FuNGI

J8PND2

Protein Details

Accession

J8PND2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
305-327	KLENAIKTVKKKKKNGPGAPQGY	Hydrophilic
700-752	REGRDKFSSRRGKRDNVRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-321	NKKTGRRGKKLENAIKTVKKKKKNGP
700-765	REGRDKFSSRRGKRDNVRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQKVLRAHITKQKKKG

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito_nucl 13.166, mito 11.5, cyto_mito 7.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGRRSRAAMLPTNIILLQNLVKRDPESYQEEFLQQYAHYESLRDIFMLNGLTGSDSAVATNGLDLGKGSSMVSGTNGTTISTSTSQLIELIGFVSQVCSCFPRQTANFPSELKQLLLEHHKALPFELKEKILSCLTMLRNKDVITAEELIQSLFPLLVAYSSHGNSLGANSHAKELRKIIYTNLISLLRSCNTNGKNQKLNKSTQAVCFNLLDKPDSQGVWATKLTRELWRRGIWDDSRTVEIMTQAASHQDVKIAMSGVMFFLDADREREENFEENSEDEDGFDLDALKHKMQVNKKTGRRGKKLENAIKTVKKKKKNGPGAPQGYLNFSAIHLLRDPQGFAEKLFKEHLSGKTKNKFDMEQKISLMQLLSRLIGTHKLTVLGIYTFFLKYLTPKQRDVTRIMSACAQACHDLIPPEVISVMVRKIADEFVSDGVANEVAAAGINTIREICSRAPLAIEETLLQDLVEYKGSKAKGVNMAAKSLIALYRDVAPEMLKKKDRGKNAAMEVQGAKREGRDSKRPQFGVENSVQGIAGIELLAKWKKEHSEESEDEDAEANWEVDAGSEEGNVDGEWVTMDSDKEYDVNMEDSDDEKDNADDKEADSDLELSDDEKKEVKDEQEDKGMDSETAFREIASTRILTPADFAKLQELRNEESVAEIMGVHKQDRREQLVDASTLTGPIRYKQSREERLQKVLEGREGRDKFSSRRGKRDNVRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQKVLRAHITKQKKKGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.24
3	0.18
4	0.2
5	0.19
6	0.21
7	0.21
8	0.23
9	0.24
10	0.26
11	0.27
12	0.28
13	0.31
14	0.33
15	0.35
16	0.35
17	0.36
18	0.34
19	0.32
20	0.27
21	0.2
22	0.19
23	0.18
24	0.18
25	0.16
26	0.16
27	0.17
28	0.18
29	0.19
30	0.16
31	0.14
32	0.12
33	0.14
34	0.14
35	0.12
36	0.09
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.08
49	0.06
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.13
68	0.13
69	0.14
70	0.14
71	0.15
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.08
85	0.11
86	0.13
87	0.16
88	0.18
89	0.25
90	0.28
91	0.36
92	0.4
93	0.41
94	0.43
95	0.42
96	0.43
97	0.39
98	0.38
99	0.29
100	0.26
101	0.23
102	0.25
103	0.3
104	0.3
105	0.28
106	0.3
107	0.31
108	0.29
109	0.3
110	0.32
111	0.27
112	0.28
113	0.29
114	0.27
115	0.27
116	0.28
117	0.3
118	0.23
119	0.22
120	0.19
121	0.23
122	0.25
123	0.29
124	0.3
125	0.31
126	0.32
127	0.32
128	0.35
129	0.29
130	0.27
131	0.24
132	0.25
133	0.21
134	0.2
135	0.2
136	0.16
137	0.15
138	0.13
139	0.09
140	0.07
141	0.06
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.07
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.11
152	0.1
153	0.11
154	0.12
155	0.11
156	0.13
157	0.13
158	0.17
159	0.21
160	0.22
161	0.23
162	0.25
163	0.27
164	0.29
165	0.29
166	0.26
167	0.32
168	0.32
169	0.3
170	0.31
171	0.28
172	0.24
173	0.24
174	0.25
175	0.17
176	0.18
177	0.18
178	0.22
179	0.23
180	0.32
181	0.39
182	0.42
183	0.5
184	0.55
185	0.63
186	0.6
187	0.63
188	0.61
189	0.6
190	0.57
191	0.55
192	0.55
193	0.47
194	0.44
195	0.4
196	0.34
197	0.3
198	0.27
199	0.22
200	0.15
201	0.17
202	0.17
203	0.15
204	0.15
205	0.17
206	0.17
207	0.19
208	0.2
209	0.18
210	0.18
211	0.22
212	0.23
213	0.27
214	0.31
215	0.32
216	0.37
217	0.39
218	0.4
219	0.39
220	0.44
221	0.39
222	0.37
223	0.35
224	0.31
225	0.29
226	0.27
227	0.25
228	0.18
229	0.16
230	0.13
231	0.1
232	0.09
233	0.07
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.04
251	0.06
252	0.06
253	0.08
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.13
258	0.15
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.15
266	0.13
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.09
275	0.12
276	0.11
277	0.15
278	0.19
279	0.25
280	0.32
281	0.41
282	0.46
283	0.53
284	0.58
285	0.64
286	0.69
287	0.73
288	0.74
289	0.72
290	0.72
291	0.71
292	0.77
293	0.74
294	0.71
295	0.67
296	0.66
297	0.66
298	0.64
299	0.66
300	0.65
301	0.66
302	0.7
303	0.74
304	0.77
305	0.81
306	0.82
307	0.81
308	0.83
309	0.78
310	0.71
311	0.64
312	0.54
313	0.45
314	0.37
315	0.28
316	0.18
317	0.13
318	0.14
319	0.11
320	0.11
321	0.09
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.09
327	0.12
328	0.11
329	0.11
330	0.17
331	0.15
332	0.17
333	0.19
334	0.18
335	0.18
336	0.22
337	0.29
338	0.3
339	0.35
340	0.41
341	0.47
342	0.48
343	0.49
344	0.46
345	0.42
346	0.4
347	0.46
348	0.42
349	0.37
350	0.36
351	0.34
352	0.32
353	0.29
354	0.23
355	0.13
356	0.1
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.08
379	0.17
380	0.25
381	0.28
382	0.3
383	0.33
384	0.38
385	0.41
386	0.43
387	0.39
388	0.35
389	0.32
390	0.31
391	0.3
392	0.25
393	0.23
394	0.19
395	0.15
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.02
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.05
437	0.07
438	0.07
439	0.1
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.08
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.12
459	0.13
460	0.14
461	0.15
462	0.18
463	0.22
464	0.26
465	0.31
466	0.28
467	0.29
468	0.27
469	0.26
470	0.22
471	0.16
472	0.14
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.1
481	0.15
482	0.18
483	0.23
484	0.24
485	0.28
486	0.37
487	0.43
488	0.49
489	0.51
490	0.53
491	0.54
492	0.55
493	0.56
494	0.47
495	0.44
496	0.38
497	0.33
498	0.29
499	0.23
500	0.19
501	0.14
502	0.18
503	0.23
504	0.27
505	0.35
506	0.43
507	0.51
508	0.59
509	0.59
510	0.58
511	0.57
512	0.54
513	0.5
514	0.43
515	0.36
516	0.28
517	0.27
518	0.24
519	0.18
520	0.15
521	0.08
522	0.06
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.07
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.13
531	0.17
532	0.21
533	0.27
534	0.31
535	0.38
536	0.39
537	0.45
538	0.45
539	0.42
540	0.38
541	0.32
542	0.25
543	0.18
544	0.16
545	0.1
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.1
574	0.09
575	0.09
576	0.1
577	0.11
578	0.13
579	0.13
580	0.13
581	0.12
582	0.13
583	0.14
584	0.14
585	0.15
586	0.13
587	0.12
588	0.16
589	0.15
590	0.14
591	0.13
592	0.13
593	0.11
594	0.11
595	0.1
596	0.07
597	0.13
598	0.13
599	0.14
600	0.17
601	0.17
602	0.18
603	0.22
604	0.25
605	0.29
606	0.32
607	0.34
608	0.39
609	0.39
610	0.38
611	0.36
612	0.33
613	0.24
614	0.21
615	0.22
616	0.15
617	0.18
618	0.17
619	0.14
620	0.15
621	0.16
622	0.17
623	0.15
624	0.14
625	0.12
626	0.16
627	0.16
628	0.15
629	0.16
630	0.17
631	0.18
632	0.18
633	0.17
634	0.21
635	0.24
636	0.26
637	0.28
638	0.29
639	0.29
640	0.31
641	0.31
642	0.24
643	0.21
644	0.21
645	0.16
646	0.13
647	0.1
648	0.08
649	0.11
650	0.12
651	0.13
652	0.15
653	0.18
654	0.25
655	0.33
656	0.39
657	0.37
658	0.38
659	0.42
660	0.43
661	0.4
662	0.34
663	0.29
664	0.22
665	0.22
666	0.2
667	0.17
668	0.14
669	0.17
670	0.26
671	0.27
672	0.31
673	0.39
674	0.5
675	0.56
676	0.65
677	0.71
678	0.69
679	0.73
680	0.72
681	0.66
682	0.63
683	0.57
684	0.55
685	0.49
686	0.46
687	0.48
688	0.47
689	0.46
690	0.46
691	0.46
692	0.43
693	0.5
694	0.57
695	0.54
696	0.64
697	0.68
698	0.72
699	0.78
700	0.85
701	0.84
702	0.8
703	0.83
704	0.79
705	0.8
706	0.81
707	0.79
708	0.78
709	0.77
710	0.81
711	0.82
712	0.86
713	0.87
714	0.83
715	0.82
716	0.78
717	0.78
718	0.79
719	0.77
720	0.76
721	0.75
722	0.73
723	0.69
724	0.7
725	0.7
726	0.7
727	0.71
728	0.69
729	0.68
730	0.73
731	0.79
732	0.82
733	0.81
734	0.8
735	0.79
736	0.8
737	0.79
738	0.78
739	0.76
740	0.74
741	0.75
742	0.71
743	0.71
744	0.73
745	0.77
746	0.78

J8PND2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer