Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PKU2

Protein Details
Accession J8PKU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-216LNELKVKKSCKNFRTKPCLNWHydrophilic
265-288RGNDRSCTKKKNLNVKVKALQRMTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0034641  P:cellular nitrogen compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MWAPLAYTRPESQKTDLTSLFSTDQGQNPLNDYQYQVNIRELEDYYNKTILKEDNIQETSSEISSAVSFSPSKQKNAIQPELLYNPQLINPFLPSASLDSSTPTVLKKKLEVQINPDYVPKSSQLPLTLQNLQQLSQQKLKSVAPSSPQKESPTQPKVKGQLQETPKQLYKTELCESFTLKGTCPYGTKCQFAHGLNELKVKKSCKNFRTKPCLNWEKLGYCPYGRRCCFKHGDDNDIAVYVKAGTYSNATSNHKQADQKRSNGRGNDRSCTKKKNLNVKVKALQRMTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.46
4 0.43
5 0.38
6 0.37
7 0.34
8 0.28
9 0.27
10 0.24
11 0.27
12 0.27
13 0.28
14 0.26
15 0.28
16 0.29
17 0.27
18 0.25
19 0.24
20 0.22
21 0.26
22 0.29
23 0.27
24 0.28
25 0.27
26 0.27
27 0.27
28 0.25
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.26
33 0.29
34 0.29
35 0.27
36 0.29
37 0.27
38 0.27
39 0.31
40 0.3
41 0.35
42 0.36
43 0.36
44 0.32
45 0.31
46 0.27
47 0.2
48 0.18
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.2
58 0.22
59 0.25
60 0.28
61 0.33
62 0.38
63 0.46
64 0.49
65 0.42
66 0.4
67 0.41
68 0.41
69 0.37
70 0.3
71 0.22
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.14
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.18
95 0.24
96 0.29
97 0.35
98 0.36
99 0.39
100 0.44
101 0.45
102 0.43
103 0.38
104 0.33
105 0.26
106 0.26
107 0.2
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.19
114 0.22
115 0.23
116 0.21
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.26
124 0.25
125 0.23
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.23
130 0.21
131 0.21
132 0.28
133 0.3
134 0.3
135 0.31
136 0.3
137 0.32
138 0.34
139 0.38
140 0.4
141 0.42
142 0.42
143 0.45
144 0.47
145 0.48
146 0.49
147 0.42
148 0.41
149 0.41
150 0.44
151 0.42
152 0.41
153 0.39
154 0.36
155 0.34
156 0.31
157 0.29
158 0.28
159 0.29
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.27
164 0.24
165 0.26
166 0.22
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.25
174 0.27
175 0.3
176 0.27
177 0.29
178 0.33
179 0.32
180 0.32
181 0.29
182 0.31
183 0.3
184 0.37
185 0.34
186 0.33
187 0.36
188 0.36
189 0.36
190 0.42
191 0.5
192 0.51
193 0.62
194 0.68
195 0.74
196 0.81
197 0.81
198 0.78
199 0.79
200 0.8
201 0.71
202 0.67
203 0.61
204 0.54
205 0.51
206 0.46
207 0.38
208 0.31
209 0.35
210 0.38
211 0.44
212 0.44
213 0.47
214 0.48
215 0.53
216 0.59
217 0.57
218 0.59
219 0.53
220 0.58
221 0.54
222 0.52
223 0.44
224 0.38
225 0.33
226 0.22
227 0.18
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.1
234 0.12
235 0.16
236 0.21
237 0.27
238 0.3
239 0.35
240 0.39
241 0.41
242 0.47
243 0.51
244 0.57
245 0.58
246 0.64
247 0.68
248 0.72
249 0.75
250 0.75
251 0.77
252 0.75
253 0.73
254 0.73
255 0.71
256 0.72
257 0.72
258 0.72
259 0.71
260 0.69
261 0.73
262 0.76
263 0.78
264 0.8
265 0.81
266 0.81
267 0.82
268 0.81
269 0.81