Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q4XIX8

Protein Details
Accession A0A4Q4XIX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-398LRRLERQDRRAQRKLRKKEKREARRARREEKRARRAERRARRTADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-423ERQDRRAQRKLRKKEKREARRARREEKRARRAERRARRTADRAERREMKARGRELRREEREGRRAG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MEPRDGPPPPPYSEMDVYSPSTRPALTRRISDPGDADDDASSSRSSNIIYTPPETPRASSAHLDFPPPFGSGENSEQITDASAPAYSEPRSPASSSADATATPASATASASASAPSSTAAGPSFLAPRDARTPMPGAWEDVAASEEKRGEDAAAGNNNNHNNNTNNDNGAREMPRAAAGTTRWGNFEINSRGLRIGPLTIDGDRVAIGDSFEVNSGGVRWRGGPAGGPASVPVPGPFDNINNDRGEQRGHGFGFGCGWRGRGGGRGGWRGGPPHGFAPMGFGGAPRHPFGFPPPNVHDPHEHGHEDHTAAPRNGGLRPTRSRSVSSSASSSSSSSSSSSSSSDSDSDSSSVGSLRRLERQDRRAQRKLRKKEKREARRARREEKRARRAERRARRTADRAERREMKARGRELRREEREGRRAGTGAGPGAGVGAGAAFFSPFGPNGVGVPHMPPMPHIRTPHIPTPHIPTPHIPTPHIHTPHIPAPHIPTPHVPDMASRFRPGRCGGAGFSGGGGRGGCGPFGRRGGPFGFRTVRRGERGGWSSFPAWANDNGANDNNNATTRNDATTRSNPTTRNNSVPVPGAWPAGPATGDDKQHEQDAPPAYLNAKYEAVDRLEAEIVATADELEALWQRVEREGAEAARRGEGDWKSEKALGVARAQAEADRLEAEMERLGREVERLRLEADEEFARALVEEEAGGLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.37
4 0.37
5 0.36
6 0.33
7 0.28
8 0.26
9 0.24
10 0.24
11 0.27
12 0.33
13 0.35
14 0.4
15 0.43
16 0.48
17 0.5
18 0.49
19 0.45
20 0.39
21 0.39
22 0.33
23 0.3
24 0.23
25 0.21
26 0.19
27 0.18
28 0.14
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.13
34 0.15
35 0.18
36 0.21
37 0.24
38 0.27
39 0.3
40 0.35
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.34
47 0.34
48 0.36
49 0.36
50 0.38
51 0.35
52 0.33
53 0.31
54 0.27
55 0.25
56 0.17
57 0.2
58 0.2
59 0.24
60 0.25
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.22
65 0.21
66 0.16
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.13
73 0.12
74 0.14
75 0.17
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.25
80 0.29
81 0.3
82 0.28
83 0.28
84 0.25
85 0.22
86 0.22
87 0.2
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.13
111 0.12
112 0.17
113 0.15
114 0.19
115 0.23
116 0.25
117 0.24
118 0.25
119 0.28
120 0.24
121 0.3
122 0.27
123 0.24
124 0.22
125 0.22
126 0.19
127 0.16
128 0.16
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.16
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.26
144 0.29
145 0.3
146 0.29
147 0.26
148 0.23
149 0.25
150 0.27
151 0.25
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.24
157 0.22
158 0.2
159 0.19
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.14
165 0.13
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.2
173 0.27
174 0.24
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.17
182 0.14
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.17
226 0.19
227 0.22
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.2
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.25
256 0.22
257 0.22
258 0.2
259 0.17
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.12
271 0.14
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.18
277 0.25
278 0.25
279 0.3
280 0.34
281 0.37
282 0.39
283 0.4
284 0.37
285 0.32
286 0.34
287 0.31
288 0.27
289 0.23
290 0.23
291 0.22
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.2
304 0.25
305 0.3
306 0.32
307 0.33
308 0.34
309 0.33
310 0.36
311 0.33
312 0.29
313 0.26
314 0.23
315 0.23
316 0.21
317 0.18
318 0.14
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.17
343 0.2
344 0.26
345 0.33
346 0.4
347 0.48
348 0.55
349 0.62
350 0.65
351 0.72
352 0.75
353 0.78
354 0.82
355 0.83
356 0.84
357 0.83
358 0.85
359 0.87
360 0.88
361 0.89
362 0.89
363 0.89
364 0.9
365 0.9
366 0.89
367 0.88
368 0.87
369 0.87
370 0.86
371 0.86
372 0.84
373 0.84
374 0.84
375 0.85
376 0.85
377 0.85
378 0.83
379 0.81
380 0.77
381 0.75
382 0.72
383 0.71
384 0.7
385 0.7
386 0.65
387 0.64
388 0.65
389 0.63
390 0.65
391 0.59
392 0.56
393 0.53
394 0.56
395 0.57
396 0.56
397 0.6
398 0.6
399 0.66
400 0.64
401 0.64
402 0.65
403 0.65
404 0.66
405 0.62
406 0.55
407 0.46
408 0.41
409 0.35
410 0.29
411 0.21
412 0.14
413 0.12
414 0.1
415 0.08
416 0.08
417 0.06
418 0.04
419 0.03
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.17
442 0.21
443 0.25
444 0.25
445 0.29
446 0.35
447 0.4
448 0.45
449 0.44
450 0.4
451 0.38
452 0.44
453 0.46
454 0.41
455 0.38
456 0.34
457 0.36
458 0.4
459 0.41
460 0.33
461 0.29
462 0.34
463 0.41
464 0.41
465 0.35
466 0.31
467 0.34
468 0.38
469 0.39
470 0.33
471 0.26
472 0.29
473 0.33
474 0.32
475 0.29
476 0.28
477 0.3
478 0.32
479 0.32
480 0.26
481 0.23
482 0.28
483 0.34
484 0.32
485 0.29
486 0.3
487 0.3
488 0.34
489 0.33
490 0.31
491 0.25
492 0.25
493 0.23
494 0.23
495 0.23
496 0.19
497 0.17
498 0.13
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.06
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.14
509 0.16
510 0.18
511 0.16
512 0.2
513 0.22
514 0.27
515 0.26
516 0.29
517 0.33
518 0.32
519 0.36
520 0.39
521 0.42
522 0.41
523 0.42
524 0.38
525 0.4
526 0.43
527 0.42
528 0.37
529 0.35
530 0.32
531 0.33
532 0.31
533 0.24
534 0.22
535 0.2
536 0.22
537 0.21
538 0.22
539 0.2
540 0.2
541 0.2
542 0.18
543 0.18
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.14
548 0.16
549 0.17
550 0.19
551 0.2
552 0.21
553 0.27
554 0.32
555 0.39
556 0.41
557 0.44
558 0.45
559 0.5
560 0.57
561 0.55
562 0.54
563 0.5
564 0.47
565 0.45
566 0.44
567 0.37
568 0.32
569 0.28
570 0.24
571 0.2
572 0.19
573 0.17
574 0.15
575 0.14
576 0.11
577 0.15
578 0.18
579 0.2
580 0.21
581 0.25
582 0.25
583 0.28
584 0.28
585 0.24
586 0.26
587 0.28
588 0.28
589 0.25
590 0.25
591 0.23
592 0.24
593 0.25
594 0.22
595 0.18
596 0.17
597 0.18
598 0.21
599 0.22
600 0.21
601 0.2
602 0.19
603 0.18
604 0.18
605 0.16
606 0.13
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.07
616 0.08
617 0.09
618 0.1
619 0.11
620 0.14
621 0.15
622 0.14
623 0.15
624 0.18
625 0.21
626 0.24
627 0.27
628 0.26
629 0.27
630 0.27
631 0.24
632 0.28
633 0.27
634 0.29
635 0.31
636 0.32
637 0.32
638 0.34
639 0.34
640 0.29
641 0.33
642 0.3
643 0.28
644 0.3
645 0.27
646 0.26
647 0.26
648 0.24
649 0.21
650 0.18
651 0.15
652 0.12
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.12
657 0.14
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.14
663 0.18
664 0.21
665 0.24
666 0.28
667 0.28
668 0.29
669 0.29
670 0.3
671 0.27
672 0.26
673 0.21
674 0.18
675 0.17
676 0.15
677 0.14
678 0.12
679 0.12
680 0.09
681 0.08
682 0.07
683 0.08