	0.46
396	0.52
397	0.53
398	0.5
399	0.52
400	0.48
401	0.5
402	0.54
403	0.5
404	0.45
405	0.48
406	0.52
407	0.53
408	0.58
409	0.57
410	0.51
411	0.5
412	0.47
413	0.4
414	0.34
415	0.28
416	0.21
417	0.13
418	0.09
419	0.06
420	0.05
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.09
473	0.13
474	0.18
475	0.19
476	0.21
477	0.21
478	0.21
479	0.22
480	0.23
481	0.19
482	0.16
483	0.15
484	0.13
485	0.14
486	0.13
487	0.11
488	0.08
489	0.07
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.17
505	0.19
506	0.19
507	0.21
508	0.21
509	0.19
510	0.2
511	0.16
512	0.12
513	0.1
514	0.08
515	0.07
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.08
538	0.1
539	0.13
540	0.15
541	0.15
542	0.16
543	0.21
544	0.26
545	0.24
546	0.27
547	0.28
548	0.31
549	0.31
550	0.31
551	0.26
552	0.2
553	0.19
554	0.14
555	0.09
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.04
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.08
587	0.08
588	0.1
589	0.11
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.16
594	0.15
595	0.18
596	0.21
597	0.21
598	0.21
599	0.26
600	0.34
601	0.34
602	0.41
603	0.44
604	0.45
605	0.46
606	0.48
607	0.5
608	0.45
609	0.42
610	0.37
611	0.4
612	0.35
613	0.35
614	0.34
615	0.26
616	0.25
617	0.26
618	0.24
619	0.19
620	0.21
621	0.2
622	0.18
623	0.2
624	0.18
625	0.15
626	0.15
627	0.11
628	0.08
629	0.08
630	0.07
631	0.05
632	0.05
633	0.07
634	0.06
635	0.08
636	0.09
637	0.11
638	0.11
639	0.14
640	0.18
641	0.16
642	0.19
643	0.18
644	0.23
645	0.24
646	0.25
647	0.24
648	0.21
649	0.21
650	0.2
651	0.2
652	0.15
653	0.14
654	0.13
655	0.1
656	0.11
657	0.15
658	0.13
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.1
663	0.1
664	0.1
665	0.07
666	0.09
667	0.16
668	0.16
669	0.17
670	0.18
671	0.19
672	0.19
673	0.21
674	0.19
675	0.12
676	0.17
677	0.16
678	0.16
679	0.17
680	0.16
681	0.13
682	0.13
683	0.16
684	0.11
685	0.11
686	0.11
687	0.1
688	0.12
689	0.12
690	0.14
691	0.12
692	0.2
693	0.19
694	0.18
695	0.17
696	0.16
697	0.19
698	0.19
699	0.17
700	0.1
701	0.11
702	0.11
703	0.11
704	0.1
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.07
709	0.1
710	0.1
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.16
715	0.23
716	0.23
717	0.22
718	0.23
719	0.21
720	0.22
721	0.24
722	0.22
723	0.17
724	0.15
725	0.14
726	0.16
727	0.17
728	0.15
729	0.14
730	0.11
731	0.11
732	0.1
733	0.09
734	0.06
735	0.05
736	0.07
737	0.08
738	0.07
739	0.08
740	0.09
741	0.11
742	0.17
743	0.17
744	0.15
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.17
749	0.17
750	0.17
751	0.26
752	0.36
753	0.42
754	0.44
755	0.45
756	0.46
757	0.44
758	0.42
759	0.39
760	0.3
761	0.25
762	0.24
763	0.22
764	0.2
765	0.21
766	0.16
767	0.13
768	0.13
769	0.11
770	0.12
771	0.12
772	0.13
773	0.12
774	0.12
775	0.1
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.2
780	0.21
781	0.22
782	0.23
783	0.24
784	0.25
785	0.31
786	0.39
787	0.35
788	0.4
789	0.47
790	0.49
791	0.5
792	0.49
793	0.45
794	0.37
795	0.35
796	0.3
797	0.23
798	0.22
799	0.2
800	0.21
801	0.23
802	0.22
803	0.28
804	0.24
805	0.26
806	0.24
807	0.24
808	0.22
809	0.17
810	0.21
811	0.17
812	0.21
813	0.23
814	0.24
815	0.24
816	0.25
817	0.27
818	0.23
819	0.25
820	0.26
821	0.23
822	0.26
823	0.31
824	0.3
825	0.3
826	0.34
827	0.29
828	0.3
829	0.29
830	0.26
831	0.21
832	0.21
833	0.2
834	0.18
835	0.19
836	0.15
837	0.17
838	0.16
839	0.14
840	0.15
841	0.13
842	0.13
843	0.15
844	0.16
845	0.14
846	0.16
847	0.16
848	0.17
849	0.21
850	0.19
851	0.16
852	0.15
853	0.18
854	0.17
855	0.17
856	0.15
857	0.11
858	0.12
859	0.12
860	0.12
861	0.09
862	0.12
863	0.15
864	0.18
865	0.2
866	0.2
867	0.21
868	0.21
869	0.21
870	0.21
871	0.19
872	0.23
873	0.3
874	0.32
875	0.36
876	0.38
877	0.43
878	0.44
879	0.48
880	0.45
881	0.45
882	0.44
883	0.44
884	0.45
885	0.45
886	0.42
887	0.38
888	0.38
889	0.31
890	0.31
891	0.27
892	0.26
893	0.21
894	0.21
895	0.21
896	0.17
897	0.19
898	0.18
899	0.16
900	0.17
901	0.18
902	0.17
903	0.16
904	0.16
905	0.14
906	0.14
907	0.14
908	0.16
909	0.17
910	0.18
911	0.18
912	0.23
913	0.29
914	0.37
915	0.4
916	0.42
917	0.46
918	0.53
919	0.57
920	0.57
921	0.57
922	0.5
923	0.5
924	0.48
925	0.5
926	0.48
927	0.48
928	0.45
929	0.42
930	0.45
931	0.44
932	0.4
933	0.41
934	0.4
935	0.4
936	0.41
937	0.39
938	0.37
939	0.36
940	0.37
941	0.31
942	0.29
943	0.25
944	0.22
945	0.22
946	0.2
947	0.18
948	0.21
949	0.21
950	0.19
951	0.18
952	0.18
953	0.18
954	0.2
955	0.21
956	0.16
957	0.16
958	0.16
959	0.17
960	0.23
961	0.3
962	0.35
963	0.39
964	0.41
965	0.42
966	0.45
967	0.47
968	0.48
969	0.48
970	0.42
971	0.38
972	0.37
973	0.35
974	0.32
975	0.32
976	0.25
977	0.19
978	0.17
979	0.18
980	0.2
981	0.22
982	0.28
983	0.31
984	0.37
985	0.39
986	0.43
987	0.42
988	0.44
989	0.45
990	0.41
991	0.36
992	0.31
993	0.29
994	0.25
995	0.24
996	0.24
997	0.26
998	0.28
999	0.29
1000	0.3
1001	0.3
1002	0.34
1003	0.36
1004	0.35
1005	0.35
1006	0.37
1007	0.44
1008	0.42
1009	0.43
1010	0.39
1011	0.42
1012	0.44
1013	0.41
1014	0.34
1015	0.33
1016	0.35
1017	0.38
1018	0.4
1019	0.35
1020	0.3
1021	0.32
1022	0.4
1023	0.38
1024	0.41
1025	0.38
1026	0.37
1027	0.36
1028	0.36
1029	0.36
1030	0.32
1031	0.31
1032	0.33
1033	0.34
1034	0.34
1035	0.34
1036	0.34
1037	0.3
1038	0.25
1039	0.22
1040	0.14
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.07
1048	0.06
1049	0.05
1050	0.05
1051	0.05
1052	0.06
1053	0.05
1054	0.06
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.05
1058	0.04
1059	0.03
1060	0.03
1061	0.03
1062	0.02
1063	0.02
1064	0.02
1065	0.02
1066	0.02
1067	0.02
1068	0.03
1069	0.03
1070	0.04
1071	0.05
1072	0.05
1073	0.06
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.09
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.15
1080	0.17
1081	0.21
1082	0.21
1083	0.21
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.22
1087	0.22
1088	0.27
1089	0.3
1090	0.31
1091	0.39
1092	0.4
1093	0.41
1094	0.45

A0A4R0RTT4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer