Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R0RKC2

Protein Details
Accession A0A4R0RKC2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-189STDFKLPSKRDRRTSRSRGKMIRKRRALLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-187SKRDRRTSRSRGKMIRKRRA
Subcellular Location(s) extr 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008397  Alginate_lyase_dom  
IPR008929  Chondroitin_lyas  
Gene Ontology GO:0042597  C:periplasmic space  
GO:0016829  F:lyase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05426  Alginate_lyase  
Amino Acid Sequences MPFRALTAFILVLQAATWGLAADPNDWVNVNYVVKAAGSGSTGTTSSARQTIGQKADSTAKDGPYTITSTKIKPPSGDIHDYLSWAPYHWPDCNWCSKGSNHFANPNSTHDNPADGGGDDLPGDGSDDDNGNGDDYYDESIGDTPGSVEDIVDGILRVGNSTDFKLPSKRDRRTSRSRGKMIRKRRALLERSAACELPVIRRDDSLVPNVPVTPPLLPTTALPSLPTPLPDVPVAPSLPTSPPKPGNPVAGTTTRKGVAGTQAPAEAHAKTSQGKVACTPSPTKSLAPSATWTTCPYVVKDGKVNPDVRDLKGPSILQNMPESLLFNTITYALTKTQAHSQTAAKFIDTFFLAPATLMHPNMNFGQLVRGPGKDHQMGTFTGILDFRALVKVVNSAQILKAVKSSDWTPAREQGLTTWMKAYVSWLQTSSIGKETAGKANNHFTFYVNQLAAAQLFLGDTKGATGTLNGYFKKQFLDQIAASGEQPFEAVRTRPYHYRAFNLEAMITNAKLGDQLGVNFWTAKSKYGATIQTALDYAIAQNPGSEDVSDIVPHVAAVAAAYGDSKGKYKSFLQNHDSKYQSESWFFYDQTAALPNSPAAGGKGKRDGTTVPDNSTSSSPDASDPNTDGLTPFSHTPFSCPEVFNYSPKVELEDGLFVTCDELKPLYEIAADPAIVGSEYGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.06
3 0.06
4 0.05
5 0.04
6 0.05
7 0.07
8 0.08
9 0.09
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.17
36 0.2
37 0.25
38 0.32
39 0.36
40 0.38
41 0.36
42 0.36
43 0.43
44 0.4
45 0.4
46 0.36
47 0.33
48 0.31
49 0.31
50 0.3
51 0.24
52 0.28
53 0.24
54 0.27
55 0.28
56 0.3
57 0.38
58 0.43
59 0.43
60 0.4
61 0.44
62 0.46
63 0.5
64 0.52
65 0.45
66 0.44
67 0.42
68 0.42
69 0.37
70 0.3
71 0.23
72 0.18
73 0.19
74 0.18
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.27
79 0.32
80 0.4
81 0.4
82 0.38
83 0.37
84 0.4
85 0.46
86 0.49
87 0.52
88 0.47
89 0.52
90 0.53
91 0.57
92 0.54
93 0.51
94 0.5
95 0.43
96 0.42
97 0.35
98 0.35
99 0.28
100 0.27
101 0.22
102 0.15
103 0.15
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.11
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.24
153 0.29
154 0.38
155 0.47
156 0.53
157 0.6
158 0.68
159 0.74
160 0.79
161 0.85
162 0.85
163 0.85
164 0.86
165 0.86
166 0.87
167 0.88
168 0.88
169 0.87
170 0.85
171 0.79
172 0.78
173 0.78
174 0.72
175 0.69
176 0.67
177 0.6
178 0.56
179 0.54
180 0.45
181 0.35
182 0.33
183 0.27
184 0.23
185 0.24
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.24
190 0.26
191 0.28
192 0.28
193 0.26
194 0.23
195 0.23
196 0.23
197 0.21
198 0.17
199 0.16
200 0.12
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.2
229 0.24
230 0.25
231 0.31
232 0.32
233 0.35
234 0.33
235 0.34
236 0.32
237 0.34
238 0.35
239 0.3
240 0.3
241 0.24
242 0.23
243 0.21
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.17
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.19
264 0.2
265 0.21
266 0.23
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.25
271 0.23
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.22
276 0.21
277 0.2
278 0.21
279 0.2
280 0.18
281 0.19
282 0.18
283 0.17
284 0.21
285 0.22
286 0.22
287 0.25
288 0.26
289 0.29
290 0.33
291 0.34
292 0.28
293 0.35
294 0.36
295 0.33
296 0.35
297 0.31
298 0.27
299 0.28
300 0.27
301 0.2
302 0.23
303 0.22
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.16
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.22
329 0.25
330 0.24
331 0.18
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.12
336 0.1
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.09
351 0.07
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.19
360 0.19
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.17
367 0.13
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.08
379 0.08
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.15
385 0.15
386 0.13
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.14
391 0.15
392 0.19
393 0.22
394 0.24
395 0.24
396 0.29
397 0.31
398 0.29
399 0.28
400 0.2
401 0.24
402 0.22
403 0.2
404 0.16
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.16
409 0.15
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.18
415 0.19
416 0.18
417 0.15
418 0.14
419 0.13
420 0.16
421 0.17
422 0.21
423 0.24
424 0.24
425 0.24
426 0.32
427 0.34
428 0.32
429 0.3
430 0.26
431 0.23
432 0.24
433 0.26
434 0.18
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.13
439 0.11
440 0.08
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.07
453 0.11
454 0.14
455 0.14
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.2
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.24
464 0.21
465 0.22
466 0.23
467 0.21
468 0.2
469 0.17
470 0.14
471 0.09
472 0.09
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.13
478 0.17
479 0.2
480 0.26
481 0.31
482 0.37
483 0.37
484 0.42
485 0.42
486 0.44
487 0.42
488 0.38
489 0.34
490 0.27
491 0.27
492 0.23
493 0.18
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.15
508 0.15
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.2
513 0.25
514 0.27
515 0.24
516 0.28
517 0.26
518 0.25
519 0.24
520 0.22
521 0.16
522 0.14
523 0.11
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.1
529 0.11
530 0.12
531 0.11
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.07
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.03
546 0.03
547 0.04
548 0.04
549 0.06
550 0.07
551 0.09
552 0.12
553 0.13
554 0.17
555 0.23
556 0.32
557 0.4
558 0.48
559 0.53
560 0.59
561 0.63
562 0.67
563 0.62
564 0.54
565 0.5
566 0.48
567 0.44
568 0.38
569 0.36
570 0.33
571 0.34
572 0.33
573 0.3
574 0.24
575 0.21
576 0.2
577 0.21
578 0.17
579 0.15
580 0.16
581 0.14
582 0.14
583 0.14
584 0.12
585 0.11
586 0.18
587 0.19
588 0.23
589 0.31
590 0.32
591 0.33
592 0.35
593 0.34
594 0.33
595 0.41
596 0.4
597 0.36
598 0.37
599 0.37
600 0.37
601 0.37
602 0.33
603 0.25
604 0.23
605 0.2
606 0.19
607 0.21
608 0.21
609 0.23
610 0.22
611 0.22
612 0.21
613 0.2
614 0.18
615 0.17
616 0.17
617 0.16
618 0.17
619 0.16
620 0.2
621 0.2
622 0.23
623 0.26
624 0.29
625 0.3
626 0.29
627 0.3
628 0.34
629 0.37
630 0.37
631 0.38
632 0.35
633 0.33
634 0.33
635 0.34
636 0.27
637 0.26
638 0.24
639 0.22
640 0.21
641 0.19
642 0.19
643 0.14
644 0.15
645 0.15
646 0.13
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.14
651 0.15
652 0.14
653 0.14
654 0.14
655 0.15
656 0.16
657 0.15
658 0.13
659 0.13
660 0.12
661 0.11