Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PQV1

Protein Details
Accession J8PQV1    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-162TSFTKRDSKKTVGRPKREKRQTILPTHydrophilic
196-221AYGKRLKKEEDEKKRQELNKKRMQNDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-156SKKTVGRPKREKR
202-203KK
207-210EKKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
Amino Acid Sequences MHCNDYDISGSSFLTRVVKKTDAKKNLLQNREIGGWKPNNKVRAYDERGKVYVSCSFIEVSLSQVEIIDVQKKFENAERLRDITRNILKNKTDSSQGMIPSKIGATSTCGFQKSTLSAGITDSRNTRCHGQGTNKSTSFTKRDSKKTVGRPKREKRQTILPTGEIKECAKCKDTWTIQWRSGPAHSRELCSPCGLAYGKRLKKEEDEKKRQELNKKRMQNDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.21
4 0.25
5 0.32
6 0.38
7 0.47
8 0.56
9 0.58
10 0.62
11 0.67
12 0.71
13 0.74
14 0.73
15 0.65
16 0.59
17 0.54
18 0.51
19 0.46
20 0.37
21 0.36
22 0.38
23 0.41
24 0.46
25 0.47
26 0.49
27 0.49
28 0.51
29 0.5
30 0.53
31 0.55
32 0.56
33 0.57
34 0.55
35 0.54
36 0.51
37 0.45
38 0.37
39 0.33
40 0.27
41 0.21
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.15
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.09
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.19
62 0.28
63 0.24
64 0.31
65 0.33
66 0.34
67 0.36
68 0.36
69 0.33
70 0.32
71 0.37
72 0.36
73 0.36
74 0.39
75 0.39
76 0.4
77 0.41
78 0.34
79 0.31
80 0.25
81 0.26
82 0.23
83 0.24
84 0.24
85 0.21
86 0.19
87 0.16
88 0.16
89 0.12
90 0.09
91 0.06
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.11
101 0.12
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.14
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.21
114 0.19
115 0.22
116 0.26
117 0.32
118 0.38
119 0.42
120 0.47
121 0.45
122 0.44
123 0.43
124 0.42
125 0.38
126 0.34
127 0.37
128 0.38
129 0.45
130 0.5
131 0.56
132 0.6
133 0.67
134 0.73
135 0.74
136 0.77
137 0.8
138 0.84
139 0.88
140 0.89
141 0.85
142 0.79
143 0.8
144 0.76
145 0.74
146 0.67
147 0.6
148 0.55
149 0.51
150 0.47
151 0.39
152 0.33
153 0.3
154 0.29
155 0.28
156 0.26
157 0.25
158 0.27
159 0.34
160 0.37
161 0.41
162 0.47
163 0.5
164 0.51
165 0.54
166 0.53
167 0.47
168 0.48
169 0.47
170 0.42
171 0.46
172 0.43
173 0.43
174 0.47
175 0.47
176 0.43
177 0.37
178 0.33
179 0.23
180 0.26
181 0.24
182 0.2
183 0.25
184 0.34
185 0.38
186 0.44
187 0.47
188 0.46
189 0.54
190 0.63
191 0.65
192 0.66
193 0.72
194 0.73
195 0.79
196 0.84
197 0.82
198 0.82
199 0.82
200 0.81
201 0.81
202 0.83