Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XT18

Protein Details
Accession A0A4Q4XT18    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-229HTHPDGSKKRRSGRRRKRRWAMEAQLENCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-219SKKRRSGRRRKRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, pero 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MPASLAYNSSGSDTNPDPFLLTPILNLPPSFGSAYVGETFSCTLCANHDVPPPPDTPLSATTVASPGGAAPQTPAAQRRKYTRDVRIEAEMKTPGSGGTVQKLVLGPVGTDSDEGGDGDGNGDEETKGTDLEPGQTLQRIVNFDLKEEGNHVLAVTVSYYEATETSGRTRTFRKLYQFICKGSLIVRTKVSPLLDLDPRLHTHPDGSKKRRSGRRRKRRWAMEAQLENCSEDVMQLERVALDLEPGLRYADCNWEVSGCAKPVLHPGEVEQCCFVVEEDGDGEPGEDKDGRIVFGVLGIGWRSEMGNKGFLSTGKLGTRVAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.18
8 0.16
9 0.14
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.16
16 0.19
17 0.18
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.12
28 0.13
29 0.11
30 0.09
31 0.12
32 0.16
33 0.17
34 0.21
35 0.26
36 0.29
37 0.31
38 0.33
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.26
43 0.24
44 0.22
45 0.24
46 0.22
47 0.21
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.15
52 0.12
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.21
62 0.26
63 0.31
64 0.35
65 0.43
66 0.46
67 0.54
68 0.61
69 0.63
70 0.66
71 0.65
72 0.64
73 0.63
74 0.6
75 0.52
76 0.46
77 0.38
78 0.29
79 0.25
80 0.21
81 0.13
82 0.12
83 0.14
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.18
157 0.23
158 0.27
159 0.31
160 0.36
161 0.38
162 0.41
163 0.49
164 0.5
165 0.45
166 0.43
167 0.39
168 0.33
169 0.27
170 0.32
171 0.25
172 0.23
173 0.23
174 0.21
175 0.22
176 0.24
177 0.23
178 0.16
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.2
188 0.16
189 0.17
190 0.22
191 0.31
192 0.39
193 0.44
194 0.49
195 0.56
196 0.65
197 0.72
198 0.76
199 0.78
200 0.79
201 0.84
202 0.88
203 0.92
204 0.93
205 0.93
206 0.91
207 0.9
208 0.87
209 0.85
210 0.81
211 0.72
212 0.65
213 0.55
214 0.47
215 0.36
216 0.28
217 0.18
218 0.11
219 0.1
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.21
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.22
250 0.25
251 0.24
252 0.21
253 0.22
254 0.31
255 0.32
256 0.32
257 0.25
258 0.21
259 0.21
260 0.21
261 0.18
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.15
292 0.16
293 0.21
294 0.21
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.28
299 0.25
300 0.28
301 0.25
302 0.27