Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8LNH5

Protein Details
Accession J8LNH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-356FQGQGISLRKSNKRKPKKDHDSSKSKAPKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-355RKSNKRKPKKDHDSSKSKAPK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, cyto 9.5, cyto_mito 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004854  Ufd1-like  
IPR042299  Ufd1-like_Nn  
Gene Ontology GO:0050896  P:response to stimulus  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03152  UFD1  
Amino Acid Sequences MFSGFNSFGNGNSYVNMPQTFEEFFRCYPIVMMNDRIRKDDANFGGKIFLPPSALSRLSMLNIRYPMLFKLSANESGRVTHGGVLEFIAEEGRVYLPQWMMETLGIQPGSLLQISSADVPLGQFVKLEPQSVDFLDISDPKAVLENVLRNFSTLTVDDIIEISYNGKTFKIKILEVKPESSSKSICVIETDLVTDFAAPVGYVEPDYKAAKAQQDKEKKGASGKGQVLDPSVLEQGSMSTRIDYTGTANSIKSKQSNFIGEGQNISGKAPRKDKDLKKDVKEMKVTFDGEPAKLDLPEGQLFFGFPIVLPKDNEGSDSVAKPNEQNFQGQGISLRKSNKRKPKKDHDSSKSKAPKSPEVIEID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.2
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.23
11 0.22
12 0.26
13 0.26
14 0.23
15 0.22
16 0.26
17 0.26
18 0.26
19 0.33
20 0.35
21 0.42
22 0.43
23 0.45
24 0.43
25 0.41
26 0.4
27 0.42
28 0.4
29 0.39
30 0.38
31 0.35
32 0.35
33 0.33
34 0.32
35 0.23
36 0.18
37 0.14
38 0.14
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.19
44 0.2
45 0.19
46 0.23
47 0.21
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.16
57 0.19
58 0.22
59 0.29
60 0.3
61 0.3
62 0.27
63 0.27
64 0.28
65 0.25
66 0.22
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.17
119 0.19
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.1
141 0.11
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.13
157 0.15
158 0.16
159 0.22
160 0.26
161 0.33
162 0.34
163 0.35
164 0.32
165 0.31
166 0.32
167 0.26
168 0.22
169 0.15
170 0.18
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.12
197 0.17
198 0.22
199 0.29
200 0.36
201 0.44
202 0.47
203 0.51
204 0.5
205 0.46
206 0.45
207 0.43
208 0.38
209 0.37
210 0.37
211 0.34
212 0.32
213 0.31
214 0.28
215 0.24
216 0.2
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.16
237 0.18
238 0.21
239 0.22
240 0.22
241 0.24
242 0.27
243 0.3
244 0.3
245 0.34
246 0.35
247 0.31
248 0.31
249 0.27
250 0.25
251 0.22
252 0.2
253 0.17
254 0.18
255 0.24
256 0.3
257 0.31
258 0.37
259 0.48
260 0.56
261 0.63
262 0.68
263 0.72
264 0.7
265 0.78
266 0.78
267 0.76
268 0.75
269 0.65
270 0.6
271 0.57
272 0.53
273 0.43
274 0.42
275 0.37
276 0.29
277 0.29
278 0.25
279 0.21
280 0.18
281 0.18
282 0.14
283 0.16
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.13
291 0.09
292 0.06
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.22
299 0.22
300 0.24
301 0.19
302 0.21
303 0.22
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.23
308 0.25
309 0.27
310 0.3
311 0.28
312 0.29
313 0.28
314 0.3
315 0.29
316 0.26
317 0.28
318 0.26
319 0.27
320 0.28
321 0.35
322 0.41
323 0.51
324 0.6
325 0.66
326 0.73
327 0.81
328 0.87
329 0.91
330 0.93
331 0.94
332 0.95
333 0.94
334 0.93
335 0.87
336 0.87
337 0.85
338 0.78
339 0.73
340 0.69
341 0.68
342 0.65
343 0.66