Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PMD9

Protein Details
Accession J8PMD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-114VTAAVQSVRRNRKRSKKRYALSIANGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-106RRNRKRSKKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MNGPPTFTQYRINKFSGNGATHKIRELLNFNDEKKWKQFSSRRLELIDKFQLSQYKASEQDQNIKQIATILRTEFGYPVSCSKEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSKKRYALSIANGGDANNSISSNSTSDDEISPSIYQHSNSEFSQSANPTADFQFSNKFQPLMSHQNNTINNNNGPILQNLYGQNDLSPPVTSTQQKYNDIVTMLVHDLVTNVVPLSEQALKDPYTGPNLSHFTTSSFGQQPNITTSIPIDSTVPFFLREKLLLQIQRSRTCQDISQAAGSIDLYANLEILGEMSIRMSIAFVIERFFSNMVSSSMKYITSKTCSPENLALLSQRLFGSATRHNLSHFPAAQVQLRLLYLVIGGIVKDFGFDPTLYPLSEIIHHIVMAQYPLASSCASTSLHKRVKRSPPAVASDMMMNNNTLSNRVTLLTTLPMKPQSANQDVNRRVLIKFNDHEQAFTFHQLSNGPPTVSEILENCKNLFNIVNKNKNFGIFHNDNLINDETLARLFDSFSTSEIRLTIKDISTIPLQDTKIPAPITLPKMSCIGENHPMSSIPLVSHENDDTKKSSLTAFDNIINRISKSPMNEDNNNTTLNTGTVNTNNNDQSEPVPVPYVTKNKNSFQNGNLPQPVFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.54
3 0.52
4 0.48
5 0.43
6 0.44
7 0.47
8 0.45
9 0.46
10 0.41
11 0.35
12 0.36
13 0.38
14 0.36
15 0.39
16 0.43
17 0.43
18 0.49
19 0.5
20 0.5
21 0.52
22 0.54
23 0.48
24 0.53
25 0.6
26 0.61
27 0.68
28 0.7
29 0.68
30 0.65
31 0.69
32 0.63
33 0.63
34 0.61
35 0.53
36 0.46
37 0.45
38 0.46
39 0.42
40 0.42
41 0.36
42 0.34
43 0.35
44 0.37
45 0.42
46 0.39
47 0.47
48 0.46
49 0.49
50 0.45
51 0.41
52 0.38
53 0.36
54 0.35
55 0.28
56 0.27
57 0.22
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.16
65 0.19
66 0.24
67 0.23
68 0.25
69 0.27
70 0.33
71 0.31
72 0.32
73 0.32
74 0.26
75 0.28
76 0.27
77 0.25
78 0.2
79 0.23
80 0.26
81 0.27
82 0.35
83 0.44
84 0.51
85 0.59
86 0.66
87 0.73
88 0.8
89 0.86
90 0.88
91 0.88
92 0.86
93 0.89
94 0.87
95 0.85
96 0.79
97 0.76
98 0.65
99 0.56
100 0.5
101 0.39
102 0.3
103 0.22
104 0.18
105 0.1
106 0.1
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.23
129 0.2
130 0.21
131 0.25
132 0.24
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.22
139 0.17
140 0.17
141 0.21
142 0.21
143 0.25
144 0.24
145 0.24
146 0.21
147 0.24
148 0.29
149 0.33
150 0.36
151 0.34
152 0.35
153 0.43
154 0.46
155 0.47
156 0.45
157 0.39
158 0.36
159 0.34
160 0.32
161 0.26
162 0.24
163 0.2
164 0.19
165 0.15
166 0.18
167 0.17
168 0.19
169 0.18
170 0.17
171 0.17
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.1
178 0.14
179 0.17
180 0.19
181 0.26
182 0.31
183 0.34
184 0.34
185 0.34
186 0.32
187 0.29
188 0.27
189 0.19
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.2
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.22
231 0.17
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.26
253 0.3
254 0.34
255 0.35
256 0.34
257 0.32
258 0.3
259 0.29
260 0.25
261 0.22
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.17
309 0.18
310 0.21
311 0.21
312 0.23
313 0.24
314 0.22
315 0.19
316 0.18
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.12
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.12
326 0.15
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.2
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.2
335 0.17
336 0.18
337 0.2
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.13
342 0.12
343 0.11
344 0.09
345 0.07
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.07
384 0.08
385 0.11
386 0.15
387 0.24
388 0.31
389 0.34
390 0.38
391 0.46
392 0.55
393 0.63
394 0.63
395 0.6
396 0.58
397 0.61
398 0.59
399 0.5
400 0.4
401 0.33
402 0.3
403 0.24
404 0.18
405 0.13
406 0.11
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.13
418 0.15
419 0.15
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.19
424 0.22
425 0.26
426 0.29
427 0.34
428 0.37
429 0.45
430 0.46
431 0.48
432 0.46
433 0.4
434 0.35
435 0.35
436 0.33
437 0.3
438 0.3
439 0.31
440 0.36
441 0.34
442 0.34
443 0.3
444 0.31
445 0.25
446 0.26
447 0.23
448 0.17
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.16
456 0.19
457 0.19
458 0.19
459 0.18
460 0.14
461 0.17
462 0.21
463 0.22
464 0.2
465 0.2
466 0.2
467 0.2
468 0.23
469 0.22
470 0.29
471 0.38
472 0.46
473 0.44
474 0.48
475 0.48
476 0.48
477 0.45
478 0.36
479 0.36
480 0.29
481 0.3
482 0.34
483 0.34
484 0.3
485 0.32
486 0.31
487 0.22
488 0.2
489 0.19
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.08
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.16
504 0.16
505 0.14
506 0.16
507 0.19
508 0.16
509 0.18
510 0.18
511 0.2
512 0.21
513 0.21
514 0.21
515 0.22
516 0.23
517 0.23
518 0.26
519 0.24
520 0.27
521 0.26
522 0.24
523 0.22
524 0.28
525 0.31
526 0.33
527 0.33
528 0.29
529 0.31
530 0.32
531 0.32
532 0.28
533 0.28
534 0.31
535 0.32
536 0.32
537 0.3
538 0.3
539 0.28
540 0.25
541 0.21
542 0.12
543 0.14
544 0.16
545 0.16
546 0.19
547 0.2
548 0.24
549 0.25
550 0.28
551 0.28
552 0.27
553 0.27
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.26
558 0.27
559 0.27
560 0.3
561 0.33
562 0.33
563 0.35
564 0.32
565 0.29
566 0.27
567 0.28
568 0.25
569 0.26
570 0.32
571 0.38
572 0.43
573 0.48
574 0.52
575 0.55
576 0.55
577 0.51
578 0.44
579 0.35
580 0.29
581 0.23
582 0.19
583 0.14
584 0.15
585 0.18
586 0.22
587 0.23
588 0.29
589 0.31
590 0.31
591 0.3
592 0.28
593 0.26
594 0.27
595 0.26
596 0.21
597 0.22
598 0.2
599 0.23
600 0.29
601 0.37
602 0.37
603 0.45
604 0.49
605 0.53
606 0.63
607 0.67
608 0.65
609 0.61
610 0.66
611 0.62
612 0.65
613 0.65
614 0.56
615 0.49
616 0.46