FuNGI

A0A4Q4XDN1

Protein Details

Accession

A0A4Q4XDN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
138-157	SSDGRRNKGKKSKASENGED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-149	RRNKGKKS

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSTATTFSYAQAAKGQSTSQAAPSQSGQNQTTPAPSRSSQDIVTSTKSCSSVSSVTVPTAPDGSEFVEPASAALARPDQGSSDGEPKPFDHESVATPKEPSESTFTSEGMEKSLGEIPPPDPEKREKGSNSSPHPQDSSDGRRNKGKKSKASENGEDQGQNQDKKENSPPPQPELFEAPIPAVNVWQQRREAQAAKAKVAPPLTAQPRSPADGNVGVVASNSDQKQRSLNDAAQSSATQNKALSYSNKPQKKVAEQVRSNGDQSSRRSAPRGSRANEKESRAALDALPPVANAASWPTPETASVETKSQTHTEKYEKDGKVESVTGKSRQKWVPVPFVPTVAFNTSLPTRGGPRGGGRPGSTRVGREGASRGHQNPGVPGANGNGALPIWTMDKAADRHIQGNESDSRAASVAPQASKRAPVDNMQARETRKPATSADAPRQTGSASNNNAKPESLKHDQIDPAETNTAQSATHVTNANRQPENGAKPTGLTRDTNLQSSQETTGPLQNGVNHRPAERTRGTGRSRSGHSSSTSLPHPPQVPFTQNATGYPFQAGAPSRQASQPFSPGYSQLSYGATFPAPQAGSHRGRPNSMSVGRSTNGGRHSGGRLPVTQPVGVSYDPGMYPQPPPLFNYFDTSILGLVRAQIEYYFSIDNLCKDLFLRNRMDSQGFVLLNVITQFKRMQELTSDYNLVRYASQTSERVELVTGEDQQDRIRRREGWETWVQPMEQRDHTAQNEGPKTLIRHSAHPMTPVYSGMMHGGYPIDSPAVFSPNSATHFAPYTNGDHIPVPMTNGANGPPASESHLSAAVPEFSPAGLPGNGDTERTASIGNRDANNARKAHTTGKKHEATSPSDSGTPTQPNGSTHESSDHWHTSQAGQLITNGVNGAYEPREC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.22
4	0.26
5	0.26
6	0.25
7	0.28
8	0.27
9	0.28
10	0.3
11	0.34
12	0.33
13	0.38
14	0.36
15	0.33
16	0.35
17	0.34
18	0.39
19	0.37
20	0.36
21	0.35
22	0.34
23	0.36
24	0.39
25	0.41
26	0.34
27	0.34
28	0.36
29	0.34
30	0.39
31	0.36
32	0.32
33	0.33
34	0.33
35	0.28
36	0.26
37	0.27
38	0.24
39	0.26
40	0.29
41	0.26
42	0.26
43	0.28
44	0.26
45	0.23
46	0.21
47	0.18
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.11
57	0.11
58	0.09
59	0.08
60	0.1
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.13
65	0.12
66	0.14
67	0.17
68	0.18
69	0.24
70	0.26
71	0.26
72	0.28
73	0.27
74	0.31
75	0.3
76	0.28
77	0.23
78	0.22
79	0.26
80	0.32
81	0.34
82	0.3
83	0.29
84	0.29
85	0.29
86	0.27
87	0.25
88	0.24
89	0.23
90	0.26
91	0.27
92	0.27
93	0.25
94	0.28
95	0.25
96	0.21
97	0.19
98	0.15
99	0.16
100	0.21
101	0.19
102	0.17
103	0.19
104	0.17
105	0.25
106	0.29
107	0.28
108	0.27
109	0.33
110	0.4
111	0.43
112	0.5
113	0.46
114	0.5
115	0.58
116	0.63
117	0.64
118	0.66
119	0.64
120	0.59
121	0.58
122	0.5
123	0.45
124	0.44
125	0.46
126	0.46
127	0.48
128	0.49
129	0.56
130	0.59
131	0.66
132	0.68
133	0.68
134	0.69
135	0.72
136	0.79
137	0.79
138	0.83
139	0.79
140	0.76
141	0.7
142	0.64
143	0.55
144	0.45
145	0.44
146	0.42
147	0.38
148	0.32
149	0.34
150	0.32
151	0.37
152	0.45
153	0.45
154	0.45
155	0.52
156	0.55
157	0.56
158	0.59
159	0.55
160	0.49
161	0.46
162	0.42
163	0.33
164	0.29
165	0.24
166	0.21
167	0.21
168	0.18
169	0.12
170	0.14
171	0.21
172	0.23
173	0.26
174	0.27
175	0.29
176	0.33
177	0.38
178	0.37
179	0.37
180	0.42
181	0.41
182	0.42
183	0.44
184	0.41
185	0.39
186	0.36
187	0.3
188	0.25
189	0.31
190	0.35
191	0.34
192	0.33
193	0.35
194	0.36
195	0.38
196	0.36
197	0.29
198	0.26
199	0.24
200	0.24
201	0.2
202	0.17
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.09
207	0.11
208	0.11
209	0.16
210	0.17
211	0.18
212	0.23
213	0.24
214	0.3
215	0.31
216	0.33
217	0.33
218	0.33
219	0.33
220	0.29
221	0.28
222	0.23
223	0.22
224	0.2
225	0.16
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.18
230	0.21
231	0.24
232	0.33
233	0.42
234	0.47
235	0.48
236	0.51
237	0.55
238	0.57
239	0.6
240	0.59
241	0.61
242	0.57
243	0.61
244	0.63
245	0.58
246	0.52
247	0.44
248	0.39
249	0.33
250	0.35
251	0.37
252	0.35
253	0.34
254	0.36
255	0.39
256	0.43
257	0.48
258	0.52
259	0.47
260	0.54
261	0.57
262	0.63
263	0.63
264	0.58
265	0.53
266	0.45
267	0.44
268	0.36
269	0.32
270	0.24
271	0.22
272	0.2
273	0.17
274	0.15
275	0.13
276	0.11
277	0.1
278	0.09
279	0.06
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.11
287	0.13
288	0.13
289	0.15
290	0.16
291	0.16
292	0.17
293	0.17
294	0.19
295	0.2
296	0.2
297	0.19
298	0.23
299	0.28
300	0.3
301	0.34
302	0.42
303	0.39
304	0.39
305	0.39
306	0.36
307	0.31
308	0.31
309	0.27
310	0.22
311	0.25
312	0.28
313	0.31
314	0.32
315	0.37
316	0.38
317	0.42
318	0.44
319	0.46
320	0.49
321	0.46
322	0.49
323	0.42
324	0.42
325	0.36
326	0.3
327	0.26
328	0.19
329	0.18
330	0.13
331	0.15
332	0.13
333	0.14
334	0.14
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.16
339	0.15
340	0.17
341	0.21
342	0.23
343	0.24
344	0.23
345	0.25
346	0.27
347	0.3
348	0.27
349	0.23
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.21
354	0.2
355	0.18
356	0.2
357	0.23
358	0.22
359	0.23
360	0.24
361	0.22
362	0.2
363	0.22
364	0.19
365	0.16
366	0.15
367	0.13
368	0.12
369	0.12
370	0.11
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.09
381	0.1
382	0.13
383	0.16
384	0.17
385	0.2
386	0.2
387	0.21
388	0.18
389	0.21
390	0.19
391	0.17
392	0.16
393	0.13
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.08
398	0.09
399	0.1
400	0.11
401	0.12
402	0.14
403	0.14
404	0.17
405	0.18
406	0.18
407	0.17
408	0.18
409	0.25
410	0.29
411	0.3
412	0.29
413	0.32
414	0.32
415	0.33
416	0.32
417	0.27
418	0.22
419	0.22
420	0.21
421	0.22
422	0.27
423	0.28
424	0.33
425	0.36
426	0.36
427	0.34
428	0.33
429	0.28
430	0.24
431	0.23
432	0.22
433	0.2
434	0.24
435	0.26
436	0.27
437	0.27
438	0.25
439	0.23
440	0.19
441	0.23
442	0.22
443	0.23
444	0.23
445	0.25
446	0.27
447	0.26
448	0.27
449	0.21
450	0.18
451	0.16
452	0.15
453	0.12
454	0.11
455	0.1
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.07
460	0.1
461	0.13
462	0.13
463	0.2
464	0.24
465	0.3
466	0.28
467	0.27
468	0.27
469	0.29
470	0.33
471	0.28
472	0.25
473	0.19
474	0.2
475	0.21
476	0.21
477	0.19
478	0.15
479	0.14
480	0.2
481	0.21
482	0.23
483	0.21
484	0.2
485	0.18
486	0.19
487	0.2
488	0.13
489	0.13
490	0.12
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.15
496	0.18
497	0.2
498	0.24
499	0.22
500	0.22
501	0.25
502	0.26
503	0.29
504	0.26
505	0.28
506	0.27
507	0.35
508	0.37
509	0.39
510	0.41
511	0.39
512	0.41
513	0.42
514	0.4
515	0.34
516	0.33
517	0.3
518	0.28
519	0.26
520	0.25
521	0.22
522	0.2
523	0.21
524	0.22
525	0.2
526	0.23
527	0.23
528	0.24
529	0.24
530	0.27
531	0.27
532	0.24
533	0.24
534	0.25
535	0.23
536	0.2
537	0.19
538	0.16
539	0.12
540	0.15
541	0.15
542	0.12
543	0.16
544	0.16
545	0.17
546	0.18
547	0.2
548	0.21
549	0.22
550	0.25
551	0.21
552	0.22
553	0.22
554	0.21
555	0.22
556	0.19
557	0.18
558	0.14
559	0.14
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.11
567	0.1
568	0.1
569	0.13
570	0.19
571	0.23
572	0.28
573	0.35
574	0.33
575	0.34
576	0.35
577	0.35
578	0.35
579	0.35
580	0.31
581	0.26
582	0.28
583	0.27
584	0.28
585	0.25
586	0.21
587	0.2
588	0.21
589	0.2
590	0.18
591	0.21
592	0.23
593	0.25
594	0.23
595	0.23
596	0.23
597	0.26
598	0.26
599	0.23
600	0.19
601	0.17
602	0.18
603	0.16
604	0.15
605	0.11
606	0.11
607	0.1
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.11
612	0.16
613	0.19
614	0.18
615	0.21
616	0.24
617	0.26
618	0.26
619	0.31
620	0.26
621	0.24
622	0.24
623	0.21
624	0.18
625	0.14
626	0.13
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.08
634	0.09
635	0.11
636	0.1
637	0.09
638	0.11
639	0.12
640	0.13
641	0.14
642	0.13
643	0.11
644	0.12
645	0.19
646	0.22
647	0.27
648	0.31
649	0.3
650	0.33
651	0.36
652	0.36
653	0.3
654	0.27
655	0.28
656	0.23
657	0.2
658	0.18
659	0.15
660	0.14
661	0.15
662	0.15
663	0.08
664	0.1
665	0.12
666	0.11
667	0.16
668	0.16
669	0.16
670	0.18
671	0.23
672	0.26
673	0.27
674	0.29
675	0.25
676	0.26
677	0.25
678	0.22
679	0.17
680	0.14
681	0.14
682	0.14
683	0.18
684	0.19
685	0.2
686	0.22
687	0.22
688	0.21
689	0.19
690	0.16
691	0.16
692	0.16
693	0.16
694	0.16
695	0.16
696	0.16
697	0.2
698	0.26
699	0.27
700	0.28
701	0.32
702	0.33
703	0.37
704	0.46
705	0.46
706	0.46
707	0.51
708	0.5
709	0.5
710	0.49
711	0.44
712	0.37
713	0.38
714	0.36
715	0.29
716	0.3
717	0.29
718	0.32
719	0.33
720	0.35
721	0.33
722	0.37
723	0.38
724	0.34
725	0.32
726	0.29
727	0.31
728	0.29
729	0.36
730	0.3
731	0.32
732	0.38
733	0.44
734	0.43
735	0.43
736	0.41
737	0.34
738	0.33
739	0.29
740	0.24
741	0.17
742	0.16
743	0.14
744	0.13
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.07
753	0.09
754	0.1
755	0.12
756	0.12
757	0.12
758	0.15
759	0.17
760	0.21
761	0.22
762	0.21
763	0.2
764	0.22
765	0.22
766	0.22
767	0.21
768	0.2
769	0.21
770	0.21
771	0.21
772	0.2
773	0.2
774	0.21
775	0.18
776	0.18
777	0.17
778	0.17
779	0.17
780	0.17
781	0.17
782	0.19
783	0.19
784	0.17
785	0.15
786	0.15
787	0.19
788	0.2
789	0.2
790	0.17
791	0.2
792	0.18
793	0.19
794	0.2
795	0.16
796	0.15
797	0.15
798	0.12
799	0.1
800	0.11
801	0.1
802	0.12
803	0.1
804	0.1
805	0.11
806	0.15
807	0.16
808	0.16
809	0.16
810	0.15
811	0.15
812	0.16
813	0.16
814	0.13
815	0.17
816	0.23
817	0.27
818	0.27
819	0.31
820	0.36
821	0.42
822	0.47
823	0.44
824	0.4
825	0.4
826	0.42
827	0.47
828	0.51
829	0.53
830	0.55
831	0.64
832	0.67
833	0.64
834	0.68
835	0.63
836	0.6
837	0.58
838	0.53
839	0.45
840	0.42
841	0.41
842	0.36
843	0.37
844	0.35
845	0.29
846	0.3
847	0.3
848	0.3
849	0.35
850	0.39
851	0.35
852	0.32
853	0.34
854	0.31
855	0.33
856	0.38
857	0.37
858	0.3
859	0.3
860	0.3
861	0.28
862	0.31
863	0.31
864	0.25
865	0.21
866	0.22
867	0.23
868	0.21
869	0.2
870	0.16
871	0.12
872	0.11
873	0.1
874	0.13

A0A4Q4XDN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer