FuNGI

A0A4Q4XM17

Protein Details

Accession

A0A4Q4XM17

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
177-202	RLLPQPVQKRLRYRQKQKGVGVKNKD	Hydrophilic
211-234	EDQETKEVKRKRGRPKKTVPELYA	Basic
659-679	TQMLRRKRYIRVKYYYVRQEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
219-227	KRKRGRPKK

Subcellular Location(s)

cyto 17, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MTIIEKFCAVEGIELVISSSYNQYQNGVAERGIQFLQDEARATSAQMKIPTCFWDFIMEATTHTINRTGQSTVKDMTPIECFERAFDPDLEGSHKPDNSHLRIFGSRCTVLIDKNYRTRLEKLAARGAKGMLLGYQGTYNYKVWLLKGGRMLIILHVTVYEDLEEPGQPPDPRDIIRLLPQPVQKRLRYRQKQKGVGVKNKDDNVVSEDDEDQETKEVKRKRGRPKKTVPELYALEAPDEALELMRELKLALTQEGDCDLDCDPEGLQSFPLLSDDDDFVGSHGYVTVDDGPSLKEAMESPEREMWFKAIFTEIKENLSRGTFKFISPDSDRAHGHLVDAKWVLRKKYTSTGKLDKYKARICARGFTQRKDIDYNEIAANTARAVYWKILMALAAYLGWHIIQIDFITAYLNRNLKEDIYMKQFTMLKEYFEAYPEDREKYGYLPELIIKLINPLYGLKQAGATWQEKVRELLAKLGFLPLISDDAIYRNAETGDVISSYVDNFLLFGAGRERLEGAAKKLAEDVPVKNLGDANWYLGVRLVRSSPTGDIRLDQQQYIEKLLKSVGLDEIRKEPTLFVKDYLKHAMRHDGVASKEDTFEYASLGVVTKCTTEAEYVGAGTAAIEAAGIRNFLTELELMPKGPIPILEDNTGAFKWVTETQMLRRKRYIRVKYYYVRQEVQVGNISFQFRKVHTELRTRENTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.12
7	0.13
8	0.15
9	0.16
10	0.17
11	0.19
12	0.23
13	0.26
14	0.24
15	0.21
16	0.25
17	0.25
18	0.26
19	0.24
20	0.21
21	0.17
22	0.17
23	0.19
24	0.15
25	0.16
26	0.14
27	0.16
28	0.16
29	0.17
30	0.22
31	0.22
32	0.25
33	0.29
34	0.3
35	0.29
36	0.31
37	0.34
38	0.31
39	0.29
40	0.26
41	0.25
42	0.23
43	0.22
44	0.24
45	0.19
46	0.17
47	0.19
48	0.2
49	0.16
50	0.17
51	0.19
52	0.17
53	0.19
54	0.21
55	0.2
56	0.22
57	0.25
58	0.28
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.25
63	0.25
64	0.24
65	0.23
66	0.23
67	0.24
68	0.22
69	0.23
70	0.25
71	0.25
72	0.25
73	0.23
74	0.22
75	0.21
76	0.22
77	0.24
78	0.22
79	0.24
80	0.26
81	0.27
82	0.25
83	0.32
84	0.39
85	0.4
86	0.43
87	0.41
88	0.4
89	0.44
90	0.44
91	0.41
92	0.38
93	0.33
94	0.29
95	0.32
96	0.29
97	0.26
98	0.34
99	0.37
100	0.37
101	0.44
102	0.49
103	0.48
104	0.51
105	0.52
106	0.49
107	0.49
108	0.48
109	0.45
110	0.51
111	0.49
112	0.46
113	0.44
114	0.38
115	0.32
116	0.27
117	0.22
118	0.13
119	0.12
120	0.11
121	0.09
122	0.1
123	0.1
124	0.11
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.16
129	0.17
130	0.16
131	0.24
132	0.24
133	0.25
134	0.29
135	0.29
136	0.27
137	0.27
138	0.26
139	0.19
140	0.19
141	0.15
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.1
154	0.14
155	0.13
156	0.14
157	0.18
158	0.2
159	0.21
160	0.22
161	0.23
162	0.22
163	0.28
164	0.32
165	0.31
166	0.34
167	0.38
168	0.42
169	0.48
170	0.53
171	0.52
172	0.56
173	0.63
174	0.69
175	0.74
176	0.79
177	0.81
178	0.84
179	0.87
180	0.85
181	0.85
182	0.83
183	0.82
184	0.79
185	0.75
186	0.71
187	0.64
188	0.59
189	0.49
190	0.41
191	0.35
192	0.29
193	0.23
194	0.18
195	0.17
196	0.16
197	0.16
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.13
202	0.13
203	0.19
204	0.24
205	0.32
206	0.41
207	0.5
208	0.6
209	0.69
210	0.78
211	0.81
212	0.87
213	0.89
214	0.9
215	0.89
216	0.8
217	0.75
218	0.67
219	0.59
220	0.51
221	0.4
222	0.3
223	0.21
224	0.18
225	0.11
226	0.1
227	0.07
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.06
274	0.07
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.1
285	0.14
286	0.15
287	0.16
288	0.2
289	0.21
290	0.21
291	0.21
292	0.19
293	0.15
294	0.14
295	0.12
296	0.11
297	0.11
298	0.12
299	0.18
300	0.17
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.17
305	0.18
306	0.18
307	0.13
308	0.18
309	0.17
310	0.16
311	0.19
312	0.18
313	0.23
314	0.23
315	0.28
316	0.24
317	0.26
318	0.26
319	0.25
320	0.26
321	0.21
322	0.18
323	0.17
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.19
330	0.19
331	0.18
332	0.2
333	0.2
334	0.29
335	0.36
336	0.37
337	0.41
338	0.48
339	0.52
340	0.58
341	0.59
342	0.54
343	0.53
344	0.51
345	0.53
346	0.49
347	0.48
348	0.42
349	0.43
350	0.42
351	0.47
352	0.46
353	0.41
354	0.45
355	0.41
356	0.42
357	0.4
358	0.37
359	0.32
360	0.29
361	0.29
362	0.21
363	0.19
364	0.17
365	0.14
366	0.13
367	0.07
368	0.07
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.1
398	0.13
399	0.13
400	0.14
401	0.15
402	0.14
403	0.17
404	0.18
405	0.17
406	0.22
407	0.22
408	0.21
409	0.24
410	0.27
411	0.23
412	0.28
413	0.25
414	0.2
415	0.2
416	0.22
417	0.18
418	0.16
419	0.18
420	0.12
421	0.18
422	0.19
423	0.19
424	0.18
425	0.19
426	0.18
427	0.18
428	0.19
429	0.15
430	0.14
431	0.13
432	0.14
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.09
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.12
444	0.13
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.13
449	0.16
450	0.16
451	0.15
452	0.18
453	0.2
454	0.2
455	0.21
456	0.2
457	0.21
458	0.2
459	0.25
460	0.22
461	0.21
462	0.21
463	0.2
464	0.18
465	0.13
466	0.13
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.08
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.07
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.15
502	0.16
503	0.17
504	0.21
505	0.21
506	0.21
507	0.23
508	0.23
509	0.22
510	0.23
511	0.22
512	0.21
513	0.25
514	0.24
515	0.23
516	0.23
517	0.19
518	0.2
519	0.19
520	0.16
521	0.16
522	0.16
523	0.15
524	0.17
525	0.17
526	0.14
527	0.15
528	0.14
529	0.12
530	0.14
531	0.16
532	0.17
533	0.2
534	0.22
535	0.22
536	0.21
537	0.24
538	0.3
539	0.29
540	0.26
541	0.24
542	0.26
543	0.27
544	0.3
545	0.31
546	0.23
547	0.23
548	0.23
549	0.23
550	0.18
551	0.18
552	0.2
553	0.21
554	0.22
555	0.23
556	0.28
557	0.28
558	0.29
559	0.28
560	0.24
561	0.26
562	0.3
563	0.3
564	0.27
565	0.32
566	0.34
567	0.38
568	0.45
569	0.42
570	0.4
571	0.41
572	0.47
573	0.41
574	0.4
575	0.38
576	0.35
577	0.32
578	0.32
579	0.31
580	0.23
581	0.23
582	0.21
583	0.19
584	0.16
585	0.14
586	0.12
587	0.11
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.08
595	0.09
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.11
600	0.12
601	0.12
602	0.11
603	0.11
604	0.1
605	0.08
606	0.07
607	0.06
608	0.04
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.14
626	0.16
627	0.15
628	0.15
629	0.15
630	0.16
631	0.21
632	0.24
633	0.25
634	0.24
635	0.24
636	0.27
637	0.26
638	0.21
639	0.15
640	0.12
641	0.14
642	0.17
643	0.18
644	0.19
645	0.23
646	0.31
647	0.4
648	0.45
649	0.47
650	0.53
651	0.56
652	0.62
653	0.7
654	0.71
655	0.73
656	0.76
657	0.79
658	0.8
659	0.84
660	0.83
661	0.79
662	0.71
663	0.63
664	0.63
665	0.55
666	0.51
667	0.49
668	0.4
669	0.35
670	0.36
671	0.37
672	0.3
673	0.31
674	0.31
675	0.25
676	0.32
677	0.34
678	0.39
679	0.43
680	0.53
681	0.55
682	0.6

A0A4Q4XM17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer