FuNGI

A0A4R0RXU3

Protein Details

Accession

A0A4R0RXU3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-142	SSSSGKKKVAAKKAKAKPTS	Hydrophilic
226-252	SEDEKKVKPKSKVKVKKQEKAKGKTKD	Basic
488-515	IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
127-140	GKKKVAAKKAKAKP
230-251	KKVKPKSKVKVKKQEKAKGKTK
279-304	RKAKTKNTMKKADAKAKAKDAKKEAD
495-505	FRKEKNKKKRG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006594 LisH IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH

Amino Acid Sequences

MSDVEMADATADGHLATTYTLIYEFLKKQSHSKAAEALKKEAKGVVVLKNGAKVEGPALEEIVKHWKSNKTNASSSNLSKKAVKKSKSSKSSDSSSDSDSSSDSSSSSDSDSSSSSSDSSSSSSSSGKKKVAAKKAKAKPTSSVPQPAKLDSPSRSSQTLSSQAPDSSSSDDSSSDSDSDSESTPSPAKQAKPVAEPAKAKKKVEASSDSSSEDSSSEESDSDSDSEDEKKVKPKSKVKVKKQEKAKGKTKDEGSSDSSDSSESDSGSSEEVSSDAEDRKAKTKNTMKKADAKAKAKDAKKEADAKVATGKAAKEDSSESDDSESDSSSESEDEKPKAKTIEKSKPKKVESSSSDDSDSDSGSEADTESDEDKPKPKAASAPAPVEQVKVTKKRRIDESGLAKTTSSVSEARRDDNSTSTPASGSGSQTPTQVDGKGKSKGPRKVNTPFQRVKSDTVTYHDERLKDNTFESRGVDNNDYGARASQDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMHTHSIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.05
4	0.05
5	0.05
6	0.06
7	0.06
8	0.07
9	0.1
10	0.16
11	0.19
12	0.24
13	0.3
14	0.31
15	0.39
16	0.47
17	0.53
18	0.51
19	0.51
20	0.54
21	0.57
22	0.63
23	0.59
24	0.58
25	0.55
26	0.52
27	0.5
28	0.43
29	0.36
30	0.33
31	0.34
32	0.32
33	0.31
34	0.34
35	0.34
36	0.37
37	0.36
38	0.32
39	0.27
40	0.22
41	0.19
42	0.18
43	0.18
44	0.14
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.15
49	0.23
50	0.21
51	0.21
52	0.27
53	0.34
54	0.39
55	0.49
56	0.56
57	0.54
58	0.59
59	0.62
60	0.63
61	0.6
62	0.6
63	0.6
64	0.54
65	0.49
66	0.49
67	0.52
68	0.56
69	0.6
70	0.59
71	0.6
72	0.67
73	0.76
74	0.79
75	0.79
76	0.76
77	0.73
78	0.73
79	0.68
80	0.63
81	0.55
82	0.49
83	0.44
84	0.37
85	0.31
86	0.26
87	0.22
88	0.18
89	0.15
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.12
107	0.11
108	0.11
109	0.12
110	0.15
111	0.2
112	0.26
113	0.3
114	0.31
115	0.36
116	0.44
117	0.51
118	0.58
119	0.63
120	0.67
121	0.72
122	0.78
123	0.82
124	0.79
125	0.73
126	0.67
127	0.65
128	0.64
129	0.59
130	0.6
131	0.52
132	0.54
133	0.53
134	0.5
135	0.44
136	0.39
137	0.38
138	0.31
139	0.35
140	0.31
141	0.32
142	0.31
143	0.3
144	0.29
145	0.29
146	0.33
147	0.28
148	0.27
149	0.26
150	0.24
151	0.24
152	0.23
153	0.2
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.14
158	0.15
159	0.15
160	0.14
161	0.14
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.16
174	0.19
175	0.19
176	0.24
177	0.29
178	0.3
179	0.32
180	0.4
181	0.39
182	0.41
183	0.44
184	0.45
185	0.51
186	0.52
187	0.49
188	0.46
189	0.49
190	0.48
191	0.49
192	0.48
193	0.43
194	0.43
195	0.44
196	0.4
197	0.34
198	0.29
199	0.24
200	0.18
201	0.12
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.13
216	0.14
217	0.21
218	0.27
219	0.33
220	0.41
221	0.48
222	0.56
223	0.66
224	0.74
225	0.78
226	0.83
227	0.85
228	0.84
229	0.85
230	0.85
231	0.83
232	0.82
233	0.81
234	0.79
235	0.74
236	0.72
237	0.66
238	0.61
239	0.54
240	0.48
241	0.43
242	0.36
243	0.32
244	0.26
245	0.23
246	0.18
247	0.16
248	0.13
249	0.1
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.07
263	0.09
264	0.1
265	0.12
266	0.17
267	0.21
268	0.21
269	0.29
270	0.38
271	0.45
272	0.52
273	0.59
274	0.57
275	0.62
276	0.69
277	0.69
278	0.68
279	0.64
280	0.59
281	0.6
282	0.64
283	0.58
284	0.57
285	0.52
286	0.48
287	0.47
288	0.52
289	0.44
290	0.45
291	0.41
292	0.36
293	0.35
294	0.31
295	0.27
296	0.21
297	0.2
298	0.14
299	0.15
300	0.14
301	0.12
302	0.13
303	0.14
304	0.18
305	0.18
306	0.16
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.15
311	0.13
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.12
319	0.16
320	0.18
321	0.21
322	0.22
323	0.24
324	0.27
325	0.3
326	0.34
327	0.4
328	0.49
329	0.55
330	0.63
331	0.7
332	0.75
333	0.73
334	0.73
335	0.68
336	0.67
337	0.62
338	0.62
339	0.57
340	0.5
341	0.48
342	0.4
343	0.37
344	0.28
345	0.22
346	0.14
347	0.11
348	0.09
349	0.07
350	0.08
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.1
357	0.13
358	0.14
359	0.18
360	0.2
361	0.24
362	0.24
363	0.24
364	0.28
365	0.32
366	0.39
367	0.4
368	0.43
369	0.4
370	0.43
371	0.41
372	0.36
373	0.31
374	0.27
375	0.29
376	0.34
377	0.39
378	0.42
379	0.47
380	0.52
381	0.59
382	0.61
383	0.6
384	0.59
385	0.62
386	0.64
387	0.6
388	0.55
389	0.47
390	0.4
391	0.35
392	0.27
393	0.2
394	0.15
395	0.16
396	0.24
397	0.26
398	0.28
399	0.3
400	0.32
401	0.32
402	0.32
403	0.33
404	0.28
405	0.28
406	0.25
407	0.22
408	0.2
409	0.2
410	0.18
411	0.18
412	0.2
413	0.22
414	0.22
415	0.23
416	0.23
417	0.24
418	0.24
419	0.24
420	0.23
421	0.25
422	0.29
423	0.34
424	0.38
425	0.43
426	0.51
427	0.56
428	0.61
429	0.64
430	0.67
431	0.71
432	0.77
433	0.79
434	0.8
435	0.79
436	0.75
437	0.77
438	0.72
439	0.67
440	0.62
441	0.57
442	0.49
443	0.46
444	0.48
445	0.42
446	0.46
447	0.44
448	0.4
449	0.38
450	0.42
451	0.42
452	0.36
453	0.36
454	0.36
455	0.35
456	0.35
457	0.35
458	0.32
459	0.31
460	0.35
461	0.35
462	0.28
463	0.28
464	0.28
465	0.25
466	0.23
467	0.2
468	0.17
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.17
473	0.17
474	0.18
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.2
479	0.18
480	0.22
481	0.25
482	0.32
483	0.42
484	0.53
485	0.62
486	0.69
487	0.78
488	0.82
489	0.89
490	0.91
491	0.91
492	0.91
493	0.88
494	0.88
495	0.86
496	0.8
497	0.7
498	0.61
499	0.55
500	0.47
501	0.43
502	0.33
503	0.25

A0A4R0RXU3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer