Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YFR0

Protein Details
Accession A0A4Q4YFR0    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-184EYDPEERRRRNEPRRYRDRAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-183RRRRNEPRRYRDRAG
188-189RR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDSMDLDIDMDLDVDLVPDEPIAPELAAEEQPGDRSDGEVAEEPDVLAPTKVHIRGLDLLKPDDVKAYIAEHFPESPFEKIEWIDDSSANLIFPSEPVAARALEALAVEPIEDVALLPPRQLLPAKRYSQMPDIALQVRLALLSDKKQAGAAQRSRFYLLNPEYDPEERRRRNEPRRYRDRAGSDYGRRRGRDFRDEEPTEPFDVNLYDDDEASLANRAARPRPVRRRSYTPESDRSEPGRTPYRNENRGKELFPEGSGSRRASRRDRSASPTRDRGGDRSMDDTSSDRPAGRNRDRARAMKSDMSRSNRSRELFPQKLKSGNGRLGDAVEDAADLMAKGITLPLMDGSSDVKTSTRSRRLEDRITIPGKGKLADRISSPGVAAADGSAFSIRGSANQKSADQGFAIKGVAGKSVKELFPDKFGSNSGKELFADRLEGRTRQRQRAGDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.11
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.22
42 0.29
43 0.33
44 0.35
45 0.32
46 0.33
47 0.33
48 0.33
49 0.29
50 0.25
51 0.22
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.05
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.14
108 0.18
109 0.2
110 0.22
111 0.31
112 0.34
113 0.36
114 0.39
115 0.41
116 0.42
117 0.42
118 0.37
119 0.3
120 0.3
121 0.29
122 0.27
123 0.23
124 0.17
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.23
137 0.31
138 0.35
139 0.37
140 0.39
141 0.4
142 0.42
143 0.4
144 0.34
145 0.34
146 0.29
147 0.28
148 0.26
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.3
153 0.28
154 0.36
155 0.35
156 0.39
157 0.47
158 0.55
159 0.64
160 0.72
161 0.76
162 0.76
163 0.82
164 0.87
165 0.82
166 0.79
167 0.74
168 0.68
169 0.64
170 0.6
171 0.58
172 0.58
173 0.61
174 0.58
175 0.53
176 0.52
177 0.53
178 0.52
179 0.54
180 0.5
181 0.47
182 0.52
183 0.53
184 0.51
185 0.47
186 0.42
187 0.34
188 0.29
189 0.24
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.17
208 0.24
209 0.33
210 0.44
211 0.51
212 0.58
213 0.61
214 0.68
215 0.7
216 0.72
217 0.71
218 0.67
219 0.67
220 0.63
221 0.61
222 0.55
223 0.5
224 0.44
225 0.36
226 0.34
227 0.34
228 0.31
229 0.31
230 0.39
231 0.45
232 0.51
233 0.55
234 0.55
235 0.53
236 0.56
237 0.53
238 0.45
239 0.39
240 0.31
241 0.27
242 0.25
243 0.19
244 0.18
245 0.2
246 0.19
247 0.2
248 0.24
249 0.28
250 0.33
251 0.4
252 0.46
253 0.5
254 0.53
255 0.56
256 0.62
257 0.65
258 0.64
259 0.62
260 0.55
261 0.53
262 0.5
263 0.45
264 0.39
265 0.35
266 0.3
267 0.27
268 0.26
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.14
276 0.15
277 0.21
278 0.3
279 0.35
280 0.43
281 0.43
282 0.52
283 0.57
284 0.6
285 0.59
286 0.55
287 0.53
288 0.51
289 0.5
290 0.49
291 0.51
292 0.52
293 0.55
294 0.52
295 0.53
296 0.52
297 0.52
298 0.48
299 0.5
300 0.53
301 0.54
302 0.57
303 0.58
304 0.56
305 0.58
306 0.57
307 0.55
308 0.51
309 0.48
310 0.44
311 0.38
312 0.35
313 0.31
314 0.29
315 0.22
316 0.15
317 0.09
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.12
341 0.19
342 0.28
343 0.36
344 0.38
345 0.43
346 0.53
347 0.6
348 0.64
349 0.64
350 0.59
351 0.59
352 0.58
353 0.56
354 0.49
355 0.45
356 0.39
357 0.34
358 0.31
359 0.29
360 0.31
361 0.3
362 0.3
363 0.31
364 0.31
365 0.3
366 0.28
367 0.22
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.07
379 0.07
380 0.12
381 0.18
382 0.2
383 0.24
384 0.27
385 0.28
386 0.31
387 0.32
388 0.28
389 0.24
390 0.23
391 0.19
392 0.18
393 0.18
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.2
401 0.25
402 0.25
403 0.27
404 0.31
405 0.28
406 0.32
407 0.36
408 0.33
409 0.29
410 0.32
411 0.34
412 0.32
413 0.35
414 0.31
415 0.29
416 0.29
417 0.3
418 0.29
419 0.24
420 0.27
421 0.23
422 0.27
423 0.29
424 0.34
425 0.38
426 0.46
427 0.54
428 0.58
429 0.66
430 0.66
431 0.69