Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R0RBC6

Protein Details
Accession A0A4R0RBC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28AAPTTGSTRKGKRKATSSPQNAPRKKANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-16RKGKRKAT
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences AAPTTGSTRKGKRKATSSPQNAPRKKANSVTNVDSDQKTEMTLITPEEASGSGLALPAVVVDESRHLVPATLTFSFEKAKQHLISADPRFEDIFDKMKCKPFEHLEQFDPFSTLASSILGQQISWKAARSIKHRFIRLFNPALPEKPDDYNMVDYFPTAKEVAEMDAGSLRTAGLSQRKAEYVLDLAARFADGRLSTEKLLEANDEDLYDMLIEVRGIGRWTVDMFAIFSLRRPDILPVGDLGVQRGVVRWFLALHSSDYKVAISPEKLPATEGQPVQTPTATPTQSQSSQSSASSQDPDVLPSLGGYTEESSIPPAPVATSGDGDGPSKAEATEADALPIPFTPSIDKTLTMKVTKTGQLVQPPAPLPVGMTIPMLKGRLDPKKKVKGAFLTPKEMEELTEVWRPYRSLGVYYMWALAEETNGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.84
3 0.85
4 0.84
5 0.85
6 0.86
7 0.88
8 0.85
9 0.81
10 0.8
11 0.74
12 0.72
13 0.69
14 0.68
15 0.66
16 0.67
17 0.66
18 0.61
19 0.59
20 0.57
21 0.5
22 0.43
23 0.35
24 0.29
25 0.24
26 0.2
27 0.17
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.05
44 0.04
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.07
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.14
57 0.16
58 0.15
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.2
63 0.22
64 0.24
65 0.23
66 0.29
67 0.27
68 0.29
69 0.3
70 0.32
71 0.38
72 0.37
73 0.38
74 0.32
75 0.33
76 0.31
77 0.29
78 0.27
79 0.21
80 0.25
81 0.23
82 0.26
83 0.29
84 0.37
85 0.39
86 0.38
87 0.42
88 0.4
89 0.49
90 0.54
91 0.54
92 0.5
93 0.51
94 0.51
95 0.45
96 0.39
97 0.29
98 0.21
99 0.16
100 0.12
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.15
114 0.19
115 0.25
116 0.29
117 0.37
118 0.45
119 0.5
120 0.55
121 0.55
122 0.56
123 0.57
124 0.58
125 0.52
126 0.45
127 0.44
128 0.4
129 0.38
130 0.36
131 0.32
132 0.28
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.22
137 0.24
138 0.22
139 0.2
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.09
161 0.12
162 0.14
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.17
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.07
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.12
252 0.13
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.23
260 0.21
261 0.18
262 0.2
263 0.21
264 0.21
265 0.19
266 0.17
267 0.14
268 0.19
269 0.19
270 0.16
271 0.18
272 0.22
273 0.24
274 0.27
275 0.26
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.2
282 0.2
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.15
289 0.13
290 0.1
291 0.11
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.11
321 0.15
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.14
329 0.1
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.18
334 0.19
335 0.2
336 0.21
337 0.27
338 0.31
339 0.3
340 0.29
341 0.28
342 0.32
343 0.34
344 0.34
345 0.33
346 0.33
347 0.38
348 0.41
349 0.4
350 0.4
351 0.37
352 0.35
353 0.31
354 0.26
355 0.2
356 0.18
357 0.17
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.17
366 0.25
367 0.34
368 0.41
369 0.5
370 0.58
371 0.68
372 0.74
373 0.74
374 0.74
375 0.72
376 0.75
377 0.76
378 0.71
379 0.69
380 0.64
381 0.6
382 0.54
383 0.46
384 0.36
385 0.28
386 0.24
387 0.2
388 0.24
389 0.24
390 0.22
391 0.25
392 0.24
393 0.23
394 0.28
395 0.26
396 0.23
397 0.26
398 0.27
399 0.28
400 0.28
401 0.28
402 0.21
403 0.2
404 0.18
405 0.15