Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4Y9X6

Protein Details
Accession A0A4Q4Y9X6    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-54LKFFHKLPKGTKPKEPEREPBasic
299-322ATEEKRRRREYRQMQKERFKRPEPBasic
595-618STSLAYRKSPDKTRQRLPPPAPVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-63KLPKGTKPKEPEREPSPPAPKRPP
301-320EEKRRRREYRQMQKERFKRP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MADVESSELSSLSSLSPAPSEDEGDVELKQDKGILKFFHKLPKGTKPKEPEREPSPPAPKRPPSPPHDYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDALPKSLANFGPQELERDVTESVPGQRVEQFLCAVLGLLLNRKQDVKPGHYNRALEDAISSHKNQWPRAWEEKNPLSGGNTFTTMNPTQRLTLLRTLILWTLSSSEVVKGIINKSYKQNRHEDDLNQPLSVQPWGSDSDKRRYYLIEGLDDTAFRVYRESNPQGFNRTWWSVAGNIEELNSLVDKLQRVDGGPKAKKLAQKILAAIPRFEATEEKRRRREYRQMQKERFKRPEPGFSMYEGRTRGKRIKYTYSDDEDFLTDSSNRRSTRNTGTHTPAEPAGPVTTASGRQVKAPSRMTVDASNNIVTTSPDGDNETVRSKESSVGPTGRPRRLAAVNHGTNGWSSAKPRGRSYNSMDEDEDEDESEPELGEDEEEDHVPDETEDEEEDDFDEDEEMADDEADDGSRKSHIVTMKVPTKAGAEDKESALNLDGYRYNGSESKPKSTKSAETGENNAPEERSEESIAVAPSKKRASAEPSARASGAEKNGEANADEPQLCPTTPGPLQSTSLAYRKSPDKTRQRLPPPAPVNVGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.17
15 0.15
16 0.14
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.27
21 0.29
22 0.32
23 0.39
24 0.44
25 0.5
26 0.52
27 0.54
28 0.55
29 0.62
30 0.67
31 0.66
32 0.7
33 0.7
34 0.76
35 0.8
36 0.8
37 0.77
38 0.74
39 0.77
40 0.75
41 0.75
42 0.75
43 0.71
44 0.73
45 0.75
46 0.75
47 0.73
48 0.77
49 0.76
50 0.72
51 0.75
52 0.7
53 0.65
54 0.62
55 0.57
56 0.5
57 0.49
58 0.45
59 0.36
60 0.32
61 0.27
62 0.22
63 0.21
64 0.17
65 0.09
66 0.05
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.15
72 0.18
73 0.19
74 0.21
75 0.26
76 0.25
77 0.31
78 0.33
79 0.31
80 0.3
81 0.34
82 0.33
83 0.26
84 0.27
85 0.21
86 0.24
87 0.23
88 0.25
89 0.21
90 0.22
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.15
95 0.16
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.2
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.19
119 0.25
120 0.31
121 0.34
122 0.41
123 0.48
124 0.55
125 0.58
126 0.58
127 0.53
128 0.52
129 0.45
130 0.34
131 0.27
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.23
138 0.28
139 0.29
140 0.33
141 0.35
142 0.4
143 0.49
144 0.5
145 0.52
146 0.56
147 0.58
148 0.57
149 0.51
150 0.44
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.23
155 0.2
156 0.16
157 0.16
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.22
165 0.24
166 0.22
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.18
174 0.14
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.16
187 0.17
188 0.19
189 0.28
190 0.37
191 0.43
192 0.45
193 0.53
194 0.51
195 0.55
196 0.57
197 0.52
198 0.5
199 0.52
200 0.47
201 0.38
202 0.35
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.15
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.13
211 0.19
212 0.22
213 0.3
214 0.34
215 0.35
216 0.34
217 0.32
218 0.33
219 0.33
220 0.3
221 0.24
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.2
226 0.17
227 0.13
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.12
233 0.2
234 0.25
235 0.28
236 0.32
237 0.33
238 0.37
239 0.36
240 0.33
241 0.31
242 0.27
243 0.23
244 0.2
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.17
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.16
266 0.24
267 0.25
268 0.26
269 0.27
270 0.3
271 0.33
272 0.34
273 0.37
274 0.34
275 0.34
276 0.34
277 0.37
278 0.38
279 0.35
280 0.31
281 0.24
282 0.19
283 0.17
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.24
288 0.32
289 0.39
290 0.45
291 0.51
292 0.56
293 0.61
294 0.68
295 0.69
296 0.71
297 0.75
298 0.79
299 0.81
300 0.85
301 0.86
302 0.84
303 0.8
304 0.72
305 0.7
306 0.63
307 0.64
308 0.59
309 0.56
310 0.47
311 0.42
312 0.43
313 0.34
314 0.34
315 0.27
316 0.25
317 0.22
318 0.25
319 0.29
320 0.31
321 0.36
322 0.38
323 0.45
324 0.48
325 0.53
326 0.54
327 0.53
328 0.49
329 0.43
330 0.39
331 0.31
332 0.26
333 0.19
334 0.14
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.18
339 0.18
340 0.19
341 0.23
342 0.27
343 0.35
344 0.41
345 0.43
346 0.42
347 0.46
348 0.48
349 0.46
350 0.42
351 0.33
352 0.26
353 0.21
354 0.17
355 0.12
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.11
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.21
366 0.24
367 0.3
368 0.32
369 0.31
370 0.32
371 0.33
372 0.32
373 0.32
374 0.31
375 0.27
376 0.26
377 0.24
378 0.2
379 0.18
380 0.16
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.15
390 0.17
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.17
396 0.19
397 0.2
398 0.21
399 0.24
400 0.26
401 0.34
402 0.4
403 0.4
404 0.39
405 0.37
406 0.38
407 0.41
408 0.41
409 0.41
410 0.44
411 0.42
412 0.4
413 0.39
414 0.34
415 0.28
416 0.28
417 0.22
418 0.13
419 0.13
420 0.22
421 0.28
422 0.3
423 0.35
424 0.42
425 0.45
426 0.5
427 0.55
428 0.57
429 0.54
430 0.54
431 0.5
432 0.42
433 0.38
434 0.33
435 0.26
436 0.16
437 0.14
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.12
484 0.16
485 0.2
486 0.24
487 0.32
488 0.38
489 0.4
490 0.39
491 0.35
492 0.33
493 0.32
494 0.32
495 0.27
496 0.25
497 0.26
498 0.27
499 0.28
500 0.26
501 0.24
502 0.2
503 0.19
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.17
509 0.16
510 0.18
511 0.19
512 0.22
513 0.27
514 0.29
515 0.37
516 0.4
517 0.42
518 0.45
519 0.47
520 0.51
521 0.49
522 0.53
523 0.5
524 0.5
525 0.54
526 0.53
527 0.51
528 0.47
529 0.41
530 0.34
531 0.28
532 0.25
533 0.22
534 0.2
535 0.18
536 0.16
537 0.16
538 0.2
539 0.2
540 0.22
541 0.23
542 0.21
543 0.26
544 0.28
545 0.3
546 0.28
547 0.33
548 0.37
549 0.43
550 0.51
551 0.53
552 0.55
553 0.55
554 0.53
555 0.48
556 0.43
557 0.39
558 0.36
559 0.3
560 0.26
561 0.26
562 0.26
563 0.27
564 0.25
565 0.19
566 0.17
567 0.18
568 0.18
569 0.16
570 0.19
571 0.2
572 0.19
573 0.21
574 0.18
575 0.21
576 0.22
577 0.26
578 0.26
579 0.27
580 0.3
581 0.29
582 0.33
583 0.31
584 0.35
585 0.33
586 0.31
587 0.34
588 0.39
589 0.45
590 0.5
591 0.56
592 0.61
593 0.68
594 0.76
595 0.81
596 0.84
597 0.87
598 0.83
599 0.83
600 0.78
601 0.74