FuNGI

J8LQC1

Protein Details

Accession

J8LQC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-136	TEPTQTSTHRNKKSRIHDDN	Hydrophilic
406-427	QDLSRIKYKKRVSQRLLWFDKF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 11.833, mito 3, cyto_mito 2.833, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR042238 Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0006283 P:transcription-coupled nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MDPYLEYRLGNISFNEFHKKTIQNEFERILEDPSLNLKSYRFSKRSGHNPSGGAPLNVSVTCLDIDNTGQVLLGGADDGSLSIWGLDESSYQNDEGAQELINKRLNYIKRQPRQSDTEPTQTSTHRNKKSRIHDDNAARLVHSFQTQKNKYRMYRQSQTVIPSSGPHMLNVSNGRIDTNNSTLGTDTEGSISHHRYGITTLKWYRTDNGMFFTGSNDKTIKIWDTNRFEAVQDISLGYTINQIDNNIANDSSLLIVASEDYYPRLIDLRTMNSGITTLGMGNKTRMQSEILCCKFNPVREQILACGDMEGGIKLWDLRMRNKLYSEMKRKKKGLNNISNDNGNGIDVYFSSNESKAHLRCCSDIVWNDEGSELCSIGADGKLILWRPFTEALQLDGIASYRQLGSQDLSRIKYKKRVSQRLLWFDKFLLCTTDNGEVEIYNTEEEKLWNKLEYPMGHNQVKKNLASQCQFSSIALQRNMMNSIGLKLFLGTNSNIIGDGGSIFECS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.37
3	0.32
4	0.34
5	0.39
6	0.43
7	0.44
8	0.51
9	0.57
10	0.53
11	0.59
12	0.58
13	0.52
14	0.49
15	0.45
16	0.37
17	0.3
18	0.23
19	0.19
20	0.22
21	0.23
22	0.22
23	0.22
24	0.2
25	0.24
26	0.32
27	0.41
28	0.38
29	0.41
30	0.49
31	0.57
32	0.66
33	0.7
34	0.69
35	0.64
36	0.63
37	0.61
38	0.6
39	0.52
40	0.42
41	0.33
42	0.27
43	0.24
44	0.21
45	0.2
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.09
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.09
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.06
60	0.06
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.03
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.06
75	0.08
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.11
84	0.09
85	0.14
86	0.15
87	0.19
88	0.24
89	0.24
90	0.24
91	0.3
92	0.34
93	0.38
94	0.47
95	0.53
96	0.57
97	0.67
98	0.72
99	0.71
100	0.75
101	0.72
102	0.71
103	0.66
104	0.67
105	0.59
106	0.56
107	0.52
108	0.46
109	0.48
110	0.49
111	0.53
112	0.53
113	0.58
114	0.63
115	0.7
116	0.78
117	0.81
118	0.78
119	0.74
120	0.73
121	0.73
122	0.72
123	0.67
124	0.56
125	0.45
126	0.37
127	0.33
128	0.26
129	0.24
130	0.2
131	0.21
132	0.31
133	0.37
134	0.44
135	0.5
136	0.56
137	0.57
138	0.64
139	0.68
140	0.67
141	0.69
142	0.66
143	0.64
144	0.6
145	0.59
146	0.51
147	0.43
148	0.34
149	0.27
150	0.24
151	0.25
152	0.22
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.19
157	0.2
158	0.19
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.14
172	0.12
173	0.1
174	0.08
175	0.08
176	0.1
177	0.13
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.14
182	0.14
183	0.17
184	0.2
185	0.18
186	0.23
187	0.24
188	0.27
189	0.3
190	0.3
191	0.29
192	0.29
193	0.31
194	0.25
195	0.25
196	0.22
197	0.2
198	0.19
199	0.19
200	0.18
201	0.15
202	0.16
203	0.14
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.15
208	0.15
209	0.2
210	0.27
211	0.32
212	0.33
213	0.34
214	0.33
215	0.31
216	0.28
217	0.24
218	0.16
219	0.11
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.05
225	0.07
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.09
254	0.11
255	0.13
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.1
262	0.08
263	0.06
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.09
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.14
274	0.16
275	0.2
276	0.29
277	0.28
278	0.28
279	0.28
280	0.32
281	0.32
282	0.32
283	0.32
284	0.27
285	0.29
286	0.29
287	0.3
288	0.26
289	0.26
290	0.23
291	0.18
292	0.14
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.07
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.08
303	0.1
304	0.15
305	0.23
306	0.26
307	0.28
308	0.3
309	0.36
310	0.41
311	0.49
312	0.55
313	0.58
314	0.64
315	0.7
316	0.74
317	0.76
318	0.75
319	0.76
320	0.76
321	0.76
322	0.73
323	0.71
324	0.69
325	0.61
326	0.53
327	0.43
328	0.32
329	0.22
330	0.15
331	0.09
332	0.06
333	0.05
334	0.07
335	0.06
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.13
341	0.18
342	0.19
343	0.23
344	0.25
345	0.26
346	0.26
347	0.28
348	0.27
349	0.27
350	0.29
351	0.29
352	0.28
353	0.26
354	0.25
355	0.24
356	0.22
357	0.18
358	0.15
359	0.1
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.08
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.12
373	0.16
374	0.18
375	0.18
376	0.2
377	0.19
378	0.2
379	0.19
380	0.19
381	0.15
382	0.13
383	0.14
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.09
391	0.1
392	0.14
393	0.21
394	0.25
395	0.28
396	0.34
397	0.38
398	0.42
399	0.49
400	0.53
401	0.55
402	0.62
403	0.7
404	0.7
405	0.75
406	0.8
407	0.82
408	0.82
409	0.75
410	0.66
411	0.56
412	0.54
413	0.45
414	0.36
415	0.3
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.28
420	0.24
421	0.23
422	0.22
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.16
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.15
433	0.18
434	0.19
435	0.19
436	0.2
437	0.24
438	0.29
439	0.31
440	0.33
441	0.38
442	0.44
443	0.48
444	0.51
445	0.52
446	0.53
447	0.55
448	0.5
449	0.48
450	0.48
451	0.5
452	0.5
453	0.5
454	0.45
455	0.44
456	0.44
457	0.37
458	0.38
459	0.36
460	0.4
461	0.37
462	0.37
463	0.34
464	0.36
465	0.37
466	0.3
467	0.25
468	0.18
469	0.2
470	0.18
471	0.17
472	0.14
473	0.13
474	0.14
475	0.13
476	0.16
477	0.13
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.14
482	0.13
483	0.12
484	0.09
485	0.09
486	0.08

J8LQC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer