FuNGI

A0A4Q4XJJ1

Protein Details

Accession

A0A4Q4XJJ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-44	EEEVAKRRTKGRKVVDDSDE	Acidic
48-70	VVEKKPVTRSTPRKKAVKTEVQG	Hydrophilic
210-238	PLTSKTAKKSKATPKSKKRKTPEPESEEE	Hydrophilic
240-269	DEPPSLKKPAAKKPRAPREKKPDKPESAEI	Basic
997-1027	DEDIGKDKYIKKPRAKPTKKAAGKKATKAAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-37	KGGAAPPKPPPKKAEEEVAKRRTKGRK
110-110	R
215-232	TAKKSKATPKSKKRKTPE
243-263	PSLKKPAAKKPRAPREKKPDK
402-455	GGTGKGAEKVRQKRKEEEEKIKKQAAEMEQEEKARKAEAEKVAKAAAARGAAKP
1004-1025	KYIKKPRAKPTKKAAGKKATKA
1040-1052	KPKARGRPKKVKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR003959 ATPase_AAA_core IPR001357 BRCT_dom IPR036420 BRCT_dom_sf IPR008921 DNA_pol3_clamp-load_cplx_C IPR013725 DNA_replication_fac_RFC1_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR012178 RFC1
Gene Ontology	GO:0005663 C:DNA replication factor C complex GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0003689 F:DNA clamp loader activity GO:0006281 P:DNA repair GO:0006271 P:DNA strand elongation involved in DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF00004 AAA PF00533 BRCT PF08519 RFC1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd00009 AAA cd17752 BRCT_RFC1 cd18140 HLD_clamp_RFC

Amino Acid Sequences

MPDIRSFFGPKGGAAPPKPPPKKAEEEVAKRRTKGRKVVDDSDEEEVVVEKKPVTRSTPRKKAVKTEVQGTATTASEYFASGTSKAKPAVKSEEAKAQPKPNPEVRASPRNKAASTKTDTASARKSGRISSKGRPSTALKNHDLDDDDDAFMDDADREDDIFAADAKSRNKRKNDDYAEEESEEEVLPKPKRIASRNKPTMVLDDGDDEPLTSKTAKKSKATPKSKKRKTPEPESEEEEDEPPSLKKPAAKKPRAPREKKPDKPESAEIQAILDDIPTVRPPTPPAKDPNAKFDWRKAQAGGGNSGPPPNPTGELPEGEEDCLAGLTFVFTGQLSTVSREDAQGLVKRYGGKVTGAPSSKTSYVVLGEDAGPSKLAKIREHGIKTINEEGLFELIRRLPAGGGTGKGAEKVRQKRKEEEEKIKKQAAEMEQEEKARKAEAEKVAKAAAARGAAKPAPAGATPAAQLWTVKYAPTQPSHICGNKASVEKIQNWLKNWPKHKRYDFQKRGADGMGGARAIIVSGPPGIGKTTAAHLAAKLEGYDVLETNASDARSKKLVEAGVSEVMNNTSLHGFFAADGKKVEKEKKKIVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAKFCKKTEVPLILICNERKLPKMKPFDFVAFDVKFQRPTIDQIRSRMMTVCHREGLKLSPQVLDALIEGSNRDIRQIINMLSTIKLDQTSMDFSQSKDMSKAWEKSIVLKPWDICQKMLAGGLFAPASKATLNDKIELYFNDHEFSYLMIQENYLRTKPLALNGKQYNKREQNLKALELFDQAAESISDGDLVDRMIHGPQQHWSLMPTHAVFSTVRPASFVAGQLMGSNFTSWLGNNSKYGKLARYVREIHSHMRLKSSGDHNEIRQQYLPVLWTQLIQRLAEEGRESVEDVIELMDSYYLTREDFDSIKELGVGPQDEEHVDIETQTKASFTRLYNSMSHPVPFMKASSVVAPAKASRDKPDLEEAIEDEDEAEVIEAAEPVDEEDEDIGKDKYIKKPRAKPTKKAAGKKATKAAAAAAADDDDEEEEKPKARGRPKKVKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.39
3	0.43
4	0.53
5	0.58
6	0.59
7	0.59
8	0.6
9	0.67
10	0.65
11	0.66
12	0.66
13	0.7
14	0.76
15	0.79
16	0.77
17	0.71
18	0.75
19	0.74
20	0.73
21	0.73
22	0.73
23	0.74
24	0.77
25	0.82
26	0.8
27	0.75
28	0.69
29	0.63
30	0.52
31	0.41
32	0.33
33	0.25
34	0.2
35	0.16
36	0.14
37	0.12
38	0.17
39	0.22
40	0.26
41	0.32
42	0.41
43	0.51
44	0.61
45	0.7
46	0.74
47	0.79
48	0.8
49	0.84
50	0.83
51	0.83
52	0.77
53	0.74
54	0.73
55	0.66
56	0.61
57	0.52
58	0.44
59	0.33
60	0.29
61	0.21
62	0.14
63	0.11
64	0.11
65	0.1
66	0.1
67	0.11
68	0.12
69	0.15
70	0.18
71	0.21
72	0.25
73	0.3
74	0.31
75	0.35
76	0.43
77	0.47
78	0.49
79	0.48
80	0.54
81	0.55
82	0.57
83	0.58
84	0.57
85	0.55
86	0.58
87	0.62
88	0.6
89	0.59
90	0.58
91	0.61
92	0.61
93	0.67
94	0.65
95	0.64
96	0.65
97	0.64
98	0.62
99	0.59
100	0.57
101	0.55
102	0.58
103	0.56
104	0.49
105	0.5
106	0.5
107	0.5
108	0.48
109	0.46
110	0.42
111	0.41
112	0.42
113	0.42
114	0.49
115	0.51
116	0.52
117	0.54
118	0.62
119	0.63
120	0.63
121	0.61
122	0.57
123	0.59
124	0.63
125	0.61
126	0.55
127	0.52
128	0.52
129	0.5
130	0.47
131	0.38
132	0.34
133	0.28
134	0.24
135	0.2
136	0.19
137	0.16
138	0.14
139	0.13
140	0.08
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.1
152	0.15
153	0.2
154	0.3
155	0.39
156	0.47
157	0.55
158	0.62
159	0.67
160	0.74
161	0.77
162	0.74
163	0.72
164	0.71
165	0.66
166	0.58
167	0.51
168	0.4
169	0.32
170	0.24
171	0.19
172	0.15
173	0.18
174	0.18
175	0.21
176	0.23
177	0.27
178	0.35
179	0.42
180	0.51
181	0.54
182	0.64
183	0.71
184	0.71
185	0.7
186	0.63
187	0.59
188	0.51
189	0.41
190	0.31
191	0.25
192	0.22
193	0.21
194	0.19
195	0.15
196	0.13
197	0.12
198	0.13
199	0.1
200	0.13
201	0.2
202	0.28
203	0.34
204	0.37
205	0.47
206	0.56
207	0.66
208	0.74
209	0.77
210	0.81
211	0.86
212	0.92
213	0.92
214	0.9
215	0.9
216	0.88
217	0.88
218	0.88
219	0.84
220	0.79
221	0.75
222	0.7
223	0.61
224	0.54
225	0.44
226	0.33
227	0.26
228	0.22
229	0.17
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.18
234	0.26
235	0.36
236	0.46
237	0.55
238	0.62
239	0.71
240	0.81
241	0.86
242	0.86
243	0.86
244	0.86
245	0.89
246	0.88
247	0.87
248	0.86
249	0.82
250	0.81
251	0.77
252	0.71
253	0.65
254	0.57
255	0.47
256	0.37
257	0.3
258	0.23
259	0.17
260	0.1
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.09
266	0.09
267	0.11
268	0.15
269	0.23
270	0.27
271	0.32
272	0.37
273	0.44
274	0.52
275	0.52
276	0.57
277	0.54
278	0.55
279	0.53
280	0.54
281	0.55
282	0.51
283	0.51
284	0.44
285	0.42
286	0.4
287	0.4
288	0.35
289	0.27
290	0.24
291	0.22
292	0.23
293	0.19
294	0.16
295	0.15
296	0.14
297	0.14
298	0.12
299	0.17
300	0.17
301	0.18
302	0.19
303	0.2
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.11
308	0.09
309	0.08
310	0.06
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.07
321	0.07
322	0.09
323	0.1
324	0.11
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.15
330	0.16
331	0.19
332	0.18
333	0.2
334	0.21
335	0.21
336	0.21
337	0.19
338	0.16
339	0.15
340	0.17
341	0.21
342	0.21
343	0.22
344	0.22
345	0.24
346	0.24
347	0.23
348	0.21
349	0.16
350	0.15
351	0.14
352	0.13
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.07
360	0.08
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.17
365	0.22
366	0.3
367	0.32
368	0.34
369	0.34
370	0.33
371	0.35
372	0.36
373	0.31
374	0.24
375	0.22
376	0.19
377	0.16
378	0.15
379	0.11
380	0.09
381	0.08
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.12
394	0.13
395	0.15
396	0.23
397	0.32
398	0.42
399	0.5
400	0.54
401	0.6
402	0.69
403	0.75
404	0.76
405	0.77
406	0.78
407	0.77
408	0.79
409	0.75
410	0.65
411	0.55
412	0.52
413	0.44
414	0.39
415	0.33
416	0.3
417	0.28
418	0.3
419	0.3
420	0.25
421	0.22
422	0.17
423	0.15
424	0.13
425	0.19
426	0.24
427	0.3
428	0.29
429	0.3
430	0.3
431	0.3
432	0.28
433	0.21
434	0.15
435	0.11
436	0.12
437	0.11
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.09
444	0.08
445	0.1
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.13
459	0.16
460	0.17
461	0.21
462	0.19
463	0.21
464	0.26
465	0.27
466	0.24
467	0.22
468	0.23
469	0.23
470	0.24
471	0.22
472	0.21
473	0.23
474	0.22
475	0.28
476	0.31
477	0.29
478	0.3
479	0.36
480	0.4
481	0.44
482	0.51
483	0.55
484	0.56
485	0.63
486	0.67
487	0.68
488	0.7
489	0.76
490	0.75
491	0.74
492	0.73
493	0.65
494	0.6
495	0.52
496	0.42
497	0.31
498	0.23
499	0.15
500	0.09
501	0.08
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.03
507	0.02
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.11
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.15
543	0.16
544	0.15
545	0.16
546	0.16
547	0.16
548	0.15
549	0.15
550	0.11
551	0.1
552	0.11
553	0.09
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.11
565	0.12
566	0.15
567	0.18
568	0.26
569	0.3
570	0.35
571	0.42
572	0.49
573	0.5
574	0.51
575	0.49
576	0.45
577	0.38
578	0.34
579	0.26
580	0.19
581	0.16
582	0.13
583	0.11
584	0.07
585	0.05
586	0.04
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.04
595	0.05
596	0.07
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.13
601	0.13
602	0.15
603	0.21
604	0.24
605	0.25
606	0.27
607	0.29
608	0.28
609	0.31
610	0.27
611	0.23
612	0.21
613	0.2
614	0.21
615	0.24
616	0.27
617	0.33
618	0.43
619	0.43
620	0.45
621	0.47
622	0.46
623	0.44
624	0.4
625	0.37
626	0.27
627	0.27
628	0.27
629	0.25
630	0.23
631	0.2
632	0.2
633	0.15
634	0.21
635	0.26
636	0.31
637	0.33
638	0.34
639	0.39
640	0.38
641	0.38
642	0.34
643	0.3
644	0.29
645	0.32
646	0.31
647	0.29
648	0.29
649	0.28
650	0.28
651	0.29
652	0.27
653	0.25
654	0.24
655	0.21
656	0.21
657	0.22
658	0.2
659	0.17
660	0.11
661	0.08
662	0.08
663	0.07
664	0.06
665	0.07
666	0.1
667	0.09
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.12
672	0.14
673	0.14
674	0.12
675	0.13
676	0.13
677	0.13
678	0.13
679	0.11
680	0.09
681	0.09
682	0.08
683	0.07
684	0.08
685	0.12
686	0.12
687	0.16
688	0.16
689	0.16
690	0.22
691	0.23
692	0.22
693	0.19
694	0.19
695	0.21
696	0.27
697	0.3
698	0.25
699	0.3
700	0.29
701	0.35
702	0.42
703	0.42
704	0.37
705	0.36
706	0.35
707	0.36
708	0.43
709	0.37
710	0.3
711	0.26
712	0.25
713	0.23
714	0.24
715	0.18
716	0.11
717	0.09
718	0.1
719	0.09
720	0.08
721	0.07
722	0.05
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.1
727	0.17
728	0.19
729	0.21
730	0.21
731	0.21
732	0.23
733	0.22
734	0.25
735	0.21
736	0.2
737	0.19
738	0.18
739	0.18
740	0.16
741	0.16
742	0.12
743	0.1
744	0.11
745	0.09
746	0.1
747	0.12
748	0.15
749	0.17
750	0.16
751	0.16
752	0.15
753	0.19
754	0.2
755	0.25
756	0.31
757	0.3
758	0.38
759	0.45
760	0.55
761	0.58
762	0.6
763	0.63
764	0.61
765	0.64
766	0.63
767	0.59
768	0.6
769	0.57
770	0.56
771	0.48
772	0.42
773	0.38
774	0.32
775	0.28
776	0.18
777	0.13
778	0.11
779	0.09
780	0.08
781	0.07
782	0.06
783	0.05
784	0.06
785	0.05
786	0.06
787	0.05
788	0.06
789	0.05
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.14
797	0.17
798	0.17
799	0.17
800	0.18
801	0.18
802	0.18
803	0.21
804	0.18
805	0.16
806	0.15
807	0.17
808	0.16
809	0.15
810	0.21
811	0.19
812	0.18
813	0.18
814	0.19
815	0.19
816	0.2
817	0.19
818	0.13
819	0.12
820	0.12
821	0.12
822	0.12
823	0.12
824	0.11
825	0.1
826	0.08
827	0.08
828	0.09
829	0.08
830	0.13
831	0.16
832	0.17
833	0.21
834	0.24
835	0.25
836	0.28
837	0.3
838	0.27
839	0.31
840	0.37
841	0.38
842	0.42
843	0.45
844	0.46
845	0.51
846	0.52
847	0.49
848	0.51
849	0.53
850	0.46
851	0.46
852	0.44
853	0.38
854	0.42
855	0.45
856	0.42
857	0.42
858	0.45
859	0.43
860	0.5
861	0.5
862	0.46
863	0.4
864	0.34
865	0.29
866	0.27
867	0.25
868	0.17
869	0.18
870	0.16
871	0.15
872	0.16
873	0.2
874	0.21
875	0.19
876	0.19
877	0.19
878	0.2
879	0.19
880	0.19
881	0.14
882	0.14
883	0.14
884	0.15
885	0.12
886	0.12
887	0.1
888	0.09
889	0.09
890	0.07
891	0.06
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.06
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.08
900	0.09
901	0.12
902	0.13
903	0.14
904	0.17
905	0.17
906	0.17
907	0.16
908	0.16
909	0.14
910	0.18
911	0.17
912	0.14
913	0.14
914	0.15
915	0.15
916	0.16
917	0.14
918	0.12
919	0.12
920	0.11
921	0.12
922	0.12
923	0.12
924	0.11
925	0.11
926	0.1
927	0.13
928	0.18
929	0.18
930	0.23
931	0.26
932	0.29
933	0.32
934	0.37
935	0.4
936	0.36
937	0.36
938	0.31
939	0.3
940	0.29
941	0.26
942	0.22
943	0.19
944	0.19
945	0.19
946	0.19
947	0.24
948	0.22
949	0.22
950	0.23
951	0.22
952	0.27
953	0.32
954	0.32
955	0.33
956	0.37
957	0.39
958	0.41
959	0.47
960	0.43
961	0.38
962	0.37
963	0.32
964	0.31
965	0.28
966	0.24
967	0.16
968	0.14
969	0.12
970	0.1
971	0.09
972	0.04
973	0.05
974	0.05
975	0.05
976	0.05
977	0.05
978	0.05
979	0.06
980	0.07
981	0.06
982	0.07
983	0.07
984	0.08
985	0.09
986	0.11
987	0.11
988	0.11
989	0.17
990	0.22
991	0.31
992	0.41
993	0.5
994	0.59
995	0.68
996	0.78
997	0.84
998	0.88
999	0.88
1000	0.88
1001	0.9
1002	0.89
1003	0.89
1004	0.88
1005	0.88
1006	0.88
1007	0.87
1008	0.85
1009	0.78
1010	0.7
1011	0.61
1012	0.53
1013	0.47
1014	0.38
1015	0.31
1016	0.22
1017	0.18
1018	0.16
1019	0.15
1020	0.13
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.15
1027	0.18
1028	0.23
1029	0.3
1030	0.39
1031	0.49
1032	0.58

A0A4Q4XJJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer