Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4R0RMA1

Protein Details
Accession A0A4R0RMA1    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
955-979SDEERERKPKKAPRKKAEANGSGDEBasic
981-1004AANGEPAKKKRKGGKLRRNGDPEGBasic
1016-1062GEDESKPAAKKRTKKRVVRDDEDEEVTATAPSRKKQFKSKEYISDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
959-998RERKPKKAPRKKAEANGSGDEGAANGEPAKKKRKGGKLRR
1022-1031PAAKKRTKKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MNGTRSPSPPAGRTLDIELTSQEVISIDLDNLELNPDDLLEVLKDSQSKVWVWTKLAAEYWNQGHLDIAEKLAQGAIDTLQANGSTSSLPPTYYLLANIQIARARGAPKLILQDARQDSQTKEKQRDLYYKEAIQFLNQGDRAASGEAISPVLAFLTRAIYQLENRQMDDALRSFDGVLAIKPTNAVALLGKARILYTRRQYAQALRLFQEVLRLSPSCKPDPRIGIGLCFWALDHKAQAKAAWERSLEVNPSEWAAQLLLGLEAMNASKSDSFAEEDRRAHYIQGTRLINLAFKTNQKNSAAANALCELLLRKGQYEKALKLAERTVQFADTLTVLTEGYLRSARVLQSTDAFTDAQKYYTLAKEGQPANVLASLGLAQIQLKLDEIPSAIHTLDTLLQSPNENRSAEASAMLASLRANPRPGVDHAQEKMRARELYDRVSRALRLPEDPHSQLNGHQHKALTSSGRNIAEDLEVHIEMARLWQGENSDKVERALTEALRISEAGGKPDPRLVNNLGALKHLDGKLDQARAMYETAITHASMMEGGKGEGMSTSILYNLARVYEDEGNETMAREAYDKLLTRHPEYVDAKLRQAKMFSDLNKSNEAHELIKEALNSQGSNLNLRAFYTHFLIQNNMATPAKDFVFRTLKEHDKYDLYSLCAAGWIQYHQARESRDASPKGVDERRRGFQRSAEFYEKALHLDPMCAVAAQGLAIVTAEDALGNLGGGIGPLAPDEPQKRIRNARDALDVFAKVREAMDDGSVYSNMGHCYYASDDYDRAIESYETASRKFYNDHNVPAFHLHPHDKAITYNIAMIEQKAAELLITVPAAKRTVKEMQKAIDQAQHAQRLFASLAADKSPVVPYNKELAEQRKKYGDGVLRRCDEQLAIQRQHEAGAKAKLDAARQKRQEEKDKQDALERERLASHREQAEKLAEERRLAREEAMVWTREVRAESDEERERKPKKAPRKKAEANGSGDEGAANGEPAKKKRKGGKLRRNGDPEGGDDDNENVFSGGEDESKPAAKKRTKKRVVRDDEDEEVTATAPSRKKQFKSKEYISDSDEEMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.36
4 0.34
5 0.28
6 0.26
7 0.23
8 0.2
9 0.15
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.17
34 0.19
35 0.2
36 0.25
37 0.31
38 0.33
39 0.34
40 0.39
41 0.38
42 0.38
43 0.39
44 0.34
45 0.3
46 0.32
47 0.31
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.24
52 0.22
53 0.23
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.17
83 0.19
84 0.21
85 0.21
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.2
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.27
97 0.3
98 0.3
99 0.29
100 0.37
101 0.39
102 0.4
103 0.39
104 0.36
105 0.34
106 0.41
107 0.48
108 0.48
109 0.5
110 0.55
111 0.6
112 0.65
113 0.72
114 0.67
115 0.68
116 0.65
117 0.63
118 0.59
119 0.55
120 0.48
121 0.4
122 0.38
123 0.31
124 0.33
125 0.28
126 0.25
127 0.21
128 0.22
129 0.21
130 0.18
131 0.16
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.14
148 0.17
149 0.24
150 0.32
151 0.3
152 0.3
153 0.31
154 0.29
155 0.28
156 0.3
157 0.24
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.16
182 0.18
183 0.23
184 0.29
185 0.37
186 0.39
187 0.42
188 0.46
189 0.48
190 0.54
191 0.52
192 0.48
193 0.41
194 0.4
195 0.37
196 0.34
197 0.33
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.19
202 0.2
203 0.25
204 0.31
205 0.31
206 0.35
207 0.38
208 0.41
209 0.46
210 0.48
211 0.49
212 0.44
213 0.4
214 0.36
215 0.34
216 0.27
217 0.21
218 0.17
219 0.13
220 0.14
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.24
228 0.29
229 0.31
230 0.31
231 0.28
232 0.28
233 0.3
234 0.32
235 0.29
236 0.23
237 0.21
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.14
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.13
262 0.2
263 0.23
264 0.24
265 0.26
266 0.28
267 0.27
268 0.26
269 0.28
270 0.26
271 0.25
272 0.32
273 0.31
274 0.28
275 0.3
276 0.29
277 0.26
278 0.22
279 0.22
280 0.17
281 0.21
282 0.28
283 0.29
284 0.35
285 0.34
286 0.35
287 0.32
288 0.35
289 0.34
290 0.27
291 0.26
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.12
297 0.09
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.23
304 0.27
305 0.27
306 0.31
307 0.34
308 0.33
309 0.33
310 0.33
311 0.31
312 0.27
313 0.29
314 0.23
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.16
319 0.11
320 0.1
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.12
342 0.16
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.18
350 0.15
351 0.16
352 0.23
353 0.24
354 0.24
355 0.23
356 0.21
357 0.2
358 0.19
359 0.17
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.12
389 0.15
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.17
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.12
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.06
402 0.05
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.14
409 0.17
410 0.2
411 0.21
412 0.22
413 0.26
414 0.26
415 0.3
416 0.34
417 0.32
418 0.32
419 0.3
420 0.28
421 0.25
422 0.31
423 0.3
424 0.33
425 0.35
426 0.35
427 0.32
428 0.33
429 0.32
430 0.26
431 0.27
432 0.22
433 0.2
434 0.21
435 0.25
436 0.29
437 0.3
438 0.28
439 0.26
440 0.25
441 0.25
442 0.32
443 0.32
444 0.28
445 0.28
446 0.27
447 0.26
448 0.28
449 0.26
450 0.2
451 0.16
452 0.18
453 0.21
454 0.21
455 0.21
456 0.19
457 0.18
458 0.15
459 0.14
460 0.12
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.11
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.15
479 0.15
480 0.13
481 0.14
482 0.14
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.09
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.18
497 0.19
498 0.15
499 0.18
500 0.18
501 0.19
502 0.21
503 0.23
504 0.19
505 0.19
506 0.18
507 0.15
508 0.16
509 0.14
510 0.12
511 0.09
512 0.13
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.13
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.1
521 0.07
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.08
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.09
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.1
565 0.11
566 0.13
567 0.17
568 0.19
569 0.21
570 0.23
571 0.23
572 0.27
573 0.28
574 0.31
575 0.34
576 0.33
577 0.34
578 0.36
579 0.37
580 0.31
581 0.3
582 0.25
583 0.22
584 0.25
585 0.24
586 0.26
587 0.28
588 0.29
589 0.32
590 0.32
591 0.28
592 0.27
593 0.26
594 0.2
595 0.17
596 0.16
597 0.14
598 0.14
599 0.13
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.12
606 0.11
607 0.13
608 0.13
609 0.12
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.1
614 0.11
615 0.12
616 0.14
617 0.15
618 0.15
619 0.17
620 0.16
621 0.17
622 0.16
623 0.16
624 0.14
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.12
629 0.13
630 0.12
631 0.15
632 0.22
633 0.22
634 0.25
635 0.29
636 0.35
637 0.35
638 0.37
639 0.33
640 0.29
641 0.3
642 0.3
643 0.26
644 0.21
645 0.2
646 0.18
647 0.15
648 0.13
649 0.12
650 0.09
651 0.08
652 0.07
653 0.1
654 0.12
655 0.13
656 0.15
657 0.18
658 0.19
659 0.22
660 0.25
661 0.26
662 0.31
663 0.32
664 0.31
665 0.3
666 0.3
667 0.32
668 0.35
669 0.36
670 0.37
671 0.4
672 0.46
673 0.49
674 0.52
675 0.47
676 0.46
677 0.48
678 0.48
679 0.49
680 0.47
681 0.43
682 0.4
683 0.41
684 0.36
685 0.3
686 0.24
687 0.19
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.11
692 0.11
693 0.09
694 0.08
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.03
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.03
706 0.02
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.03
711 0.02
712 0.02
713 0.02
714 0.02
715 0.02
716 0.02
717 0.02
718 0.03
719 0.03
720 0.04
721 0.08
722 0.1
723 0.15
724 0.24
725 0.28
726 0.34
727 0.43
728 0.48
729 0.54
730 0.55
731 0.54
732 0.53
733 0.5
734 0.47
735 0.41
736 0.35
737 0.27
738 0.24
739 0.21
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.08
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.09
748 0.1
749 0.1
750 0.09
751 0.08
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.07
757 0.09
758 0.11
759 0.14
760 0.13
761 0.14
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.14
766 0.12
767 0.1
768 0.09
769 0.08
770 0.1
771 0.14
772 0.15
773 0.15
774 0.17
775 0.17
776 0.19
777 0.21
778 0.23
779 0.29
780 0.31
781 0.37
782 0.38
783 0.38
784 0.38
785 0.38
786 0.35
787 0.27
788 0.28
789 0.25
790 0.22
791 0.25
792 0.25
793 0.22
794 0.22
795 0.23
796 0.21
797 0.18
798 0.19
799 0.16
800 0.16
801 0.15
802 0.15
803 0.13
804 0.11
805 0.1
806 0.08
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.07
815 0.09
816 0.11
817 0.12
818 0.12
819 0.16
820 0.25
821 0.31
822 0.37
823 0.4
824 0.41
825 0.46
826 0.47
827 0.45
828 0.4
829 0.35
830 0.36
831 0.37
832 0.41
833 0.35
834 0.33
835 0.3
836 0.28
837 0.27
838 0.22
839 0.17
840 0.13
841 0.14
842 0.14
843 0.15
844 0.12
845 0.14
846 0.15
847 0.18
848 0.19
849 0.19
850 0.22
851 0.28
852 0.28
853 0.29
854 0.32
855 0.38
856 0.46
857 0.47
858 0.49
859 0.47
860 0.48
861 0.47
862 0.49
863 0.47
864 0.46
865 0.51
866 0.55
867 0.52
868 0.52
869 0.51
870 0.45
871 0.37
872 0.34
873 0.35
874 0.36
875 0.37
876 0.37
877 0.39
878 0.38
879 0.4
880 0.37
881 0.3
882 0.26
883 0.28
884 0.28
885 0.26
886 0.29
887 0.28
888 0.3
889 0.37
890 0.4
891 0.44
892 0.5
893 0.56
894 0.62
895 0.68
896 0.74
897 0.75
898 0.76
899 0.76
900 0.76
901 0.7
902 0.69
903 0.67
904 0.62
905 0.6
906 0.52
907 0.43
908 0.41
909 0.41
910 0.38
911 0.37
912 0.38
913 0.36
914 0.39
915 0.39
916 0.39
917 0.42
918 0.4
919 0.39
920 0.39
921 0.34
922 0.33
923 0.36
924 0.38
925 0.36
926 0.34
927 0.32
928 0.28
929 0.28
930 0.31
931 0.31
932 0.27
933 0.24
934 0.25
935 0.25
936 0.25
937 0.24
938 0.19
939 0.18
940 0.21
941 0.23
942 0.29
943 0.36
944 0.37
945 0.41
946 0.49
947 0.49
948 0.51
949 0.59
950 0.61
951 0.64
952 0.72
953 0.78
954 0.8
955 0.87
956 0.9
957 0.9
958 0.91
959 0.88
960 0.83
961 0.75
962 0.67
963 0.56
964 0.46
965 0.36
966 0.25
967 0.19
968 0.12
969 0.09
970 0.08
971 0.13
972 0.18
973 0.25
974 0.35
975 0.39
976 0.48
977 0.57
978 0.67
979 0.73
980 0.79
981 0.84
982 0.85
983 0.88
984 0.9
985 0.87
986 0.8
987 0.75
988 0.66
989 0.57
990 0.53
991 0.45
992 0.36
993 0.29
994 0.27
995 0.22
996 0.2
997 0.17
998 0.1
999 0.09
1000 0.09
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.1
1004 0.1
1005 0.13
1006 0.15
1007 0.19
1008 0.21
1009 0.26
1010 0.35
1011 0.42
1012 0.51
1013 0.6
1014 0.69
1015 0.76
1016 0.83
1017 0.89
1018 0.9
1019 0.91
1020 0.9
1021 0.87
1022 0.82
1023 0.77
1024 0.7
1025 0.59
1026 0.49
1027 0.39
1028 0.31
1029 0.23
1030 0.18
1031 0.19
1032 0.2
1033 0.25
1034 0.34
1035 0.42
1036 0.49
1037 0.59
1038 0.68
1039 0.72
1040 0.78
1041 0.82
1042 0.83
1043 0.82
1044 0.8
1045 0.74
1046 0.66