Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YTM1

Protein Details
Accession A0A4Q4YTM1    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MPPPPTPLPKRPARKRKAISDESSPHydrophilic
35-56AATAPTTPKKRRAKAPGPTAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-17PKRPARKRK
42-50PKKRRAKAP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPPPPTPLPKRPARKRKAISDESSPLETGGNIKEAATAPTTPKKRRAKAPGPTAAPPATPTPSNAKLLAEPATTPKQHPVVSRLADPNRTNAPLLSPETSRLVTAASSALSPSPSKAPQQPRGAATTTTTTTTANILEEACAHLIRVDPRMKPLIDAHPCRMFSAEGLAEEIDPFESLCSGIISQQVSGAAAKAIKRRFVELFSPPHHDDNHEGDENRGGNAIDDDGAAAAEKKKTRFPHPSQVAACPIDRLRSAGLSQRKAEYVRGLAEKFGSGELSARLLADAPYEEVLARLTAVRGLGQWSAEMFACFALKRMDVFSLGDLGVQRGMAAFLGRDVARLKAKGGKWKYMSEAEMREVSERFAPYRSLFMWYMWRVEETDVSTME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.89
4 0.9
5 0.88
6 0.82
7 0.8
8 0.77
9 0.7
10 0.63
11 0.52
12 0.42
13 0.33
14 0.28
15 0.22
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.21
26 0.3
27 0.38
28 0.42
29 0.51
30 0.59
31 0.65
32 0.73
33 0.79
34 0.8
35 0.82
36 0.86
37 0.85
38 0.79
39 0.74
40 0.69
41 0.59
42 0.49
43 0.42
44 0.35
45 0.29
46 0.24
47 0.24
48 0.27
49 0.29
50 0.32
51 0.3
52 0.28
53 0.26
54 0.28
55 0.28
56 0.21
57 0.18
58 0.21
59 0.26
60 0.26
61 0.27
62 0.3
63 0.31
64 0.34
65 0.36
66 0.35
67 0.37
68 0.38
69 0.42
70 0.45
71 0.44
72 0.48
73 0.46
74 0.46
75 0.42
76 0.41
77 0.36
78 0.29
79 0.27
80 0.24
81 0.27
82 0.24
83 0.21
84 0.21
85 0.23
86 0.23
87 0.2
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.26
104 0.35
105 0.42
106 0.49
107 0.52
108 0.49
109 0.51
110 0.49
111 0.41
112 0.34
113 0.29
114 0.23
115 0.2
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.1
133 0.15
134 0.19
135 0.18
136 0.22
137 0.26
138 0.25
139 0.25
140 0.27
141 0.3
142 0.34
143 0.37
144 0.37
145 0.39
146 0.39
147 0.37
148 0.34
149 0.25
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.08
180 0.13
181 0.14
182 0.18
183 0.19
184 0.22
185 0.22
186 0.24
187 0.26
188 0.26
189 0.3
190 0.29
191 0.34
192 0.33
193 0.34
194 0.31
195 0.29
196 0.27
197 0.26
198 0.28
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.24
203 0.23
204 0.19
205 0.15
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.19
222 0.23
223 0.31
224 0.41
225 0.46
226 0.54
227 0.57
228 0.63
229 0.59
230 0.58
231 0.54
232 0.45
233 0.39
234 0.3
235 0.26
236 0.2
237 0.19
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.15
242 0.19
243 0.26
244 0.28
245 0.29
246 0.29
247 0.31
248 0.31
249 0.31
250 0.27
251 0.22
252 0.23
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.15
260 0.11
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.09
322 0.09
323 0.11
324 0.12
325 0.16
326 0.21
327 0.21
328 0.24
329 0.28
330 0.33
331 0.41
332 0.46
333 0.51
334 0.51
335 0.54
336 0.57
337 0.54
338 0.54
339 0.5
340 0.48
341 0.42
342 0.4
343 0.37
344 0.34
345 0.29
346 0.28
347 0.26
348 0.24
349 0.22
350 0.22
351 0.24
352 0.23
353 0.28
354 0.27
355 0.28
356 0.26
357 0.27
358 0.34
359 0.32
360 0.34
361 0.3
362 0.31
363 0.26
364 0.28
365 0.29
366 0.23