FuNGI

A0A4R0RL52

Protein Details

Accession

A0A4R0RL52

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-296	LDDQSVRKGKKRRLDKRKASLTESE	Hydrophilic
298-317	EKAKEKEKDRETRKLKPKCF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-314	RKGKKRRLDKRKASLTESEVEKAKEKEKDRETRKLKP

Subcellular Location(s)

plas 13, cyto 5, nucl 3, cyto_pero 3, mito 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKLVTTFHPPSSVADSVKCVLSPDSEFGHLVVAKTNRIEVFSLTRDGLRQECDVEIWGRVLAVRAIPVKRESVDCHNILVMVDHPDPRIVVLSYEEENGSARLTDVGSVFLHDRVARHAEFCNDVVVDPTGNVAVVSCYVGKLRVLVLNEGVIEQDFDVILPELNLLSLSFLHTSNEQYSLAIVHLDFQQRIQLLCRDLNVEAQDLAAETSQVLPNTVLSAAIFPFADVPPVLIPVPPFALSGDCGSENKQSPGGVLVVGGRKILFYELASLDDQSVRKGKKRRLDKRKASLTESEVEKAKEKEKDRETRKLKPKCFVKWPWSEVTSWTSVDTASRKFFLGDKFGRLSMLVLDDSPKLILIPVGEISPPTSITYLSNQVLYVGSHLGPAQLVRMHQEIIDSPEDDTLPIPSGFSTATSLSSPAAEDESGDGHIDNRRANGIIIRSKGNHLEILDTYRNIAPIMDAVLADPESSGQIVTCSGGANSGSLNVIRSGAEVNELAIVEGLSCVSSVFPIRTRYESSTHSHLLISTSYESHVFRLDGQDAFTRLDAATCPFVTYSPTLALSNIPRRVTTNVGGKSTSSYVDSSLVVQVTSKGIRILEFDEALGTFHVAGDGWSVDNLDPTWQGREVVAASVNASQFVLAFSGGRLALFNMADDRTVRMQHRFVDKGNNAREICAVSCAPFDRTKSFSLFVAVSYWDSNKVEILSLKSQNMESVASTIELPALPRSIMLHNFGTGNKAKESDYQPHVLAGLTDGSVVSFVFRNNELLDRKIFGLGTAPVTLSTCEVQGRHAVFASGSRAAILHWDRKRLRQSAVMLKEIVVGVTLNTSLFPSALVAATSDSLIICRISGIDKLQVRSMSLGLDNPTRIAHDPISNMFGVTSLRSTPSRIGDAETTLSSFNAFDGSLRRLGQYTCEADEEVTAVATAASLPLSRDGRQSSCFVVGSVQHQLGKLESELGRLMVFPANYPGAASGGAIRPLISTETEGCVYAIAILEKFIAVAVNTAVHLYRITSTEESDGLKLERVSQWNHNYFVTSLVARDGHIVAGDAISSVTVLRIQDSELKSVARDYSPLWPVAVEMTSKQGVVGADSDCNLFTFSLGRSGTRTVLERDGFYHVGEVVNKFLPGGIGALDSNEVGSFQPEHLFFTSTGRIGQTLQAAEDVALPLTALQRNMAKYIKGVGDMSHTKFRAPANARGRTDAEPAFGFLDGDFMELFLADSRKHQFLNGDLEVERTGLSQPEAEALLEKLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.31
3	0.3
4	0.3
5	0.27
6	0.22
7	0.19
8	0.21
9	0.22
10	0.21
11	0.22
12	0.23
13	0.24
14	0.22
15	0.25
16	0.23
17	0.2
18	0.23
19	0.23
20	0.23
21	0.24
22	0.28
23	0.24
24	0.25
25	0.26
26	0.23
27	0.27
28	0.27
29	0.29
30	0.26
31	0.27
32	0.26
33	0.28
34	0.28
35	0.25
36	0.23
37	0.22
38	0.22
39	0.22
40	0.23
41	0.21
42	0.19
43	0.17
44	0.15
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.12
49	0.11
50	0.14
51	0.2
52	0.21
53	0.25
54	0.26
55	0.28
56	0.29
57	0.32
58	0.33
59	0.36
60	0.43
61	0.4
62	0.39
63	0.36
64	0.34
65	0.31
66	0.27
67	0.19
68	0.17
69	0.19
70	0.19
71	0.19
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.19
76	0.14
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.17
81	0.19
82	0.18
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.13
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.11
92	0.1
93	0.12
94	0.11
95	0.13
96	0.14
97	0.13
98	0.15
99	0.15
100	0.15
101	0.18
102	0.23
103	0.22
104	0.23
105	0.26
106	0.26
107	0.29
108	0.28
109	0.26
110	0.21
111	0.2
112	0.2
113	0.18
114	0.15
115	0.12
116	0.12
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.08
124	0.07
125	0.08
126	0.09
127	0.1
128	0.1
129	0.11
130	0.13
131	0.15
132	0.17
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.18
137	0.17
138	0.15
139	0.11
140	0.09
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.06
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.11
160	0.12
161	0.15
162	0.16
163	0.18
164	0.16
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.13
169	0.11
170	0.09
171	0.09
172	0.13
173	0.16
174	0.16
175	0.15
176	0.19
177	0.19
178	0.2
179	0.22
180	0.22
181	0.23
182	0.24
183	0.25
184	0.23
185	0.23
186	0.26
187	0.24
188	0.21
189	0.17
190	0.15
191	0.14
192	0.12
193	0.12
194	0.08
195	0.06
196	0.05
197	0.08
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.1
202	0.1
203	0.12
204	0.11
205	0.09
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.09
213	0.09
214	0.1
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.13
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.12
229	0.13
230	0.13
231	0.12
232	0.13
233	0.15
234	0.2
235	0.21
236	0.22
237	0.23
238	0.2
239	0.2
240	0.21
241	0.19
242	0.13
243	0.11
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.09
253	0.07
254	0.11
255	0.11
256	0.14
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.16
262	0.15
263	0.21
264	0.22
265	0.29
266	0.38
267	0.44
268	0.5
269	0.61
270	0.7
271	0.74
272	0.83
273	0.86
274	0.88
275	0.91
276	0.87
277	0.81
278	0.75
279	0.68
280	0.62
281	0.54
282	0.46
283	0.38
284	0.35
285	0.34
286	0.3
287	0.32
288	0.34
289	0.36
290	0.43
291	0.49
292	0.58
293	0.61
294	0.7
295	0.71
296	0.74
297	0.8
298	0.8
299	0.77
300	0.76
301	0.78
302	0.75
303	0.78
304	0.76
305	0.75
306	0.74
307	0.72
308	0.68
309	0.61
310	0.54
311	0.47
312	0.42
313	0.36
314	0.27
315	0.23
316	0.17
317	0.16
318	0.18
319	0.18
320	0.18
321	0.17
322	0.18
323	0.18
324	0.19
325	0.22
326	0.23
327	0.28
328	0.27
329	0.29
330	0.3
331	0.3
332	0.29
333	0.26
334	0.23
335	0.15
336	0.15
337	0.1
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.08
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.1
360	0.13
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.15
365	0.16
366	0.15
367	0.14
368	0.12
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.14
386	0.15
387	0.13
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.1
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.15
427	0.18
428	0.2
429	0.21
430	0.23
431	0.23
432	0.24
433	0.26
434	0.24
435	0.21
436	0.17
437	0.17
438	0.16
439	0.2
440	0.2
441	0.18
442	0.18
443	0.17
444	0.17
445	0.14
446	0.13
447	0.08
448	0.07
449	0.08
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.03
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.06
500	0.09
501	0.13
502	0.15
503	0.17
504	0.21
505	0.24
506	0.26
507	0.29
508	0.3
509	0.31
510	0.3
511	0.29
512	0.25
513	0.22
514	0.2
515	0.17
516	0.14
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.13
532	0.14
533	0.13
534	0.11
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.12
552	0.15
553	0.2
554	0.23
555	0.22
556	0.21
557	0.23
558	0.25
559	0.26
560	0.26
561	0.28
562	0.27
563	0.27
564	0.27
565	0.25
566	0.25
567	0.22
568	0.19
569	0.12
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.11
574	0.1
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.1
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.07
595	0.05
596	0.04
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.06
621	0.07
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.03
631	0.04
632	0.03
633	0.05
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.06
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.11
648	0.13
649	0.14
650	0.16
651	0.21
652	0.26
653	0.26
654	0.26
655	0.32
656	0.33
657	0.38
658	0.39
659	0.41
660	0.36
661	0.34
662	0.34
663	0.26
664	0.23
665	0.18
666	0.15
667	0.09
668	0.1
669	0.1
670	0.12
671	0.13
672	0.15
673	0.15
674	0.18
675	0.2
676	0.21
677	0.21
678	0.19
679	0.19
680	0.17
681	0.14
682	0.13
683	0.11
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.1
694	0.13
695	0.15
696	0.17
697	0.17
698	0.18
699	0.17
700	0.17
701	0.16
702	0.13
703	0.09
704	0.08
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.05
715	0.06
716	0.08
717	0.09
718	0.11
719	0.13
720	0.13
721	0.13
722	0.14
723	0.14
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.15
728	0.15
729	0.16
730	0.2
731	0.24
732	0.27
733	0.28
734	0.29
735	0.28
736	0.27
737	0.27
738	0.21
739	0.17
740	0.11
741	0.08
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.05
751	0.07
752	0.07
753	0.09
754	0.09
755	0.14
756	0.15
757	0.17
758	0.17
759	0.17
760	0.17
761	0.17
762	0.16
763	0.11
764	0.12
765	0.11
766	0.11
767	0.1
768	0.09
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.13
779	0.14
780	0.14
781	0.13
782	0.13
783	0.12
784	0.13
785	0.14
786	0.11
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.08
791	0.14
792	0.16
793	0.22
794	0.23
795	0.32
796	0.34
797	0.41
798	0.48
799	0.46
800	0.46
801	0.45
802	0.49
803	0.5
804	0.52
805	0.47
806	0.4
807	0.36
808	0.34
809	0.28
810	0.21
811	0.11
812	0.07
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.04
817	0.04
818	0.05
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.05
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.05
828	0.06
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.05
835	0.04
836	0.04
837	0.05
838	0.06
839	0.08
840	0.09
841	0.15
842	0.17
843	0.19
844	0.22
845	0.21
846	0.21
847	0.21
848	0.19
849	0.15
850	0.12
851	0.13
852	0.12
853	0.14
854	0.13
855	0.13
856	0.13
857	0.13
858	0.14
859	0.15
860	0.15
861	0.16
862	0.17
863	0.18
864	0.21
865	0.19
866	0.17
867	0.14
868	0.13
869	0.11
870	0.09
871	0.09
872	0.07
873	0.1
874	0.11
875	0.13
876	0.15
877	0.18
878	0.2
879	0.19
880	0.21
881	0.2
882	0.21
883	0.21
884	0.17
885	0.15
886	0.13
887	0.12
888	0.1
889	0.09
890	0.07
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.09
895	0.12
896	0.14
897	0.15
898	0.16
899	0.16
900	0.16
901	0.19
902	0.21
903	0.21
904	0.2
905	0.2
906	0.2
907	0.18
908	0.18
909	0.16
910	0.1
911	0.07
912	0.06
913	0.05
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.03
918	0.03
919	0.04
920	0.04
921	0.09
922	0.12
923	0.13
924	0.17
925	0.2
926	0.23
927	0.25
928	0.27
929	0.24
930	0.25
931	0.24
932	0.2
933	0.19
934	0.17
935	0.18
936	0.2
937	0.19
938	0.17
939	0.18
940	0.18
941	0.17
942	0.16
943	0.14
944	0.15
945	0.14
946	0.14
947	0.14
948	0.14
949	0.13
950	0.12
951	0.13
952	0.11
953	0.11
954	0.09
955	0.12
956	0.12
957	0.12
958	0.12
959	0.11
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.09
965	0.11
966	0.11
967	0.1
968	0.1
969	0.1
970	0.12
971	0.1
972	0.1
973	0.1
974	0.13
975	0.13
976	0.14
977	0.13
978	0.11
979	0.11
980	0.09
981	0.09
982	0.07
983	0.06
984	0.06
985	0.07
986	0.06
987	0.06
988	0.06
989	0.05
990	0.04
991	0.05
992	0.05
993	0.06
994	0.06
995	0.07
996	0.07
997	0.07
998	0.07
999	0.07
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.16
1006	0.18
1007	0.19
1008	0.17
1009	0.18
1010	0.14
1011	0.16
1012	0.15
1013	0.16
1014	0.2
1015	0.22
1016	0.26
1017	0.32
1018	0.41
1019	0.42
1020	0.44
1021	0.41
1022	0.38
1023	0.35
1024	0.33
1025	0.27
1026	0.18
1027	0.15
1028	0.15
1029	0.15
1030	0.13
1031	0.15
1032	0.13
1033	0.11
1034	0.1
1035	0.11
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.04
1042	0.04
1043	0.04
1044	0.04
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.1
1050	0.17
1051	0.19
1052	0.21
1053	0.21
1054	0.21
1055	0.2
1056	0.22
1057	0.23
1058	0.17
1059	0.16
1060	0.16
1061	0.22
1062	0.25
1063	0.25
1064	0.23
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.2
1068	0.19
1069	0.12
1070	0.11
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.13
1078	0.15
1079	0.12
1080	0.12
1081	0.13
1082	0.14
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.09
1087	0.08
1088	0.09
1089	0.1
1090	0.15
1091	0.16
1092	0.16
1093	0.18
1094	0.2
1095	0.22
1096	0.23
1097	0.25
1098	0.23
1099	0.29
1100	0.3
1101	0.28
1102	0.28
1103	0.32
1104	0.3
1105	0.27
1106	0.24
1107	0.18
1108	0.18
1109	0.2
1110	0.18
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.15
1115	0.14
1116	0.12
1117	0.1
1118	0.1
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.07
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.08
1126	0.07
1127	0.07
1128	0.06
1129	0.08
1130	0.09
1131	0.09
1132	0.14
1133	0.14
1134	0.17
1135	0.18
1136	0.21
1137	0.19
1138	0.23
1139	0.26
1140	0.22
1141	0.23
1142	0.21
1143	0.2
1144	0.19
1145	0.22
1146	0.21
1147	0.18
1148	0.18
1149	0.17
1150	0.16
1151	0.16
1152	0.16
1153	0.13
1154	0.09
1155	0.08
1156	0.07
1157	0.08
1158	0.11
1159	0.13
1160	0.12
1161	0.14
1162	0.19
1163	0.21
1164	0.26
1165	0.27
1166	0.24
1167	0.24
1168	0.29
1169	0.28
1170	0.26
1171	0.25
1172	0.22
1173	0.27
1174	0.32
1175	0.36
1176	0.38
1177	0.36
1178	0.34
1179	0.38
1180	0.39
1181	0.41
1182	0.41
1183	0.46
1184	0.48
1185	0.57
1186	0.58
1187	0.59
1188	0.61
1189	0.54
1190	0.54
1191	0.45
1192	0.39
1193	0.3
1194	0.3
1195	0.26
1196	0.22
1197	0.19
1198	0.13
1199	0.14
1200	0.1
1201	0.1
1202	0.09
1203	0.07
1204	0.07
1205	0.07
1206	0.07
1207	0.09
1208	0.1
1209	0.1
1210	0.15
1211	0.2
1212	0.23
1213	0.24
1214	0.26
1215	0.27
1216	0.3
1217	0.39
1218	0.35
1219	0.34
1220	0.3
1221	0.32
1222	0.3
1223	0.26
1224	0.21
1225	0.13
1226	0.13
1227	0.12
1228	0.13
1229	0.12
1230	0.12
1231	0.14
1232	0.15
1233	0.14
1234	0.14
1235	0.14
1236	0.16
1237	0.15

A0A4R0RL52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer