Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R0R4X1

Protein Details
Accession A0A4R0R4X1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-47TPSAPTEAKPPAKKRKLPNLSSTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-38KKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRGLPLVQYGSDDDDDDDTTGDTPSAPTEAKPPAKKRKLPNLSSTFVPAGPVDNPALHQGRVRTAPHVEGQYAAYVYVPVRLELERKSKLAKLLRRTLLRAREIAPTLHPIGIPDTKDGSEDGIELHISLSRPIYLRAHQREELKRAVRTIAKSSSPFDASFATFAELENDERTRTFVTVEIGAGHAELATLTNALTPTLHSIRQKTFYDEPRFHASIAWALLAPCEDRPGSSDTPSDSGIPASLDSVVAQSVCLGSDQFARIDRLPAEVISTLKSEFGAILVEQGIAVFHVDTICIRIGKDVSQWKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.14
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.16
17 0.24
18 0.33
19 0.41
20 0.5
21 0.59
22 0.69
23 0.76
24 0.81
25 0.83
26 0.85
27 0.83
28 0.84
29 0.8
30 0.73
31 0.66
32 0.6
33 0.51
34 0.4
35 0.34
36 0.24
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.18
44 0.2
45 0.18
46 0.2
47 0.2
48 0.23
49 0.28
50 0.28
51 0.27
52 0.27
53 0.29
54 0.3
55 0.31
56 0.26
57 0.22
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.14
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.19
72 0.26
73 0.25
74 0.26
75 0.29
76 0.3
77 0.37
78 0.43
79 0.45
80 0.46
81 0.53
82 0.58
83 0.58
84 0.6
85 0.6
86 0.59
87 0.55
88 0.49
89 0.42
90 0.39
91 0.38
92 0.34
93 0.28
94 0.24
95 0.23
96 0.21
97 0.19
98 0.14
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.12
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.12
123 0.15
124 0.24
125 0.28
126 0.33
127 0.35
128 0.42
129 0.45
130 0.47
131 0.5
132 0.44
133 0.4
134 0.36
135 0.36
136 0.32
137 0.29
138 0.29
139 0.26
140 0.25
141 0.25
142 0.26
143 0.24
144 0.23
145 0.21
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.1
187 0.12
188 0.15
189 0.17
190 0.21
191 0.25
192 0.31
193 0.31
194 0.33
195 0.38
196 0.44
197 0.5
198 0.49
199 0.5
200 0.51
201 0.51
202 0.45
203 0.39
204 0.3
205 0.25
206 0.23
207 0.18
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.07
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.16
219 0.18
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.21
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.18
250 0.18
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.16
260 0.17
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.09
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.15
287 0.17
288 0.19
289 0.27
290 0.33