FuNGI

J8LJT6

Protein Details

Accession

J8LJT6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-27	VAYHHSKPKRQLSQGHYPTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MRPRSRGVAYHHSKPKRQLSQGHYPTAPNDGQRRKGSNSATFHSFDIWKNLDKVRSTRKDATQIIKNSLLILPVRTQAKQQFEECMNELHKYISKDILQCNMQRAREGENALFYVVLKGFSILDSCFVLSVLLALQKRFWVASSEKSYFRVSKNINLTGSFYLPKNIERGKGHILTSYRREFSTSSIVEVSFNDVPNFQQFHIEACHVDKFMNELSNFISQIEFGKCEGSVTDRFQREYKRNYSQISLAVYELPLIGDGLFDMKSYINKTRPIIETSKTQMEKHVTELKAYNEINDIEGALSPQSQQPLPSSSSSNTTSQSKGFQAGAVSYQSQSQKYSAGKPTNALKSSNRYAGPNNQINGRNTEGLKPGFMTQEEIKRHCIATVKASMDTVKKTSSYQILKTYVRCPRQNYIDIVYQSLNDLRSKTNCNIVVLNLNNLHESQPWLESLNVADYSAFSQQPHPSTVRVISIGGVGEYIVKALELVLDILEH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.79
3	0.78
4	0.79
5	0.79
6	0.77
7	0.8
8	0.8
9	0.77
10	0.69
11	0.6
12	0.53
13	0.5
14	0.45
15	0.4
16	0.43
17	0.44
18	0.5
19	0.56
20	0.6
21	0.59
22	0.64
23	0.64
24	0.63
25	0.61
26	0.58
27	0.56
28	0.52
29	0.47
30	0.44
31	0.4
32	0.33
33	0.34
34	0.32
35	0.31
36	0.33
37	0.37
38	0.39
39	0.4
40	0.46
41	0.5
42	0.55
43	0.6
44	0.64
45	0.66
46	0.7
47	0.72
48	0.72
49	0.7
50	0.66
51	0.63
52	0.58
53	0.51
54	0.44
55	0.38
56	0.32
57	0.24
58	0.22
59	0.18
60	0.21
61	0.23
62	0.22
63	0.27
64	0.31
65	0.37
66	0.39
67	0.39
68	0.4
69	0.4
70	0.44
71	0.39
72	0.38
73	0.32
74	0.29
75	0.28
76	0.24
77	0.26
78	0.24
79	0.25
80	0.25
81	0.28
82	0.31
83	0.34
84	0.37
85	0.37
86	0.37
87	0.43
88	0.43
89	0.4
90	0.38
91	0.36
92	0.36
93	0.37
94	0.37
95	0.31
96	0.27
97	0.26
98	0.24
99	0.22
100	0.16
101	0.14
102	0.11
103	0.1
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.1
109	0.07
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.07
116	0.06
117	0.06
118	0.05
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.14
129	0.22
130	0.28
131	0.31
132	0.32
133	0.35
134	0.38
135	0.37
136	0.36
137	0.37
138	0.32
139	0.37
140	0.42
141	0.43
142	0.41
143	0.38
144	0.38
145	0.31
146	0.31
147	0.25
148	0.19
149	0.17
150	0.17
151	0.17
152	0.2
153	0.21
154	0.25
155	0.25
156	0.29
157	0.32
158	0.34
159	0.33
160	0.32
161	0.32
162	0.31
163	0.36
164	0.36
165	0.31
166	0.28
167	0.3
168	0.26
169	0.27
170	0.31
171	0.25
172	0.22
173	0.21
174	0.21
175	0.2
176	0.19
177	0.2
178	0.14
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.12
183	0.15
184	0.17
185	0.12
186	0.13
187	0.13
188	0.14
189	0.16
190	0.16
191	0.13
192	0.13
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.15
200	0.13
201	0.12
202	0.14
203	0.15
204	0.15
205	0.13
206	0.12
207	0.08
208	0.11
209	0.11
210	0.09
211	0.08
212	0.09
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.14
219	0.21
220	0.21
221	0.23
222	0.26
223	0.32
224	0.35
225	0.39
226	0.43
227	0.43
228	0.46
229	0.47
230	0.46
231	0.41
232	0.37
233	0.32
234	0.25
235	0.18
236	0.14
237	0.13
238	0.11
239	0.09
240	0.06
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.06
252	0.09
253	0.14
254	0.17
255	0.21
256	0.22
257	0.26
258	0.28
259	0.31
260	0.31
261	0.29
262	0.3
263	0.3
264	0.37
265	0.33
266	0.31
267	0.31
268	0.32
269	0.31
270	0.31
271	0.35
272	0.28
273	0.28
274	0.3
275	0.27
276	0.29
277	0.28
278	0.24
279	0.18
280	0.18
281	0.17
282	0.14
283	0.13
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.11
295	0.14
296	0.16
297	0.17
298	0.18
299	0.17
300	0.21
301	0.23
302	0.23
303	0.23
304	0.23
305	0.23
306	0.22
307	0.24
308	0.21
309	0.2
310	0.19
311	0.17
312	0.15
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.12
317	0.1
318	0.14
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.16
323	0.2
324	0.22
325	0.28
326	0.32
327	0.35
328	0.35
329	0.37
330	0.44
331	0.47
332	0.46
333	0.42
334	0.38
335	0.4
336	0.44
337	0.46
338	0.4
339	0.35
340	0.37
341	0.42
342	0.47
343	0.45
344	0.42
345	0.43
346	0.47
347	0.46
348	0.46
349	0.41
350	0.35
351	0.31
352	0.33
353	0.32
354	0.27
355	0.26
356	0.23
357	0.21
358	0.2
359	0.19
360	0.2
361	0.19
362	0.27
363	0.31
364	0.32
365	0.35
366	0.34
367	0.34
368	0.32
369	0.33
370	0.27
371	0.28
372	0.33
373	0.31
374	0.3
375	0.3
376	0.31
377	0.29
378	0.3
379	0.26
380	0.21
381	0.2
382	0.21
383	0.25
384	0.31
385	0.33
386	0.34
387	0.39
388	0.43
389	0.46
390	0.48
391	0.52
392	0.52
393	0.55
394	0.56
395	0.55
396	0.57
397	0.62
398	0.63
399	0.59
400	0.55
401	0.54
402	0.49
403	0.46
404	0.38
405	0.3
406	0.27
407	0.25
408	0.22
409	0.17
410	0.18
411	0.2
412	0.24
413	0.3
414	0.31
415	0.37
416	0.37
417	0.38
418	0.38
419	0.35
420	0.39
421	0.34
422	0.37
423	0.31
424	0.29
425	0.27
426	0.26
427	0.25
428	0.19
429	0.2
430	0.17
431	0.16
432	0.16
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.17
438	0.15
439	0.14
440	0.13
441	0.12
442	0.14
443	0.17
444	0.17
445	0.14
446	0.19
447	0.24
448	0.27
449	0.31
450	0.31
451	0.29
452	0.32
453	0.34
454	0.32
455	0.28
456	0.25
457	0.21
458	0.21
459	0.19
460	0.15
461	0.12
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.05
472	0.06

J8LJT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer