Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XVL6

Protein Details
Accession A0A4V1XVL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-246AGSGGKSKRERERKTKQLVEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-79K
85-104SRGGVKGGRGAREQGGRGGR
231-239KSKRERERK
255-313RPRGGRGGARGGARGEGRGGRGRGEGRGGEGRGEGRGEGRGEGRGGRGRGEFRGGRGGR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, cysk 5, nucl 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFALLGNDEEDDTPKAPVKTVDKTTMRSTKRNVEPQAPTKPAGNAGPRRAGPGGNEGAFRDRNAGSASNHRKPVEEVSRGGVKGGRGAREQGGRGGRYPRTRDDRQAKSFNTGNSEKQAAQSWGATDGNAEQKDEQVGEQIAQSELKEATAEDAETPAAEPEAEDKSISYAEYLAQQAEKKLALSASLEPRKPNEGSKVDKKWANAKELTKDDDDEFIAGSGGKSKRERERKTKQLVEIDQRYVEPDRPRGGRGGARGGARGEGRGGRGRGEGRGGEGRGEGRGEGRGEGRGGRGRGEFRGGRGGREGASFNAIDESAFPSLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.17
5 0.17
6 0.15
7 0.15
8 0.19
9 0.19
10 0.2
11 0.26
12 0.3
13 0.35
14 0.4
15 0.48
16 0.47
17 0.51
18 0.58
19 0.62
20 0.61
21 0.6
22 0.61
23 0.61
24 0.66
25 0.72
26 0.68
27 0.67
28 0.71
29 0.71
30 0.74
31 0.68
32 0.59
33 0.52
34 0.49
35 0.44
36 0.41
37 0.42
38 0.4
39 0.41
40 0.47
41 0.44
42 0.47
43 0.45
44 0.4
45 0.33
46 0.32
47 0.32
48 0.26
49 0.27
50 0.24
51 0.28
52 0.27
53 0.25
54 0.22
55 0.18
56 0.18
57 0.2
58 0.22
59 0.19
60 0.29
61 0.38
62 0.4
63 0.46
64 0.44
65 0.43
66 0.43
67 0.5
68 0.47
69 0.42
70 0.37
71 0.36
72 0.4
73 0.39
74 0.37
75 0.3
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.24
80 0.21
81 0.23
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.28
86 0.3
87 0.28
88 0.29
89 0.33
90 0.34
91 0.38
92 0.41
93 0.44
94 0.47
95 0.5
96 0.57
97 0.61
98 0.64
99 0.65
100 0.69
101 0.62
102 0.59
103 0.58
104 0.5
105 0.47
106 0.4
107 0.34
108 0.29
109 0.31
110 0.26
111 0.24
112 0.25
113 0.2
114 0.18
115 0.17
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.1
121 0.11
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.12
180 0.2
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.27
185 0.3
186 0.3
187 0.29
188 0.29
189 0.3
190 0.36
191 0.44
192 0.48
193 0.49
194 0.5
195 0.49
196 0.5
197 0.48
198 0.47
199 0.44
200 0.42
201 0.44
202 0.44
203 0.46
204 0.38
205 0.36
206 0.31
207 0.26
208 0.23
209 0.16
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.11
216 0.12
217 0.17
218 0.2
219 0.26
220 0.36
221 0.46
222 0.55
223 0.59
224 0.69
225 0.74
226 0.82
227 0.83
228 0.79
229 0.78
230 0.76
231 0.75
232 0.69
233 0.61
234 0.52
235 0.45
236 0.42
237 0.35
238 0.33
239 0.29
240 0.29
241 0.32
242 0.33
243 0.35
244 0.34
245 0.36
246 0.35
247 0.34
248 0.36
249 0.34
250 0.33
251 0.33
252 0.31
253 0.3
254 0.26
255 0.23
256 0.19
257 0.17
258 0.19
259 0.24
260 0.24
261 0.23
262 0.26
263 0.27
264 0.27
265 0.29
266 0.25
267 0.24
268 0.29
269 0.27
270 0.24
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.21
275 0.16
276 0.12
277 0.15
278 0.15
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.22
285 0.25
286 0.25
287 0.27
288 0.3
289 0.31
290 0.32
291 0.38
292 0.35
293 0.31
294 0.41
295 0.38
296 0.36
297 0.37
298 0.37
299 0.31
300 0.31
301 0.3
302 0.21
303 0.25
304 0.22
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.13
310 0.16
311 0.13