Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4Y1F5

Protein Details
Accession A0A4Q4Y1F5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-300LKKMETAAAKQKPKRRGNRGSKPQQNVHMSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-291LKKMETAAAKQKPKRRGNRGSK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSNLAASSKLGPGTKRLAPPSPSPSNASNASRTDGTPSKRQKRDGVVAASVRDNNRGASPTPTPAAMAAANTSYGNDMLTHLSYAVDFLKSKGAPKTLQEILDHLSLQHTPESQQQQFAALMRKHPRMQFTPAPRPKDGNKDKQQQQLSWKLGKYEFRPKIPGVKSKVSLLEHLQAKTDASALAVKDLKDGWPDCDQAIDELEAEHRILVVRTRKENHAKFIWIDDPRLAHRVDPEFKAMWHRVEVPGVDDIVRKLTAVGQKPASEDPRLKKMETAAAKQKPKRRGNRGSKPQQNVHMSHLLQDYSSHRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.39
3 0.42
4 0.46
5 0.47
6 0.54
7 0.57
8 0.58
9 0.55
10 0.53
11 0.5
12 0.48
13 0.49
14 0.46
15 0.42
16 0.37
17 0.38
18 0.35
19 0.33
20 0.34
21 0.35
22 0.36
23 0.41
24 0.5
25 0.57
26 0.62
27 0.67
28 0.68
29 0.7
30 0.74
31 0.72
32 0.66
33 0.62
34 0.58
35 0.54
36 0.49
37 0.44
38 0.36
39 0.31
40 0.27
41 0.22
42 0.22
43 0.23
44 0.21
45 0.22
46 0.24
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.21
51 0.19
52 0.19
53 0.14
54 0.12
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.14
77 0.14
78 0.18
79 0.2
80 0.23
81 0.23
82 0.25
83 0.31
84 0.29
85 0.3
86 0.27
87 0.26
88 0.24
89 0.24
90 0.21
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.09
97 0.09
98 0.16
99 0.23
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.25
107 0.19
108 0.25
109 0.29
110 0.33
111 0.36
112 0.37
113 0.4
114 0.37
115 0.43
116 0.44
117 0.47
118 0.53
119 0.56
120 0.58
121 0.54
122 0.54
123 0.51
124 0.55
125 0.54
126 0.54
127 0.57
128 0.61
129 0.66
130 0.71
131 0.7
132 0.62
133 0.6
134 0.58
135 0.53
136 0.47
137 0.41
138 0.36
139 0.36
140 0.37
141 0.34
142 0.37
143 0.37
144 0.35
145 0.38
146 0.36
147 0.43
148 0.43
149 0.46
150 0.41
151 0.41
152 0.4
153 0.39
154 0.42
155 0.34
156 0.32
157 0.27
158 0.27
159 0.26
160 0.25
161 0.24
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.15
166 0.08
167 0.06
168 0.08
169 0.07
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.16
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.11
197 0.18
198 0.22
199 0.28
200 0.31
201 0.39
202 0.49
203 0.52
204 0.53
205 0.5
206 0.48
207 0.43
208 0.43
209 0.42
210 0.34
211 0.32
212 0.27
213 0.25
214 0.25
215 0.27
216 0.23
217 0.18
218 0.21
219 0.27
220 0.29
221 0.29
222 0.3
223 0.28
224 0.29
225 0.35
226 0.33
227 0.28
228 0.26
229 0.27
230 0.24
231 0.26
232 0.25
233 0.2
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.15
244 0.21
245 0.24
246 0.29
247 0.3
248 0.31
249 0.34
250 0.39
251 0.38
252 0.36
253 0.39
254 0.4
255 0.46
256 0.48
257 0.46
258 0.44
259 0.43
260 0.47
261 0.46
262 0.48
263 0.49
264 0.54
265 0.63
266 0.68
267 0.72
268 0.74
269 0.78
270 0.81
271 0.81
272 0.84
273 0.86
274 0.9
275 0.93
276 0.93
277 0.93
278 0.91
279 0.87
280 0.85
281 0.81
282 0.73
283 0.68
284 0.65
285 0.55
286 0.51
287 0.47
288 0.38
289 0.31
290 0.31
291 0.31