Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XUM1

Protein Details
Accession A0A4Q4XUM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-139GGEKKKPSSVARPKSKPKKSETESBasic
443-462LTGLVRKKTKQEQQEQESKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-134EKKKPSSVARPKSKPKK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11.833, nucl 10, mito_nucl 6.833, cyto_pero 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEPTINDAPVLSAVPSAVASATASGAATPVSLPPLDEEEREKSVKVSLADLTAKASALYLQKNYEEAAEVYAQASEMQAELNGEMNPDNADILFLYGRSLFRVGQAKSDVLGTAGGEKKKPSSVARPKSKPKKSETESSRTDAAAGEKTEAEKAVEEGAAKIAEVAGETEVKKAQPSDAKKPLFQFTGDEDFEGSDEEEEAEGEQEEEEEDDLAVAFEVLDLARVLFEKSLNAEQEAEGKGKEKANGADSPTTRHIKERLADTHDLLAEISLENEKYSEAINDGRASLNYKLELYPKESEIIAEAHFKLSLALEFASITTTSEEAAAGGHKQLDQGLRDEAAAELEKAIESTQLKLQNQEVELATVHAPEDNEVTRQQIAEVKDLIADMEQRLVELRKPPMDVDSVLAANDPVSGILGAALGDSSEEAKARVEEAKKNATDLTGLVRKKTKQEQQEQESKPETEVAPASTEITNGASKRKAEESAEGADDEPKKPKVQEEAAVEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.11
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.27
27 0.31
28 0.32
29 0.31
30 0.26
31 0.28
32 0.3
33 0.26
34 0.24
35 0.21
36 0.24
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.2
48 0.22
49 0.23
50 0.24
51 0.24
52 0.21
53 0.19
54 0.15
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.16
90 0.24
91 0.23
92 0.26
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.27
97 0.21
98 0.14
99 0.14
100 0.09
101 0.13
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.28
109 0.28
110 0.34
111 0.44
112 0.53
113 0.62
114 0.69
115 0.78
116 0.84
117 0.88
118 0.85
119 0.81
120 0.82
121 0.76
122 0.78
123 0.74
124 0.72
125 0.67
126 0.63
127 0.57
128 0.46
129 0.41
130 0.32
131 0.27
132 0.22
133 0.18
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.14
163 0.2
164 0.25
165 0.34
166 0.42
167 0.44
168 0.46
169 0.49
170 0.48
171 0.42
172 0.37
173 0.3
174 0.25
175 0.29
176 0.26
177 0.23
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.11
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.14
232 0.15
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.23
237 0.22
238 0.24
239 0.27
240 0.27
241 0.25
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.26
246 0.28
247 0.28
248 0.31
249 0.31
250 0.29
251 0.29
252 0.25
253 0.22
254 0.17
255 0.12
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.15
341 0.21
342 0.21
343 0.23
344 0.26
345 0.26
346 0.26
347 0.27
348 0.22
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.15
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.11
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.11
375 0.11
376 0.08
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.12
382 0.15
383 0.19
384 0.24
385 0.24
386 0.26
387 0.26
388 0.27
389 0.28
390 0.26
391 0.22
392 0.2
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.13
397 0.1
398 0.09
399 0.07
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.17
420 0.21
421 0.27
422 0.33
423 0.41
424 0.4
425 0.41
426 0.4
427 0.34
428 0.3
429 0.24
430 0.26
431 0.25
432 0.26
433 0.29
434 0.34
435 0.37
436 0.44
437 0.53
438 0.54
439 0.57
440 0.67
441 0.73
442 0.76
443 0.83
444 0.79
445 0.76
446 0.72
447 0.63
448 0.53
449 0.46
450 0.37
451 0.31
452 0.29
453 0.23
454 0.21
455 0.2
456 0.22
457 0.18
458 0.18
459 0.15
460 0.15
461 0.18
462 0.17
463 0.22
464 0.24
465 0.25
466 0.29
467 0.33
468 0.34
469 0.34
470 0.39
471 0.38
472 0.38
473 0.38
474 0.35
475 0.31
476 0.33
477 0.32
478 0.29
479 0.31
480 0.29
481 0.32
482 0.33
483 0.38
484 0.41
485 0.45
486 0.5