Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R0RBG0

Protein Details
Accession A0A4R0RBG0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MNRRTKGIRWTWKTRRRDTEAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045867  DNA-dir_RpoC_beta_prime  
IPR006592  RNA_pol_N  
IPR007080  RNA_pol_Rpb1_1  
IPR044893  RNA_pol_Rpb1_clamp_domain  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04997  RNA_pol_Rpb1_1  
Amino Acid Sequences MNRRTKGIRWTWKTRRRDTEAVAPPNLWYGLEEGLKLFVQYKRSKDEDEESKSLQPDKRLFPPHEVYTALKKISDSDLHLLGLSDEYARPEWMILTVMPVPPPPVRPSIAVDGGAMHSEDDLTYKLGDIIKASANVRQCEQEGAPAHVITEFEQLLQFHVATYMDNDIAGIPQALQKSGRPVKAIRACLKSKEGRLRGNLMGKRVDFSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.86
3 0.84
4 0.83
5 0.78
6 0.78
7 0.78
8 0.74
9 0.66
10 0.56
11 0.47
12 0.42
13 0.36
14 0.25
15 0.16
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.11
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.15
25 0.14
26 0.21
27 0.26
28 0.3
29 0.35
30 0.38
31 0.41
32 0.41
33 0.46
34 0.48
35 0.5
36 0.5
37 0.46
38 0.46
39 0.45
40 0.46
41 0.4
42 0.38
43 0.36
44 0.37
45 0.42
46 0.47
47 0.47
48 0.48
49 0.52
50 0.47
51 0.44
52 0.41
53 0.36
54 0.35
55 0.35
56 0.29
57 0.23
58 0.21
59 0.21
60 0.22
61 0.21
62 0.18
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.15
68 0.12
69 0.1
70 0.07
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.05
82 0.06
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.19
130 0.21
131 0.21
132 0.19
133 0.18
134 0.16
135 0.17
136 0.12
137 0.13
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.22
165 0.29
166 0.31
167 0.32
168 0.33
169 0.43
170 0.5
171 0.57
172 0.54
173 0.56
174 0.56
175 0.58
176 0.64
177 0.61
178 0.62
179 0.64
180 0.64
181 0.64
182 0.66
183 0.66
184 0.65
185 0.68
186 0.62
187 0.56
188 0.55
189 0.48