Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8Q1C5

Protein Details
Accession J8Q1C5    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-373KRSVSNTSSSPKRKRKFGFKIVDQQPLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-182APLARRKRRR
357-361KRKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MTQETRMLPSLSVLLSGNGISSTPVSPSFISPGTNFHLDDHGAIKLPPLNTSISRPRSVESALRHTVTSQNKKSSPYGDDLLKHTHSDSALSSQLTSSQETVDESHETQPLTPQKNKKRDYSVSSKKNDILTPLSAARSIIIPPASKEKRRAFAFITHSQETFPKKEPKIDNAPLARRKRRRTSSQELSILQAEFEKCPAPTKEKRIELADCCHMTEKAIQIWFQNKRQAVKRQRIISSTSSTIIQTVSPPSPPLDVHATPLAPRIKTEVLRDDNSSCTSSPLENTPPRHNHHLKRRSSTPCMKRSQALTFHLNPQKKTLTPVKTSPNSRVNKLINSVDHSPSKVKRSVSNTSSSPKRKRKFGFKIVDQQPLKELDPNAFHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.19
16 0.18
17 0.2
18 0.19
19 0.23
20 0.25
21 0.27
22 0.26
23 0.24
24 0.25
25 0.23
26 0.24
27 0.22
28 0.18
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.19
37 0.2
38 0.28
39 0.35
40 0.37
41 0.4
42 0.39
43 0.39
44 0.38
45 0.4
46 0.39
47 0.35
48 0.38
49 0.39
50 0.39
51 0.37
52 0.36
53 0.4
54 0.44
55 0.48
56 0.47
57 0.51
58 0.52
59 0.56
60 0.58
61 0.56
62 0.49
63 0.44
64 0.42
65 0.38
66 0.38
67 0.37
68 0.39
69 0.35
70 0.32
71 0.28
72 0.26
73 0.22
74 0.2
75 0.18
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.22
97 0.28
98 0.31
99 0.37
100 0.44
101 0.52
102 0.62
103 0.66
104 0.67
105 0.68
106 0.69
107 0.7
108 0.71
109 0.71
110 0.71
111 0.7
112 0.66
113 0.6
114 0.57
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.27
119 0.26
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.21
132 0.26
133 0.28
134 0.37
135 0.4
136 0.46
137 0.48
138 0.5
139 0.43
140 0.46
141 0.49
142 0.47
143 0.48
144 0.41
145 0.39
146 0.36
147 0.38
148 0.34
149 0.3
150 0.29
151 0.32
152 0.32
153 0.4
154 0.42
155 0.45
156 0.5
157 0.5
158 0.51
159 0.48
160 0.54
161 0.55
162 0.6
163 0.63
164 0.62
165 0.66
166 0.7
167 0.72
168 0.75
169 0.75
170 0.77
171 0.77
172 0.76
173 0.72
174 0.63
175 0.56
176 0.48
177 0.38
178 0.28
179 0.21
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.07
185 0.11
186 0.13
187 0.19
188 0.24
189 0.32
190 0.39
191 0.41
192 0.43
193 0.44
194 0.46
195 0.42
196 0.4
197 0.37
198 0.3
199 0.27
200 0.26
201 0.22
202 0.19
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.23
210 0.27
211 0.29
212 0.33
213 0.32
214 0.36
215 0.43
216 0.51
217 0.54
218 0.59
219 0.62
220 0.63
221 0.64
222 0.61
223 0.58
224 0.52
225 0.46
226 0.38
227 0.32
228 0.26
229 0.23
230 0.21
231 0.17
232 0.13
233 0.1
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.15
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.19
248 0.25
249 0.26
250 0.19
251 0.19
252 0.21
253 0.24
254 0.26
255 0.3
256 0.33
257 0.34
258 0.37
259 0.39
260 0.36
261 0.34
262 0.34
263 0.31
264 0.23
265 0.2
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.19
270 0.25
271 0.29
272 0.33
273 0.4
274 0.45
275 0.5
276 0.58
277 0.63
278 0.64
279 0.7
280 0.75
281 0.74
282 0.75
283 0.79
284 0.77
285 0.77
286 0.78
287 0.77
288 0.76
289 0.75
290 0.71
291 0.67
292 0.64
293 0.62
294 0.59
295 0.54
296 0.52
297 0.48
298 0.55
299 0.58
300 0.57
301 0.5
302 0.49
303 0.48
304 0.42
305 0.46
306 0.46
307 0.46
308 0.47
309 0.52
310 0.57
311 0.6
312 0.63
313 0.65
314 0.65
315 0.63
316 0.6
317 0.62
318 0.57
319 0.54
320 0.55
321 0.52
322 0.46
323 0.47
324 0.48
325 0.44
326 0.42
327 0.4
328 0.42
329 0.41
330 0.45
331 0.44
332 0.43
333 0.46
334 0.5
335 0.57
336 0.55
337 0.56
338 0.55
339 0.58
340 0.64
341 0.66
342 0.7
343 0.71
344 0.74
345 0.77
346 0.83
347 0.86
348 0.86
349 0.87
350 0.87
351 0.86
352 0.89
353 0.86
354 0.86
355 0.76
356 0.67
357 0.6
358 0.53
359 0.46
360 0.41
361 0.35
362 0.31