Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PXC3

Protein Details
Accession J8PXC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-92QIKKLNPKKQVDQKKSKDKKKLDEYSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-86KKQVDQKKSKDKKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVKPVKKSSTKETVNKKTTEKESVQKKEEELQVQSSSSSSDEEDEKDEDDIQGLAVSDDEQDGTHQIKKLNPKKQVDQKKSKDKKKLDEYSAIIYVSRLPHGFHEKELSKYFAQFGDLREVRLARNKKTGNSRHYGFLEFVNKEDALVAQESMNNYLLMGHLLQVRLLPKGAKIEKLYKYKKRVLVEKGVTKPVKQLKENMKQKHEERINKLAKSGIEFTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.73
4 0.71
5 0.68
6 0.67
7 0.62
8 0.6
9 0.64
10 0.67
11 0.67
12 0.61
13 0.58
14 0.57
15 0.57
16 0.53
17 0.45
18 0.41
19 0.38
20 0.35
21 0.33
22 0.25
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.13
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.07
50 0.09
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.2
55 0.31
56 0.39
57 0.46
58 0.52
59 0.55
60 0.62
61 0.7
62 0.77
63 0.76
64 0.78
65 0.8
66 0.83
67 0.87
68 0.86
69 0.86
70 0.83
71 0.83
72 0.82
73 0.81
74 0.74
75 0.7
76 0.64
77 0.57
78 0.51
79 0.41
80 0.3
81 0.22
82 0.19
83 0.14
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.12
88 0.18
89 0.19
90 0.17
91 0.22
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.27
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.15
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.2
108 0.19
109 0.25
110 0.28
111 0.23
112 0.31
113 0.32
114 0.36
115 0.46
116 0.53
117 0.51
118 0.53
119 0.52
120 0.48
121 0.48
122 0.44
123 0.35
124 0.31
125 0.3
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.16
132 0.13
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.2
158 0.22
159 0.25
160 0.29
161 0.37
162 0.44
163 0.53
164 0.61
165 0.62
166 0.68
167 0.71
168 0.74
169 0.73
170 0.74
171 0.71
172 0.72
173 0.71
174 0.72
175 0.69
176 0.71
177 0.65
178 0.57
179 0.58
180 0.56
181 0.55
182 0.49
183 0.53
184 0.55
185 0.64
186 0.73
187 0.74
188 0.73
189 0.73
190 0.74
191 0.75
192 0.75
193 0.73
194 0.71
195 0.73
196 0.73
197 0.66
198 0.65
199 0.58
200 0.5
201 0.46