FuNGI

A0A4Q4YN39

Protein Details

Accession

A0A4Q4YN39

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MDRSRRRRPTRELLVLNQRA	Hydrophilic
1212-1234	TQIDQPQKPQKGLRRRRLLKNSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1224-1228	LRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRSRRRRPTRELLVLNQRAWNEEKNIFPVNPSLDSSLKKNTAFIKRLRTAITPATLNTFLQEIRTLSLHKYLSEIVSACYEGLTKLKNPGEIEAAVEIVSALHQRFGPDEFTEYLGWLLGKGMATPDKSLLKTLPPEVREKEEKDRLVRQRALLRVITELWLLGVLRTLDDVKPDDATRGVSGKNAELKIKSTSSSKGGGAEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLLVIFIKSFSWDILGVKSAGSDGRKTVEEDGATKSVEDPSDSNDRHTETGSDSDDDSSFASPEIQERFKNILKRYFDDVKAHILRDQKNIVTQKGRNSEAYVKSGEVFEDRQANFERLVKAQERLVSNAQVIAEAIGAEMPDLKEAGDGLSASNGSIGLVKTGEYLRGQSDGAGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPGMLLEDGKKKKPDTDEQVGKRVDTPEASETPKPSDPADDQSTAIANKTIGAQVDAILARLPELTNKDAIDEIAVDFCFLNSKASRNRLVKALTEVPKGRTDLLPFWSRLVATLGRYMPDVPKGVVEYLDAEFRSLQRRKDKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGVVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRNADTSPRMSTFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAVYYVDPPERTSIQQKERTPTELFIRKLIYVDLTKRNYTKILKQIRRLHWEEPDVVDILAKVFSRPGKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPDFAVMVIDNVIESVNFGLEQNDFKFNQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMTFGHGGAPIPGRLNPFDLPDDYFRIRLVATILETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFLQYYIHTKHPLPMDIDFIVQDTFSLTRPQWKLATNLEEASKAFQLAIAQDQKNAGLDKSADPDDASSDTSSDDEGAEADGDIVLPEAEGDEEESESGEDDEAEIDSQPQSPRASESEDEAIVVTRKAEEVDPEDEADFEREYAKMMAESLESRKFDRKPLFDVPLPVRSKTRENSAATDTEEKNGQNGPSTMAFSLLTKKGNRQQTRTVALPSDSTFAVAMRTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRESEDQDGDIYQSPLNPNTNIHNAPIPGHEKQTYQPNRLDKSGKDRGGRVRRLQLSDVDWYEKTRQNKAPSEDRSISKAQPVAHMRAEESASLPKGERAQNKCSMASADRQTQIDQPQKPQKGLRRRRLLKNSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.8
3	0.72
4	0.65
5	0.55
6	0.48
7	0.45
8	0.41
9	0.36
10	0.35
11	0.36
12	0.37
13	0.42
14	0.38
15	0.36
16	0.36
17	0.34
18	0.32
19	0.31
20	0.3
21	0.29
22	0.32
23	0.34
24	0.38
25	0.39
26	0.37
27	0.39
28	0.44
29	0.5
30	0.54
31	0.57
32	0.59
33	0.59
34	0.63
35	0.62
36	0.56
37	0.52
38	0.51
39	0.49
40	0.4
41	0.36
42	0.37
43	0.35
44	0.31
45	0.27
46	0.22
47	0.18
48	0.17
49	0.19
50	0.15
51	0.16
52	0.18
53	0.19
54	0.19
55	0.26
56	0.25
57	0.23
58	0.24
59	0.24
60	0.23
61	0.25
62	0.24
63	0.18
64	0.19
65	0.19
66	0.16
67	0.14
68	0.13
69	0.11
70	0.14
71	0.16
72	0.16
73	0.24
74	0.27
75	0.31
76	0.32
77	0.34
78	0.34
79	0.31
80	0.31
81	0.23
82	0.21
83	0.16
84	0.14
85	0.11
86	0.07
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.13
94	0.15
95	0.18
96	0.17
97	0.2
98	0.2
99	0.22
100	0.21
101	0.2
102	0.18
103	0.15
104	0.14
105	0.1
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.12
111	0.15
112	0.16
113	0.18
114	0.21
115	0.25
116	0.25
117	0.28
118	0.26
119	0.28
120	0.31
121	0.37
122	0.39
123	0.37
124	0.43
125	0.45
126	0.51
127	0.52
128	0.53
129	0.56
130	0.58
131	0.61
132	0.6
133	0.66
134	0.67
135	0.7
136	0.69
137	0.65
138	0.64
139	0.63
140	0.61
141	0.54
142	0.46
143	0.39
144	0.36
145	0.31
146	0.23
147	0.18
148	0.13
149	0.12
150	0.1
151	0.08
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.14
159	0.16
160	0.15
161	0.18
162	0.18
163	0.19
164	0.18
165	0.19
166	0.18
167	0.18
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.22
172	0.28
173	0.28
174	0.29
175	0.28
176	0.3
177	0.32
178	0.32
179	0.3
180	0.26
181	0.28
182	0.28
183	0.3
184	0.28
185	0.26
186	0.27
187	0.28
188	0.26
189	0.25
190	0.22
191	0.19
192	0.18
193	0.15
194	0.13
195	0.11
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.15
201	0.17
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.2
206	0.23
207	0.23
208	0.19
209	0.18
210	0.18
211	0.16
212	0.14
213	0.13
214	0.1
215	0.09
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.09
222	0.09
223	0.11
224	0.11
225	0.13
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.13
234	0.15
235	0.17
236	0.19
237	0.21
238	0.21
239	0.21
240	0.21
241	0.24
242	0.23
243	0.22
244	0.2
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.16
249	0.13
250	0.15
251	0.25
252	0.25
253	0.27
254	0.27
255	0.29
256	0.28
257	0.28
258	0.25
259	0.18
260	0.22
261	0.22
262	0.2
263	0.19
264	0.19
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.12
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.12
274	0.16
275	0.18
276	0.18
277	0.21
278	0.27
279	0.31
280	0.38
281	0.39
282	0.43
283	0.44
284	0.47
285	0.51
286	0.52
287	0.52
288	0.49
289	0.46
290	0.47
291	0.44
292	0.41
293	0.38
294	0.38
295	0.38
296	0.39
297	0.41
298	0.33
299	0.37
300	0.4
301	0.42
302	0.42
303	0.42
304	0.45
305	0.47
306	0.49
307	0.43
308	0.43
309	0.46
310	0.42
311	0.42
312	0.35
313	0.29
314	0.27
315	0.26
316	0.22
317	0.17
318	0.15
319	0.14
320	0.2
321	0.19
322	0.22
323	0.24
324	0.24
325	0.24
326	0.26
327	0.26
328	0.2
329	0.25
330	0.24
331	0.24
332	0.25
333	0.28
334	0.26
335	0.28
336	0.29
337	0.25
338	0.23
339	0.23
340	0.21
341	0.16
342	0.14
343	0.1
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.1
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.12
379	0.12
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.14
397	0.19
398	0.19
399	0.21
400	0.21
401	0.19
402	0.2
403	0.22
404	0.18
405	0.13
406	0.12
407	0.1
408	0.12
409	0.13
410	0.14
411	0.16
412	0.23
413	0.26
414	0.3
415	0.32
416	0.3
417	0.33
418	0.38
419	0.43
420	0.44
421	0.51
422	0.57
423	0.57
424	0.64
425	0.59
426	0.53
427	0.47
428	0.39
429	0.31
430	0.22
431	0.21
432	0.17
433	0.2
434	0.23
435	0.22
436	0.22
437	0.25
438	0.26
439	0.24
440	0.21
441	0.22
442	0.21
443	0.25
444	0.28
445	0.24
446	0.23
447	0.22
448	0.23
449	0.19
450	0.18
451	0.12
452	0.08
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.07
467	0.06
468	0.07
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.1
477	0.08
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.1
487	0.09
488	0.14
489	0.19
490	0.23
491	0.31
492	0.33
493	0.34
494	0.35
495	0.37
496	0.33
497	0.33
498	0.37
499	0.33
500	0.34
501	0.35
502	0.32
503	0.33
504	0.32
505	0.29
506	0.22
507	0.22
508	0.2
509	0.22
510	0.23
511	0.21
512	0.21
513	0.2
514	0.18
515	0.17
516	0.16
517	0.13
518	0.11
519	0.15
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.15
524	0.13
525	0.14
526	0.14
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.18
541	0.19
542	0.24
543	0.32
544	0.37
545	0.42
546	0.48
547	0.49
548	0.47
549	0.53
550	0.52
551	0.49
552	0.47
553	0.42
554	0.39
555	0.39
556	0.32
557	0.24
558	0.2
559	0.14
560	0.12
561	0.13
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.11
566	0.12
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.08
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.09
575	0.11
576	0.11
577	0.1
578	0.11
579	0.09
580	0.09
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.11
586	0.1
587	0.11
588	0.12
589	0.11
590	0.1
591	0.09
592	0.09
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.05
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.11
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.17
610	0.2
611	0.21
612	0.22
613	0.21
614	0.18
615	0.18
616	0.17
617	0.17
618	0.13
619	0.15
620	0.21
621	0.21
622	0.24
623	0.26
624	0.28
625	0.28
626	0.28
627	0.33
628	0.35
629	0.36
630	0.39
631	0.45
632	0.48
633	0.51
634	0.5
635	0.42
636	0.34
637	0.31
638	0.25
639	0.15
640	0.1
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.07
648	0.07
649	0.08
650	0.1
651	0.11
652	0.13
653	0.19
654	0.25
655	0.32
656	0.39
657	0.41
658	0.44
659	0.44
660	0.47
661	0.41
662	0.36
663	0.36
664	0.35
665	0.33
666	0.3
667	0.3
668	0.26
669	0.25
670	0.23
671	0.18
672	0.14
673	0.18
674	0.23
675	0.24
676	0.26
677	0.26
678	0.28
679	0.3
680	0.31
681	0.33
682	0.35
683	0.43
684	0.47
685	0.55
686	0.64
687	0.66
688	0.7
689	0.68
690	0.61
691	0.55
692	0.52
693	0.44
694	0.36
695	0.3
696	0.23
697	0.19
698	0.16
699	0.11
700	0.08
701	0.08
702	0.07
703	0.05
704	0.07
705	0.09
706	0.13
707	0.16
708	0.18
709	0.24
710	0.26
711	0.29
712	0.29
713	0.33
714	0.31
715	0.3
716	0.27
717	0.19
718	0.18
719	0.15
720	0.13
721	0.07
722	0.04
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.03
727	0.05
728	0.06
729	0.07
730	0.08
731	0.09
732	0.09
733	0.09
734	0.11
735	0.1
736	0.09
737	0.08
738	0.07
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.04
748	0.04
749	0.05
750	0.07
751	0.09
752	0.12
753	0.13
754	0.17
755	0.24
756	0.25
757	0.32
758	0.31
759	0.33
760	0.33
761	0.37
762	0.37
763	0.32
764	0.31
765	0.25
766	0.25
767	0.22
768	0.19
769	0.15
770	0.14
771	0.18
772	0.17
773	0.16
774	0.16
775	0.18
776	0.19
777	0.19
778	0.17
779	0.12
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.09
787	0.08
788	0.08
789	0.09
790	0.09
791	0.08
792	0.08
793	0.09
794	0.09
795	0.1
796	0.11
797	0.11
798	0.11
799	0.12
800	0.13
801	0.13
802	0.16
803	0.15
804	0.16
805	0.17
806	0.18
807	0.18
808	0.19
809	0.23
810	0.21
811	0.2
812	0.18
813	0.17
814	0.15
815	0.13
816	0.12
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.08
826	0.08
827	0.07
828	0.08
829	0.1
830	0.13
831	0.14
832	0.15
833	0.18
834	0.18
835	0.2
836	0.2
837	0.18
838	0.16
839	0.17
840	0.16
841	0.17
842	0.16
843	0.15
844	0.15
845	0.16
846	0.18
847	0.18
848	0.22
849	0.2
850	0.2
851	0.25
852	0.27
853	0.28
854	0.28
855	0.25
856	0.25
857	0.23
858	0.23
859	0.18
860	0.16
861	0.13
862	0.1
863	0.09
864	0.07
865	0.07
866	0.07
867	0.1
868	0.1
869	0.18
870	0.2
871	0.24
872	0.26
873	0.27
874	0.3
875	0.33
876	0.38
877	0.31
878	0.31
879	0.29
880	0.26
881	0.25
882	0.23
883	0.18
884	0.13
885	0.11
886	0.1
887	0.1
888	0.09
889	0.15
890	0.2
891	0.2
892	0.21
893	0.21
894	0.21
895	0.22
896	0.22
897	0.16
898	0.11
899	0.12
900	0.13
901	0.16
902	0.17
903	0.16
904	0.15
905	0.15
906	0.15
907	0.15
908	0.14
909	0.11
910	0.1
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.09
915	0.07
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.05
921	0.05
922	0.04
923	0.04
924	0.04
925	0.04
926	0.03
927	0.03
928	0.03
929	0.03
930	0.03
931	0.03
932	0.04
933	0.05
934	0.05
935	0.05
936	0.06
937	0.06
938	0.06
939	0.06
940	0.06
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.06
946	0.05
947	0.06
948	0.07
949	0.1
950	0.11
951	0.13
952	0.14
953	0.14
954	0.17
955	0.19
956	0.23
957	0.21
958	0.24
959	0.24
960	0.23
961	0.22
962	0.19
963	0.18
964	0.14
965	0.14
966	0.1
967	0.08
968	0.08
969	0.09
970	0.1
971	0.11
972	0.15
973	0.17
974	0.18
975	0.19
976	0.18
977	0.17
978	0.17
979	0.16
980	0.12
981	0.1
982	0.1
983	0.09
984	0.1
985	0.11
986	0.1
987	0.09
988	0.09
989	0.1
990	0.1
991	0.13
992	0.16
993	0.21
994	0.22
995	0.24
996	0.31
997	0.32
998	0.4
999	0.46
1000	0.45
1001	0.47
1002	0.53
1003	0.57
1004	0.52
1005	0.57
1006	0.53
1007	0.53
1008	0.52
1009	0.47
1010	0.43
1011	0.4
1012	0.45
1013	0.41
1014	0.45
1015	0.44
1016	0.45
1017	0.48
1018	0.48
1019	0.47
1020	0.43
1021	0.46
1022	0.38
1023	0.32
1024	0.32
1025	0.27
1026	0.25
1027	0.26
1028	0.23
1029	0.2
1030	0.2
1031	0.21
1032	0.2
1033	0.22
1034	0.2
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.15
1038	0.2
1039	0.2
1040	0.24
1041	0.24
1042	0.31
1043	0.38
1044	0.48
1045	0.54
1046	0.55
1047	0.61
1048	0.64
1049	0.68
1050	0.64
1051	0.6
1052	0.52
1053	0.46
1054	0.42
1055	0.34
1056	0.28
1057	0.22
1058	0.19
1059	0.16
1060	0.13
1061	0.14
1062	0.12
1063	0.14
1064	0.16
1065	0.19
1066	0.2
1067	0.22
1068	0.27
1069	0.28
1070	0.33
1071	0.38
1072	0.38
1073	0.43
1074	0.48
1075	0.5
1076	0.54
1077	0.53
1078	0.51
1079	0.47
1080	0.44
1081	0.4
1082	0.4
1083	0.37
1084	0.32
1085	0.34
1086	0.31
1087	0.3
1088	0.3
1089	0.29
1090	0.27
1091	0.25
1092	0.22
1093	0.19
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.18
1097	0.17
1098	0.13
1099	0.15
1100	0.18
1101	0.21
1102	0.24
1103	0.23
1104	0.23
1105	0.27
1106	0.34
1107	0.32
1108	0.32
1109	0.32
1110	0.29
1111	0.3
1112	0.34
1113	0.33
1114	0.28
1115	0.32
1116	0.32
1117	0.3
1118	0.34
1119	0.43
1120	0.45
1121	0.45
1122	0.5
1123	0.53
1124	0.56
1125	0.6
1126	0.61
1127	0.55
1128	0.57
1129	0.62
1130	0.62
1131	0.58
1132	0.6
1133	0.65
1134	0.7
1135	0.74
1136	0.72
1137	0.72
1138	0.72
1139	0.72
1140	0.69
1141	0.63
1142	0.56
1143	0.54
1144	0.49
1145	0.44
1146	0.37
1147	0.36
1148	0.4
1149	0.41
1150	0.42
1151	0.44
1152	0.49
1153	0.53
1154	0.61
1155	0.65
1156	0.68
1157	0.68
1158	0.72
1159	0.7
1160	0.65
1161	0.62
1162	0.58
1163	0.53
1164	0.48
1165	0.46
1166	0.39
1167	0.41
1168	0.44
1169	0.44
1170	0.43
1171	0.42
1172	0.37
1173	0.37
1174	0.37
1175	0.29
1176	0.26
1177	0.26
1178	0.23
1179	0.23
1180	0.23
1181	0.23
1182	0.28
1183	0.35
1184	0.42
1185	0.42
1186	0.49
1187	0.56
1188	0.59
1189	0.56
1190	0.51
1191	0.48
1192	0.42
1193	0.44
1194	0.44
1195	0.43
1196	0.43
1197	0.44
1198	0.44
1199	0.45
1200	0.51
1201	0.51
1202	0.49
1203	0.52
1204	0.58
1205	0.62
1206	0.66
1207	0.69
1208	0.7
1209	0.72
1210	0.78
1211	0.79
1212	0.8
1213	0.84
1214	0.89

A0A4Q4YN39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer