Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8Q462

Protein Details
Accession J8Q462    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-190AMFRSERIKKKSKPNEQMAQCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-180IKKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039577  Rad18  
IPR004580  Rad18_fungi  
IPR006642  Rad18_UBZ4  
IPR003034  SAP_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006301  P:postreplication repair  
GO:0006513  P:protein monoubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF02037  SAP  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS51908  ZF_UBZ4  
CDD cd23148  RING-HC_ScRAD18-like  
Amino Acid Sequences MDHQITTASDFRTTSIPHLYQLDTLLRCHICKDFLKVPVLTPCGHTFCSLCIREHLNNQPNCPLCLFEFRESLLRSEFLVNEIIQSYTSIRPSLLNALKIEKPLTNSNSCKIPITQDSSLIELISESENDSSNTADDDLQIVATSERKPAKRSMTDILPLSSKSSKRSFAMFRSERIKKKSKPNEQMAQCPICQQFYPLKALEKTHLDECLTLQSLGKKPKSPKTFIAGPKLHDKEATKPKPQTSEVDKRPSDETSHVDNYLNSMANMEQQRLPKVNFTSMNQSQIKQKLLSLGLPTNGTRQNLIKRYNHYEMLWNSNFCDSLEPVDEGELKRQLLSWDVSHNKLPQNANNNGGISKLMMMKSSGKSSYRNLLENFKNDKFDRKGWIIMFQRDFARLIKEAKEKIKKGLPKDPDLTNQTIKNDEENGDAHVQNGEEANKLQMEEKREIFINEKQGINETSSPNEDLTDADLSRELMDMNEDGKDPPGKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.28
4 0.29
5 0.33
6 0.32
7 0.29
8 0.31
9 0.34
10 0.27
11 0.27
12 0.31
13 0.29
14 0.28
15 0.3
16 0.29
17 0.29
18 0.31
19 0.38
20 0.37
21 0.41
22 0.46
23 0.44
24 0.45
25 0.46
26 0.45
27 0.39
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.34
32 0.31
33 0.25
34 0.26
35 0.34
36 0.32
37 0.29
38 0.3
39 0.35
40 0.38
41 0.45
42 0.51
43 0.52
44 0.52
45 0.54
46 0.57
47 0.53
48 0.5
49 0.43
50 0.35
51 0.28
52 0.33
53 0.36
54 0.31
55 0.31
56 0.31
57 0.36
58 0.35
59 0.35
60 0.29
61 0.24
62 0.22
63 0.23
64 0.22
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.13
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.25
81 0.26
82 0.27
83 0.27
84 0.31
85 0.32
86 0.33
87 0.33
88 0.26
89 0.26
90 0.3
91 0.34
92 0.38
93 0.39
94 0.4
95 0.43
96 0.41
97 0.4
98 0.33
99 0.34
100 0.31
101 0.35
102 0.33
103 0.32
104 0.32
105 0.31
106 0.31
107 0.25
108 0.19
109 0.12
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.14
133 0.2
134 0.22
135 0.25
136 0.31
137 0.39
138 0.41
139 0.45
140 0.44
141 0.44
142 0.46
143 0.44
144 0.39
145 0.32
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.23
150 0.24
151 0.27
152 0.29
153 0.29
154 0.35
155 0.36
156 0.36
157 0.45
158 0.42
159 0.42
160 0.47
161 0.54
162 0.54
163 0.57
164 0.61
165 0.58
166 0.67
167 0.73
168 0.75
169 0.78
170 0.8
171 0.82
172 0.76
173 0.76
174 0.72
175 0.63
176 0.52
177 0.47
178 0.39
179 0.31
180 0.27
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.24
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.25
190 0.24
191 0.24
192 0.21
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.19
203 0.26
204 0.27
205 0.3
206 0.35
207 0.44
208 0.49
209 0.49
210 0.48
211 0.48
212 0.54
213 0.53
214 0.57
215 0.5
216 0.46
217 0.5
218 0.48
219 0.42
220 0.36
221 0.33
222 0.32
223 0.41
224 0.45
225 0.42
226 0.44
227 0.47
228 0.49
229 0.49
230 0.46
231 0.44
232 0.48
233 0.48
234 0.52
235 0.5
236 0.47
237 0.47
238 0.42
239 0.36
240 0.28
241 0.26
242 0.23
243 0.25
244 0.24
245 0.22
246 0.21
247 0.2
248 0.2
249 0.16
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.15
257 0.16
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.25
264 0.24
265 0.24
266 0.3
267 0.29
268 0.36
269 0.33
270 0.33
271 0.34
272 0.35
273 0.36
274 0.28
275 0.27
276 0.23
277 0.23
278 0.24
279 0.21
280 0.18
281 0.17
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.2
286 0.18
287 0.17
288 0.2
289 0.26
290 0.31
291 0.37
292 0.38
293 0.41
294 0.48
295 0.5
296 0.49
297 0.42
298 0.42
299 0.39
300 0.42
301 0.39
302 0.31
303 0.28
304 0.27
305 0.26
306 0.19
307 0.19
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.15
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.15
323 0.17
324 0.15
325 0.2
326 0.23
327 0.25
328 0.28
329 0.31
330 0.31
331 0.35
332 0.37
333 0.34
334 0.39
335 0.4
336 0.4
337 0.38
338 0.36
339 0.3
340 0.27
341 0.22
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.17
349 0.19
350 0.23
351 0.24
352 0.23
353 0.27
354 0.3
355 0.37
356 0.35
357 0.38
358 0.37
359 0.42
360 0.44
361 0.49
362 0.53
363 0.46
364 0.49
365 0.45
366 0.51
367 0.48
368 0.47
369 0.47
370 0.43
371 0.46
372 0.41
373 0.49
374 0.46
375 0.48
376 0.46
377 0.42
378 0.4
379 0.36
380 0.36
381 0.29
382 0.27
383 0.23
384 0.24
385 0.29
386 0.34
387 0.39
388 0.47
389 0.55
390 0.53
391 0.57
392 0.62
393 0.62
394 0.62
395 0.65
396 0.63
397 0.61
398 0.63
399 0.61
400 0.6
401 0.6
402 0.58
403 0.53
404 0.5
405 0.45
406 0.44
407 0.4
408 0.35
409 0.33
410 0.29
411 0.26
412 0.23
413 0.24
414 0.24
415 0.23
416 0.2
417 0.18
418 0.17
419 0.15
420 0.17
421 0.14
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.19
428 0.2
429 0.25
430 0.29
431 0.3
432 0.31
433 0.32
434 0.33
435 0.33
436 0.35
437 0.39
438 0.38
439 0.38
440 0.35
441 0.38
442 0.37
443 0.37
444 0.36
445 0.3
446 0.29
447 0.3
448 0.31
449 0.27
450 0.26
451 0.22
452 0.18
453 0.18
454 0.19
455 0.16
456 0.15
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.12
462 0.09
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.17