Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YRD7

Protein Details
Accession A0A4Q4YRD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-105LSEKGIPRLRRKARDLKFKGKGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-53GQSKKRK
85-103EKGIPRLRRKARDLKFKGK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MASRAAAGPLSPQRPPPPSNDIDDYDVDDDIFAESGGDESAAARKNGQSKKRKGAASLGIDEEVAVAKKMRAPMVKLDGNRLLSEKGIPRLRRKARDLKFKGKGHEFSDAARLLSFYQLWLDDLFPKAKFLDALVMVEKAGHKKHMHMKRMEWINEGKPKPYRDDDGEDIFGESNQPEERGASRFPARLAPIFQDRASQRPKTPTRDDLFGDEDIYDATPRAPRITGPADDLNAGKSARSGEMPEDDDLDALMAEEEAQRTAPTNSIFGSGTVSRPRDQVDQDDLDALMAEAEAQANPSKQNGITVPKPKPLVAADEEDDLDALMAEAEASSRNPQQRDLAEGTKPLPREEQSSKGHVADADEEEAMAEMDGLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.47
4 0.48
5 0.48
6 0.53
7 0.53
8 0.49
9 0.46
10 0.45
11 0.41
12 0.34
13 0.3
14 0.23
15 0.18
16 0.14
17 0.11
18 0.1
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.1
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.18
32 0.28
33 0.37
34 0.46
35 0.52
36 0.58
37 0.69
38 0.75
39 0.74
40 0.68
41 0.69
42 0.68
43 0.64
44 0.58
45 0.49
46 0.41
47 0.38
48 0.34
49 0.25
50 0.18
51 0.11
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.11
56 0.14
57 0.19
58 0.21
59 0.24
60 0.31
61 0.38
62 0.42
63 0.4
64 0.44
65 0.44
66 0.42
67 0.4
68 0.34
69 0.27
70 0.23
71 0.26
72 0.24
73 0.27
74 0.33
75 0.37
76 0.43
77 0.53
78 0.62
79 0.66
80 0.7
81 0.73
82 0.75
83 0.81
84 0.81
85 0.81
86 0.82
87 0.78
88 0.77
89 0.74
90 0.7
91 0.61
92 0.59
93 0.5
94 0.41
95 0.42
96 0.36
97 0.28
98 0.23
99 0.21
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.16
129 0.15
130 0.21
131 0.31
132 0.39
133 0.46
134 0.47
135 0.49
136 0.52
137 0.59
138 0.54
139 0.48
140 0.43
141 0.41
142 0.46
143 0.43
144 0.39
145 0.36
146 0.37
147 0.38
148 0.38
149 0.35
150 0.31
151 0.36
152 0.35
153 0.33
154 0.32
155 0.28
156 0.25
157 0.21
158 0.17
159 0.12
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.22
182 0.21
183 0.26
184 0.29
185 0.29
186 0.28
187 0.36
188 0.42
189 0.44
190 0.48
191 0.5
192 0.48
193 0.49
194 0.47
195 0.41
196 0.38
197 0.31
198 0.26
199 0.18
200 0.15
201 0.12
202 0.11
203 0.08
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.14
212 0.18
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.2
217 0.21
218 0.21
219 0.16
220 0.14
221 0.13
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.12
256 0.15
257 0.13
258 0.16
259 0.2
260 0.22
261 0.21
262 0.23
263 0.25
264 0.26
265 0.28
266 0.3
267 0.31
268 0.31
269 0.3
270 0.29
271 0.26
272 0.21
273 0.19
274 0.13
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.18
290 0.23
291 0.3
292 0.38
293 0.42
294 0.45
295 0.47
296 0.44
297 0.44
298 0.39
299 0.37
300 0.33
301 0.33
302 0.29
303 0.29
304 0.29
305 0.25
306 0.23
307 0.17
308 0.13
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.05
317 0.06
318 0.1
319 0.16
320 0.22
321 0.24
322 0.27
323 0.33
324 0.34
325 0.4
326 0.42
327 0.41
328 0.37
329 0.39
330 0.38
331 0.36
332 0.36
333 0.31
334 0.31
335 0.28
336 0.34
337 0.37
338 0.43
339 0.44
340 0.49
341 0.5
342 0.45
343 0.45
344 0.38
345 0.35
346 0.3
347 0.28
348 0.24
349 0.2
350 0.19
351 0.17
352 0.16
353 0.14
354 0.09