Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XHP4

Protein Details
Accession A0A4Q4XHP4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-127EAKPSSQSKDQGKRKQKQSLEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-323RRKKRK
448-452RLKGK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPRIHDSDAPSMVLNPTTAPNSHKVKKLDDLASELGSDAAAVRANEGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNLSSAGGEVVFVEAKPSSQSKDQGKRKQKQSLEDALRNLDIEEAERKKRELLDDDILPSKNLTRLTYQAQQDVPDAIGGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDDDIFQELAKEGRELDDFEFEEQGDFFDEDGWESDDTAKPKREYKTAARGADKEVPTLVPVPGSGSGEEAPAPNENWLEDFKQFKKDQKVQSSEKKKTPLPPPSNSDLQSSLFTATTNGGLRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLVRTEQLGILDERFEKLEERHYNPAHEDGENDFLYGDDDGTASALSGITGITGASTASSVTGPTRGDFDSILDDFLGGYSMHGKKQLKKGGWKNGTEQLDEIRRELGPPRLKGKYAGGGGKTKSPAAAAALAFGAPSASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.56
8 0.58
9 0.64
10 0.62
11 0.56
12 0.57
13 0.57
14 0.56
15 0.57
16 0.53
17 0.49
18 0.46
19 0.41
20 0.33
21 0.29
22 0.26
23 0.21
24 0.17
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.25
31 0.33
32 0.39
33 0.45
34 0.46
35 0.49
36 0.55
37 0.59
38 0.57
39 0.51
40 0.5
41 0.45
42 0.42
43 0.37
44 0.29
45 0.21
46 0.15
47 0.13
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.08
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.11
97 0.13
98 0.17
99 0.25
100 0.33
101 0.44
102 0.54
103 0.62
104 0.71
105 0.78
106 0.82
107 0.85
108 0.8
109 0.78
110 0.76
111 0.76
112 0.74
113 0.68
114 0.61
115 0.54
116 0.48
117 0.4
118 0.32
119 0.23
120 0.14
121 0.11
122 0.17
123 0.19
124 0.23
125 0.24
126 0.25
127 0.26
128 0.29
129 0.32
130 0.3
131 0.32
132 0.32
133 0.32
134 0.34
135 0.35
136 0.33
137 0.28
138 0.24
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.18
145 0.23
146 0.3
147 0.3
148 0.31
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.2
154 0.14
155 0.12
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.12
220 0.15
221 0.18
222 0.19
223 0.24
224 0.27
225 0.29
226 0.33
227 0.38
228 0.45
229 0.48
230 0.51
231 0.48
232 0.47
233 0.47
234 0.48
235 0.41
236 0.31
237 0.24
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.14
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.16
264 0.17
265 0.25
266 0.27
267 0.32
268 0.4
269 0.46
270 0.52
271 0.57
272 0.63
273 0.63
274 0.71
275 0.75
276 0.72
277 0.7
278 0.66
279 0.61
280 0.62
281 0.63
282 0.64
283 0.61
284 0.6
285 0.61
286 0.61
287 0.62
288 0.55
289 0.48
290 0.39
291 0.33
292 0.28
293 0.23
294 0.19
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.19
303 0.25
304 0.33
305 0.43
306 0.49
307 0.54
308 0.59
309 0.66
310 0.68
311 0.74
312 0.75
313 0.73
314 0.68
315 0.62
316 0.56
317 0.47
318 0.38
319 0.28
320 0.2
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.22
343 0.26
344 0.31
345 0.39
346 0.4
347 0.42
348 0.41
349 0.45
350 0.37
351 0.31
352 0.28
353 0.22
354 0.25
355 0.23
356 0.21
357 0.16
358 0.13
359 0.14
360 0.12
361 0.1
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.14
398 0.13
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.06
403 0.06
404 0.13
405 0.15
406 0.16
407 0.24
408 0.29
409 0.35
410 0.45
411 0.54
412 0.54
413 0.63
414 0.72
415 0.75
416 0.79
417 0.75
418 0.71
419 0.71
420 0.67
421 0.57
422 0.49
423 0.45
424 0.44
425 0.42
426 0.37
427 0.31
428 0.27
429 0.28
430 0.31
431 0.33
432 0.34
433 0.38
434 0.45
435 0.47
436 0.49
437 0.5
438 0.52
439 0.5
440 0.48
441 0.49
442 0.46
443 0.48
444 0.49
445 0.51
446 0.48
447 0.4
448 0.35
449 0.29
450 0.26
451 0.23
452 0.26
453 0.19
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.15
458 0.14