Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PNI7

Protein Details
Accession J8PNI7    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-39GESKNSEGKKKYRGNRHHNNRNRGKNKNETVDSKBasic
46-86EAINVNKNSKSKRNNKKRNREHYNYKRKPKSSKSTENEGYKHydrophilic
261-319ELVGTSDKVKNKNKKKKSKSGKKKFKDEEASTKLSKKKRNRGKKKRDDRDKSNTSKIKNBasic
329-351GKEVLKQRKKKMLLQEKLKQSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-77GKKKYRGNRHHNNRNRGKNKNETVDSKKNEGKVEAINVNKNSKSKRNNKKRNREHYNYKRKPKSS
269-311VKNKNKKKKSKSGKKKFKDEEASTKLSKKKRNRGKKKRDDRDK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSNLAGESKNSEGKKKYRGNRHHNNRNRGKNKNETVDSKKNEGKVEAINVNKNSKSKRNNKKRNREHYNYKRKPKSSKSTENEGYKLVIRLLPPNLTADDFFTMLRNANDGTEDKEDIQDKLKYSDWCFFEGHYSTKVFKNLTYSRCNFLFDSLSDLEKCAAFIKTCKFIDNKDNVTIPDLKLSPYVKKFTQTSKRDSVLEGTIQEDEIFKTFMNSVKQLNENDDYSFQDFSVLKSLEKEFSRSVELENKIAERTERVLTELVGTSDKVKNKNKKKKSKSGKKKFKDEEASTKLSKKKRNRGKKKRDDRDKSNTSKIKNSNIVIIEEAGKEVLKQRKKKMLLQEKLKQSSSSQPKSPSSQAQPSFESKENLSAPRVKILHRVDTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.62
3 0.67
4 0.71
5 0.8
6 0.84
7 0.87
8 0.91
9 0.92
10 0.92
11 0.94
12 0.93
13 0.93
14 0.92
15 0.9
16 0.87
17 0.87
18 0.86
19 0.84
20 0.81
21 0.78
22 0.78
23 0.79
24 0.75
25 0.72
26 0.67
27 0.62
28 0.58
29 0.52
30 0.46
31 0.4
32 0.41
33 0.4
34 0.4
35 0.42
36 0.43
37 0.46
38 0.45
39 0.47
40 0.47
41 0.5
42 0.56
43 0.6
44 0.68
45 0.74
46 0.82
47 0.88
48 0.93
49 0.94
50 0.95
51 0.95
52 0.93
53 0.93
54 0.93
55 0.94
56 0.93
57 0.92
58 0.91
59 0.88
60 0.89
61 0.88
62 0.88
63 0.86
64 0.87
65 0.83
66 0.83
67 0.83
68 0.79
69 0.7
70 0.6
71 0.51
72 0.42
73 0.37
74 0.28
75 0.22
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.22
106 0.21
107 0.2
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.27
112 0.33
113 0.3
114 0.3
115 0.29
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.25
125 0.21
126 0.2
127 0.26
128 0.3
129 0.34
130 0.4
131 0.39
132 0.4
133 0.4
134 0.42
135 0.34
136 0.29
137 0.26
138 0.18
139 0.21
140 0.18
141 0.19
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.13
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.11
151 0.14
152 0.2
153 0.21
154 0.23
155 0.23
156 0.25
157 0.33
158 0.36
159 0.36
160 0.31
161 0.32
162 0.3
163 0.32
164 0.31
165 0.22
166 0.19
167 0.16
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.24
174 0.21
175 0.25
176 0.27
177 0.32
178 0.41
179 0.41
180 0.44
181 0.47
182 0.48
183 0.46
184 0.44
185 0.37
186 0.28
187 0.25
188 0.19
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.17
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.22
209 0.21
210 0.2
211 0.19
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.18
220 0.17
221 0.15
222 0.17
223 0.19
224 0.2
225 0.2
226 0.23
227 0.18
228 0.19
229 0.22
230 0.2
231 0.21
232 0.24
233 0.25
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.12
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.17
254 0.21
255 0.27
256 0.35
257 0.45
258 0.55
259 0.66
260 0.73
261 0.8
262 0.87
263 0.9
264 0.92
265 0.93
266 0.94
267 0.94
268 0.95
269 0.93
270 0.94
271 0.9
272 0.88
273 0.87
274 0.82
275 0.81
276 0.76
277 0.72
278 0.64
279 0.63
280 0.6
281 0.58
282 0.61
283 0.61
284 0.65
285 0.7
286 0.79
287 0.85
288 0.89
289 0.93
290 0.95
291 0.96
292 0.96
293 0.97
294 0.95
295 0.93
296 0.93
297 0.91
298 0.87
299 0.86
300 0.81
301 0.74
302 0.73
303 0.69
304 0.67
305 0.64
306 0.58
307 0.54
308 0.5
309 0.47
310 0.39
311 0.34
312 0.27
313 0.2
314 0.19
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.17
319 0.25
320 0.31
321 0.39
322 0.48
323 0.58
324 0.64
325 0.71
326 0.75
327 0.77
328 0.78
329 0.8
330 0.8
331 0.8
332 0.81
333 0.75
334 0.66
335 0.58
336 0.58
337 0.59
338 0.56
339 0.52
340 0.53
341 0.56
342 0.61
343 0.64
344 0.63
345 0.6
346 0.63
347 0.63
348 0.6
349 0.6
350 0.59
351 0.59
352 0.53
353 0.48
354 0.4
355 0.42
356 0.41
357 0.4
358 0.4
359 0.41
360 0.39
361 0.44
362 0.45
363 0.4
364 0.45
365 0.48
366 0.53