Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XY55

Protein Details
Accession A0A4Q4XY55    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-377QALRDKDAAKRKRERRRENEKKQKEIVRBasic
467-486RKAEKDTKYRAKRARKEYDDBasic
584-609KNQPAVTKEPKKKTTKEKKKVVAAEEHydrophilic
721-755ALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-373DAAKRKRERRRENEKKQK
471-481KDTKYRAKRAR
591-603KEPKKKTTKEKKK
702-751KPQKPISKAAAAAIKEKMRALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKK
776-832KAARGANKARPQPKLVVARGLNRGIKGRPKGIKGRYKIVDARMKKELRAQKRIAKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MALQKKHAKGRLDKWLIQLNRKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAETMPNGSLIVGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRATIRSHLRTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDSFNQAELALQSLKLATEFLIEGGTFVTKVFRSTQYNQLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVARGFKAPKHLDPRFLDPKAVFADTKDAAPNNEAKVFNPEVKKRKRGGYEEGDYTQFTEELPASEFIETTDPIAVLSTYNKLSFEQPRNGDVALAALDKMHETTDEIRNCCADLKVLGRKDFKMLLKWRLKAREAFGLPTKNTKKPESEASEEVAEVESMDEELKIQEELQALRDKDAAKRKRERRRENEKKQKEIVRMQLHMVAPMDIGMEQDGPIGQDAMFSLKPVDKTGAVNKIAKGKMAMLSEAEKNRDSGISSPPNSDSDVSDDEEDRLERELDGFYEQYKERKAEKDTKYRAKRARKEYDDGDWEGVSADEQESSDGGDLEEDSSSESDEDDSEPSKPLIRDLDTETPEAGSLSKRAKNFFSQDVFQDIPGILDEPEPVVDGVDAEMVDAAEEEKPTAKNQPAVTKEPKKKTTKEKKKVVAAEEQSSDSEVDDKGVFEIAKHSQGQMEEWEDEDKRRPDGKLDIDIITAEAMTLAHQLATGQKSSYDVIDEGFNKYAFKDRDGLPEWFLDDESKHDKPQKPISKAAAAAIKEKMRALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDLLASDENMTEKEKADSIQRLMAKAARGANKARPQPKLVVARGLNRGIKGRPKGIKGRYKIVDARMKKELRAQKRIAKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.69
4 0.69
5 0.67
6 0.63
7 0.59
8 0.56
9 0.52
10 0.48
11 0.5
12 0.47
13 0.47
14 0.42
15 0.42
16 0.42
17 0.42
18 0.36
19 0.29
20 0.25
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.17
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.17
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.14
54 0.17
55 0.19
56 0.24
57 0.27
58 0.34
59 0.35
60 0.35
61 0.34
62 0.31
63 0.29
64 0.28
65 0.29
66 0.24
67 0.23
68 0.24
69 0.26
70 0.27
71 0.31
72 0.39
73 0.44
74 0.5
75 0.56
76 0.62
77 0.66
78 0.67
79 0.69
80 0.65
81 0.58
82 0.53
83 0.5
84 0.49
85 0.45
86 0.4
87 0.34
88 0.27
89 0.25
90 0.22
91 0.18
92 0.11
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.09
127 0.08
128 0.1
129 0.14
130 0.18
131 0.25
132 0.3
133 0.39
134 0.44
135 0.44
136 0.44
137 0.44
138 0.41
139 0.34
140 0.38
141 0.3
142 0.24
143 0.26
144 0.24
145 0.21
146 0.2
147 0.23
148 0.17
149 0.18
150 0.23
151 0.28
152 0.35
153 0.37
154 0.41
155 0.45
156 0.5
157 0.51
158 0.48
159 0.48
160 0.41
161 0.39
162 0.34
163 0.28
164 0.22
165 0.18
166 0.16
167 0.09
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.18
173 0.23
174 0.29
175 0.39
176 0.42
177 0.48
178 0.51
179 0.59
180 0.59
181 0.56
182 0.52
183 0.42
184 0.43
185 0.38
186 0.36
187 0.27
188 0.19
189 0.24
190 0.2
191 0.22
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.19
196 0.22
197 0.19
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.27
202 0.28
203 0.32
204 0.35
205 0.41
206 0.46
207 0.54
208 0.61
209 0.6
210 0.66
211 0.68
212 0.67
213 0.68
214 0.67
215 0.64
216 0.6
217 0.57
218 0.5
219 0.42
220 0.37
221 0.28
222 0.19
223 0.13
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.17
249 0.25
250 0.3
251 0.35
252 0.36
253 0.37
254 0.38
255 0.36
256 0.32
257 0.23
258 0.17
259 0.11
260 0.09
261 0.07
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.11
270 0.18
271 0.23
272 0.23
273 0.24
274 0.24
275 0.24
276 0.24
277 0.2
278 0.13
279 0.11
280 0.15
281 0.22
282 0.25
283 0.3
284 0.31
285 0.32
286 0.34
287 0.37
288 0.34
289 0.35
290 0.37
291 0.42
292 0.47
293 0.5
294 0.54
295 0.54
296 0.55
297 0.51
298 0.48
299 0.46
300 0.4
301 0.39
302 0.38
303 0.37
304 0.34
305 0.4
306 0.42
307 0.38
308 0.41
309 0.41
310 0.4
311 0.38
312 0.46
313 0.43
314 0.43
315 0.4
316 0.37
317 0.35
318 0.31
319 0.28
320 0.19
321 0.13
322 0.08
323 0.06
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.11
337 0.16
338 0.15
339 0.16
340 0.19
341 0.18
342 0.22
343 0.32
344 0.36
345 0.4
346 0.5
347 0.59
348 0.67
349 0.77
350 0.82
351 0.83
352 0.87
353 0.9
354 0.92
355 0.93
356 0.91
357 0.87
358 0.83
359 0.79
360 0.74
361 0.68
362 0.66
363 0.6
364 0.53
365 0.47
366 0.44
367 0.38
368 0.32
369 0.26
370 0.17
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.09
396 0.11
397 0.16
398 0.21
399 0.21
400 0.23
401 0.23
402 0.29
403 0.28
404 0.27
405 0.23
406 0.18
407 0.19
408 0.18
409 0.17
410 0.11
411 0.13
412 0.16
413 0.17
414 0.18
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.11
421 0.16
422 0.2
423 0.21
424 0.22
425 0.23
426 0.23
427 0.24
428 0.22
429 0.16
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.1
449 0.11
450 0.13
451 0.15
452 0.17
453 0.19
454 0.24
455 0.29
456 0.36
457 0.44
458 0.52
459 0.59
460 0.66
461 0.7
462 0.74
463 0.78
464 0.78
465 0.8
466 0.79
467 0.81
468 0.76
469 0.73
470 0.68
471 0.64
472 0.58
473 0.5
474 0.41
475 0.3
476 0.25
477 0.2
478 0.16
479 0.1
480 0.07
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.05
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.13
509 0.12
510 0.14
511 0.16
512 0.17
513 0.19
514 0.23
515 0.3
516 0.28
517 0.28
518 0.27
519 0.23
520 0.21
521 0.19
522 0.14
523 0.08
524 0.1
525 0.15
526 0.19
527 0.21
528 0.23
529 0.26
530 0.31
531 0.34
532 0.36
533 0.35
534 0.32
535 0.32
536 0.34
537 0.32
538 0.26
539 0.23
540 0.17
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.07
545 0.06
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.07
567 0.08
568 0.1
569 0.15
570 0.17
571 0.22
572 0.25
573 0.33
574 0.36
575 0.42
576 0.51
577 0.55
578 0.62
579 0.66
580 0.72
581 0.72
582 0.75
583 0.79
584 0.81
585 0.83
586 0.84
587 0.85
588 0.84
589 0.86
590 0.84
591 0.77
592 0.75
593 0.67
594 0.61
595 0.53
596 0.46
597 0.37
598 0.31
599 0.27
600 0.18
601 0.15
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.09
606 0.08
607 0.1
608 0.1
609 0.08
610 0.12
611 0.13
612 0.16
613 0.17
614 0.17
615 0.17
616 0.18
617 0.19
618 0.18
619 0.19
620 0.16
621 0.17
622 0.2
623 0.18
624 0.2
625 0.26
626 0.25
627 0.27
628 0.3
629 0.3
630 0.31
631 0.38
632 0.41
633 0.4
634 0.41
635 0.36
636 0.33
637 0.32
638 0.28
639 0.2
640 0.15
641 0.08
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.1
651 0.12
652 0.12
653 0.12
654 0.12
655 0.14
656 0.15
657 0.15
658 0.13
659 0.11
660 0.11
661 0.15
662 0.16
663 0.17
664 0.19
665 0.18
666 0.16
667 0.17
668 0.24
669 0.22
670 0.23
671 0.26
672 0.26
673 0.34
674 0.39
675 0.4
676 0.33
677 0.33
678 0.32
679 0.27
680 0.25
681 0.18
682 0.14
683 0.17
684 0.22
685 0.23
686 0.27
687 0.35
688 0.41
689 0.47
690 0.58
691 0.63
692 0.62
693 0.67
694 0.68
695 0.65
696 0.6
697 0.56
698 0.51
699 0.42
700 0.4
701 0.38
702 0.34
703 0.3
704 0.3
705 0.28
706 0.27
707 0.31
708 0.32
709 0.37
710 0.44
711 0.49
712 0.55
713 0.59
714 0.59
715 0.64
716 0.69
717 0.67
718 0.69
719 0.73
720 0.77
721 0.82
722 0.88
723 0.83
724 0.84
725 0.84
726 0.82
727 0.83
728 0.82
729 0.82
730 0.82
731 0.88
732 0.88
733 0.88
734 0.85
735 0.83
736 0.81
737 0.74
738 0.7
739 0.68
740 0.64
741 0.62
742 0.62
743 0.55
744 0.51
745 0.47
746 0.41
747 0.33
748 0.3
749 0.24
750 0.17
751 0.18
752 0.16
753 0.17
754 0.23
755 0.28
756 0.28
757 0.34
758 0.35
759 0.34
760 0.35
761 0.37
762 0.32
763 0.31
764 0.35
765 0.35
766 0.37
767 0.41
768 0.47
769 0.53
770 0.6
771 0.63
772 0.61
773 0.6
774 0.62
775 0.66
776 0.66
777 0.6
778 0.6
779 0.57
780 0.59
781 0.6
782 0.61
783 0.55
784 0.48
785 0.49
786 0.46
787 0.51
788 0.51
789 0.54
790 0.55
791 0.6
792 0.67
793 0.73
794 0.76
795 0.73
796 0.77
797 0.72
798 0.72
799 0.71
800 0.7
801 0.7
802 0.66
803 0.65
804 0.65
805 0.63
806 0.58
807 0.61
808 0.62
809 0.62
810 0.66
811 0.69
812 0.68