Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R0RMP0

Protein Details
Accession A0A4R0RMP0    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-174EKERDKEKERERERERERERBasic
530-555ERSKKDTRMNHRDRERHRHHNNPSESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-198KKERKSFWDRSKDKALEKERDKEKERERERERERERERERVERPREDEKKERHLHGLRSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd21383  GAT_GGA_Tom1-like  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MKRLFGRDKPKIVKTPSAHSDVASEDAHYFDDSRHYQPAQQPYDRVHSGDRVHALAHSSSEEHWDVVNSQEGHSPPIPSSNSRKKPPGSSSPAAAVGILRALDPHHSQMAPTQPAASREYSERDTFDDILQAQRPLMEKKERKSFWDRSKDKALEKERDKEKERERERERERERERERVERPREDEKKERHLHGLRSRDKDSQKREEDAQAELTRMIGYLTATSSEDWSLVLEVCERASANEASARETVKALRREFKYAEPTAQLAAARLWAVLLQNSSSTFMTQSTSRKFLETLEEVILSSRTSPVVKERLLQVLAAAAYASSSRHNRQEKDPFKSLWRKLKLPNQPDEGIPLDPEDAMLNPPAAAVPQALTPEPPRTTSQRPPNSRHKSSSRIIPPEEDMRRLFEECKYANGNAALLSDALLHAKPEDLKHKAIIKEFYARCRASQELVYAQIPWASANAERSRVAALTNPNARRKQKASPPDSPQETDETMEEQLLGALLSANEQLAEALKMYEDLERIKLERDVEERSKKDTRMNHRDRERHRHHNNPSESSIPQLPAGAHSHSHRHPPPPTSRSPSPSPSPPPSVTVTPYTPNHSHPLPPIPPNNTNAYQISAQQQLAALALQNQAAQVPNNLAPPPPAPHGPRRPVPSQRSGGSRSPSPTDRSLGNVASNAPGEWDRGSYRHSVHSVHTPRGFAYSNILEMDDDDGSAGTGYGEEEEGVEYDPAPHKPSAKALGKRKVVEPEEPDNQFDPDDIFYENNGDSRRHTPSLDDLDSDDDGGPGSRAKRQPVQYVYDAAAERMRERIKEARKNLAATTGATLVGGVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.68
4 0.66
5 0.58
6 0.49
7 0.45
8 0.37
9 0.36
10 0.27
11 0.22
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.11
18 0.19
19 0.21
20 0.24
21 0.29
22 0.3
23 0.35
24 0.42
25 0.51
26 0.51
27 0.52
28 0.52
29 0.51
30 0.58
31 0.53
32 0.48
33 0.42
34 0.4
35 0.39
36 0.41
37 0.39
38 0.32
39 0.31
40 0.29
41 0.29
42 0.23
43 0.22
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.2
48 0.2
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.17
54 0.23
55 0.19
56 0.19
57 0.23
58 0.23
59 0.27
60 0.28
61 0.28
62 0.21
63 0.27
64 0.29
65 0.3
66 0.4
67 0.46
68 0.53
69 0.59
70 0.67
71 0.65
72 0.71
73 0.74
74 0.74
75 0.72
76 0.67
77 0.63
78 0.58
79 0.54
80 0.45
81 0.37
82 0.26
83 0.18
84 0.15
85 0.12
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.11
90 0.14
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.24
96 0.31
97 0.3
98 0.28
99 0.28
100 0.27
101 0.3
102 0.33
103 0.3
104 0.24
105 0.24
106 0.29
107 0.31
108 0.31
109 0.29
110 0.29
111 0.31
112 0.3
113 0.27
114 0.25
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.22
119 0.18
120 0.19
121 0.22
122 0.22
123 0.27
124 0.34
125 0.38
126 0.45
127 0.56
128 0.55
129 0.6
130 0.66
131 0.69
132 0.69
133 0.74
134 0.69
135 0.66
136 0.74
137 0.73
138 0.69
139 0.69
140 0.67
141 0.65
142 0.68
143 0.71
144 0.69
145 0.72
146 0.72
147 0.71
148 0.72
149 0.73
150 0.75
151 0.76
152 0.75
153 0.77
154 0.79
155 0.81
156 0.78
157 0.78
158 0.77
159 0.77
160 0.75
161 0.75
162 0.72
163 0.71
164 0.72
165 0.72
166 0.73
167 0.71
168 0.71
169 0.71
170 0.73
171 0.71
172 0.73
173 0.7
174 0.72
175 0.71
176 0.68
177 0.67
178 0.66
179 0.68
180 0.66
181 0.69
182 0.66
183 0.66
184 0.67
185 0.65
186 0.68
187 0.68
188 0.68
189 0.68
190 0.65
191 0.62
192 0.62
193 0.6
194 0.53
195 0.46
196 0.44
197 0.35
198 0.3
199 0.26
200 0.23
201 0.16
202 0.15
203 0.12
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.16
231 0.17
232 0.18
233 0.15
234 0.16
235 0.19
236 0.23
237 0.3
238 0.3
239 0.37
240 0.39
241 0.43
242 0.45
243 0.46
244 0.47
245 0.42
246 0.41
247 0.35
248 0.33
249 0.28
250 0.27
251 0.21
252 0.14
253 0.12
254 0.1
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.13
272 0.18
273 0.2
274 0.24
275 0.24
276 0.24
277 0.24
278 0.24
279 0.27
280 0.23
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.17
285 0.17
286 0.16
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.13
294 0.18
295 0.19
296 0.2
297 0.22
298 0.25
299 0.25
300 0.24
301 0.18
302 0.14
303 0.14
304 0.11
305 0.09
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.11
312 0.14
313 0.22
314 0.28
315 0.31
316 0.39
317 0.5
318 0.54
319 0.58
320 0.6
321 0.53
322 0.56
323 0.62
324 0.61
325 0.6
326 0.57
327 0.55
328 0.58
329 0.65
330 0.66
331 0.64
332 0.63
333 0.58
334 0.54
335 0.49
336 0.45
337 0.38
338 0.29
339 0.22
340 0.16
341 0.11
342 0.09
343 0.1
344 0.07
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.09
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.21
366 0.28
367 0.35
368 0.44
369 0.49
370 0.55
371 0.59
372 0.68
373 0.72
374 0.7
375 0.68
376 0.63
377 0.6
378 0.57
379 0.59
380 0.55
381 0.51
382 0.47
383 0.42
384 0.39
385 0.4
386 0.39
387 0.32
388 0.26
389 0.24
390 0.24
391 0.24
392 0.23
393 0.17
394 0.2
395 0.17
396 0.2
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.11
403 0.11
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.06
415 0.08
416 0.14
417 0.16
418 0.17
419 0.2
420 0.25
421 0.27
422 0.29
423 0.29
424 0.26
425 0.32
426 0.32
427 0.33
428 0.35
429 0.33
430 0.3
431 0.31
432 0.3
433 0.23
434 0.23
435 0.21
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.14
440 0.13
441 0.12
442 0.1
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.11
448 0.12
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.18
458 0.25
459 0.29
460 0.34
461 0.41
462 0.43
463 0.45
464 0.46
465 0.48
466 0.5
467 0.56
468 0.57
469 0.59
470 0.63
471 0.64
472 0.63
473 0.56
474 0.49
475 0.42
476 0.36
477 0.28
478 0.22
479 0.17
480 0.14
481 0.12
482 0.11
483 0.07
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.16
513 0.17
514 0.22
515 0.28
516 0.35
517 0.35
518 0.39
519 0.43
520 0.42
521 0.45
522 0.48
523 0.51
524 0.55
525 0.62
526 0.65
527 0.7
528 0.77
529 0.79
530 0.82
531 0.8
532 0.79
533 0.79
534 0.8
535 0.8
536 0.81
537 0.78
538 0.72
539 0.66
540 0.58
541 0.5
542 0.43
543 0.36
544 0.27
545 0.21
546 0.17
547 0.15
548 0.14
549 0.16
550 0.14
551 0.14
552 0.15
553 0.21
554 0.22
555 0.3
556 0.31
557 0.36
558 0.39
559 0.45
560 0.52
561 0.53
562 0.58
563 0.58
564 0.6
565 0.59
566 0.59
567 0.58
568 0.53
569 0.54
570 0.54
571 0.51
572 0.52
573 0.47
574 0.45
575 0.44
576 0.4
577 0.36
578 0.33
579 0.3
580 0.29
581 0.29
582 0.32
583 0.31
584 0.31
585 0.33
586 0.3
587 0.31
588 0.29
589 0.35
590 0.33
591 0.37
592 0.4
593 0.43
594 0.44
595 0.45
596 0.47
597 0.41
598 0.4
599 0.35
600 0.32
601 0.27
602 0.26
603 0.26
604 0.24
605 0.22
606 0.19
607 0.18
608 0.15
609 0.15
610 0.12
611 0.09
612 0.07
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.09
619 0.1
620 0.09
621 0.11
622 0.12
623 0.14
624 0.15
625 0.14
626 0.15
627 0.17
628 0.2
629 0.2
630 0.24
631 0.26
632 0.36
633 0.45
634 0.5
635 0.54
636 0.57
637 0.62
638 0.66
639 0.69
640 0.68
641 0.64
642 0.61
643 0.6
644 0.6
645 0.58
646 0.52
647 0.5
648 0.44
649 0.44
650 0.44
651 0.43
652 0.4
653 0.37
654 0.33
655 0.34
656 0.34
657 0.3
658 0.27
659 0.24
660 0.21
661 0.21
662 0.2
663 0.15
664 0.14
665 0.13
666 0.13
667 0.12
668 0.14
669 0.14
670 0.15
671 0.18
672 0.2
673 0.22
674 0.26
675 0.28
676 0.28
677 0.29
678 0.38
679 0.41
680 0.44
681 0.44
682 0.39
683 0.37
684 0.39
685 0.37
686 0.27
687 0.29
688 0.23
689 0.22
690 0.21
691 0.21
692 0.17
693 0.16
694 0.18
695 0.11
696 0.1
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.07
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.11
715 0.14
716 0.15
717 0.19
718 0.2
719 0.22
720 0.24
721 0.31
722 0.37
723 0.43
724 0.5
725 0.57
726 0.64
727 0.68
728 0.69
729 0.68
730 0.68
731 0.63
732 0.61
733 0.58
734 0.56
735 0.56
736 0.55
737 0.53
738 0.45
739 0.42
740 0.35
741 0.29
742 0.23
743 0.16
744 0.16
745 0.14
746 0.13
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.17
751 0.18
752 0.18
753 0.21
754 0.25
755 0.32
756 0.31
757 0.32
758 0.31
759 0.38
760 0.45
761 0.43
762 0.39
763 0.33
764 0.34
765 0.34
766 0.32
767 0.23
768 0.14
769 0.13
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.14
774 0.21
775 0.25
776 0.32
777 0.4
778 0.46
779 0.55
780 0.58
781 0.62
782 0.57
783 0.57
784 0.51
785 0.48
786 0.42
787 0.34
788 0.31
789 0.25
790 0.23
791 0.27
792 0.28
793 0.24
794 0.29
795 0.38
796 0.45
797 0.54
798 0.59
799 0.63
800 0.65
801 0.67
802 0.62
803 0.59
804 0.51
805 0.42
806 0.39
807 0.29
808 0.24
809 0.2