Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YXJ4

Protein Details
Accession A0A4Q4YXJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-227DEERRKARIRRWMVRCRVHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-270RRRGKRV
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MHTTTVMEPCCTCAQLLSAAPRYDASSEKPLPDDRRVECCGRIICGSCVYKNPRFRNYCPYCQISQTSSALPPGLKDPPSYTSAIASKPALPARDRRSQQDQDQDPDPDPDQPPPPYTPSSTIMPSDFCGEKKKTDGPAPSEPAQDILHFLDQPHDTVASLSLRYGISAAALRRANNIHSDHLIQGRRTVVIPGARVSLSPRPVGGEDEERRKARIRRWMVRCRVHEYDVAVLYLEQAGYDLEAAVERYLADEEWERAHPLEARRRGKRVGGGGAGSGSGRVTMGLWGGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.23
4 0.25
5 0.29
6 0.29
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.28
11 0.27
12 0.25
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.34
17 0.39
18 0.43
19 0.48
20 0.5
21 0.44
22 0.49
23 0.52
24 0.51
25 0.46
26 0.47
27 0.41
28 0.36
29 0.36
30 0.31
31 0.29
32 0.32
33 0.33
34 0.29
35 0.35
36 0.39
37 0.44
38 0.51
39 0.56
40 0.59
41 0.64
42 0.66
43 0.7
44 0.7
45 0.71
46 0.68
47 0.66
48 0.58
49 0.55
50 0.54
51 0.45
52 0.42
53 0.35
54 0.3
55 0.26
56 0.25
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.19
65 0.21
66 0.24
67 0.25
68 0.22
69 0.2
70 0.22
71 0.21
72 0.21
73 0.19
74 0.17
75 0.19
76 0.21
77 0.21
78 0.2
79 0.28
80 0.32
81 0.4
82 0.4
83 0.43
84 0.49
85 0.52
86 0.57
87 0.58
88 0.56
89 0.51
90 0.52
91 0.47
92 0.39
93 0.36
94 0.31
95 0.25
96 0.22
97 0.21
98 0.22
99 0.21
100 0.23
101 0.23
102 0.25
103 0.24
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.14
115 0.13
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.21
120 0.25
121 0.25
122 0.29
123 0.33
124 0.33
125 0.37
126 0.41
127 0.39
128 0.35
129 0.32
130 0.28
131 0.25
132 0.18
133 0.14
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.25
170 0.26
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.17
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.2
193 0.24
194 0.26
195 0.33
196 0.39
197 0.37
198 0.39
199 0.44
200 0.46
201 0.44
202 0.51
203 0.53
204 0.58
205 0.67
206 0.75
207 0.78
208 0.82
209 0.8
210 0.77
211 0.72
212 0.64
213 0.57
214 0.49
215 0.44
216 0.35
217 0.3
218 0.22
219 0.17
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.12
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.19
246 0.22
247 0.28
248 0.37
249 0.44
250 0.52
251 0.58
252 0.63
253 0.65
254 0.66
255 0.65
256 0.62
257 0.59
258 0.53
259 0.47
260 0.42
261 0.38
262 0.33
263 0.25
264 0.18
265 0.11
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.09