Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YC72

Protein Details
Accession A0A4Q4YC72    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKKSKKPEKSKVTPAAPAVHydrophilic
409-437LVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGVLDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-427GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKSKKPEKSKVTPAAPAVDNQAPPTQLMDLVESFLSDQGFNNAHREFQKHRAKNGWKSDGSSKRDNKDHTSLVSVFQAWETFSSKDGATAPKQQAIDRVTKVSSSSSSSSSSDSDSSSDESSDSDSDGDDVSMADAPAAKAESSDSSDSSSSSDSDSDSDSGSNDEAATSKAKATAAKAPKTTNPLKRKAKSDSEASSSESDSDEDMSDSSSEDERPRAKKTKTAESSDESSSETSDSDSSSDGSSSDDEAAKPKASTKAQAADSSSSSSSSESDSSSSDSNSDSDSESDAAAVASKIPLPESDSSSSSSDSESDSEDAKPASKDVTVNGTGSDTSTTLDKTSPQFGEPPLPPDPVKTNNRGKNGAKTAKTQNQPFSRIRQDVAIDPRLSSNAYVSHSWGDKAHEDLVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGVLDVHQVRSIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.73
3 0.69
4 0.59
5 0.51
6 0.46
7 0.4
8 0.35
9 0.32
10 0.32
11 0.25
12 0.25
13 0.25
14 0.2
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.13
28 0.16
29 0.17
30 0.21
31 0.2
32 0.24
33 0.27
34 0.32
35 0.33
36 0.41
37 0.51
38 0.52
39 0.58
40 0.64
41 0.71
42 0.75
43 0.8
44 0.79
45 0.7
46 0.69
47 0.72
48 0.71
49 0.68
50 0.68
51 0.65
52 0.64
53 0.69
54 0.69
55 0.66
56 0.64
57 0.61
58 0.53
59 0.52
60 0.45
61 0.4
62 0.37
63 0.3
64 0.23
65 0.19
66 0.18
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.18
76 0.21
77 0.22
78 0.3
79 0.31
80 0.34
81 0.35
82 0.34
83 0.38
84 0.37
85 0.4
86 0.33
87 0.34
88 0.29
89 0.29
90 0.29
91 0.25
92 0.23
93 0.2
94 0.2
95 0.19
96 0.22
97 0.22
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.14
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.21
165 0.27
166 0.31
167 0.33
168 0.33
169 0.36
170 0.42
171 0.47
172 0.48
173 0.49
174 0.55
175 0.62
176 0.65
177 0.68
178 0.68
179 0.68
180 0.62
181 0.6
182 0.53
183 0.48
184 0.44
185 0.4
186 0.35
187 0.27
188 0.24
189 0.18
190 0.15
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.11
204 0.16
205 0.19
206 0.24
207 0.31
208 0.31
209 0.36
210 0.4
211 0.47
212 0.47
213 0.5
214 0.48
215 0.44
216 0.46
217 0.41
218 0.37
219 0.27
220 0.22
221 0.17
222 0.14
223 0.1
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.13
244 0.18
245 0.18
246 0.21
247 0.22
248 0.27
249 0.28
250 0.3
251 0.29
252 0.25
253 0.25
254 0.24
255 0.21
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.09
290 0.12
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.19
298 0.18
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.13
330 0.15
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.31
337 0.29
338 0.31
339 0.28
340 0.3
341 0.28
342 0.29
343 0.33
344 0.34
345 0.39
346 0.43
347 0.5
348 0.55
349 0.61
350 0.65
351 0.63
352 0.64
353 0.68
354 0.68
355 0.61
356 0.6
357 0.64
358 0.66
359 0.7
360 0.66
361 0.66
362 0.64
363 0.68
364 0.65
365 0.63
366 0.63
367 0.59
368 0.53
369 0.48
370 0.44
371 0.44
372 0.47
373 0.46
374 0.38
375 0.36
376 0.36
377 0.33
378 0.31
379 0.24
380 0.19
381 0.16
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.23
386 0.24
387 0.25
388 0.24
389 0.24
390 0.23
391 0.25
392 0.24
393 0.21
394 0.21
395 0.21
396 0.24
397 0.24
398 0.22
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.27
403 0.31
404 0.37
405 0.44
406 0.55
407 0.64
408 0.73
409 0.82
410 0.85
411 0.9
412 0.91
413 0.9
414 0.9
415 0.88
416 0.86
417 0.85
418 0.81
419 0.7
420 0.61
421 0.6
422 0.53
423 0.47
424 0.4
425 0.33
426 0.28