Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VI18

Protein Details
Accession A0A4Q4VI18    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-68DVSTRTSARRRSPQPHQTSTPHydrophilic
371-393QELEEKLRRQKEERKKRLNQGHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-193KPVGKKDREPAKAGVK
281-292ARNGKPQPPLRA
376-393KLRRQKEERKKRLNQGHR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 16, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MPIGDLLAEISGERPSPVANTPLPSGIKRKADDLNGDSTKVAKARHTDVSTRTSARRRSPQPHQTSTPSTNGRPSKPTTTNGQHTSGSVVNGRPAPSSASSSAQRKPASDVASRPKLNPPSLSAPKMPPAKPSPTTPTASDPGKAPKKGSFAEIMARGAKAQQVMGKVGVIQHKAIEKPVGKKDREPAKAGVKTPTGKPYLGNARPGVIPPRDGTRPAGQGANAQRNGVGKDGKQAGKQRPGTSGGDVQEKKVKKSATATTGYTGTARPKPGASSSKSSSARNGKPQPPLRAGGLLGPPKSSRRSREDDYDEDLDDFIEYDDEDEPDPRGRGYGYGYDSDESSDMEAGLSDIDEEEARATREAIQEDKREQELEEKLRRQKEERKKRLNQGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.12
4 0.14
5 0.19
6 0.2
7 0.23
8 0.25
9 0.3
10 0.32
11 0.33
12 0.37
13 0.39
14 0.44
15 0.42
16 0.45
17 0.46
18 0.48
19 0.53
20 0.49
21 0.51
22 0.45
23 0.45
24 0.4
25 0.35
26 0.33
27 0.28
28 0.27
29 0.22
30 0.25
31 0.3
32 0.38
33 0.41
34 0.43
35 0.45
36 0.49
37 0.49
38 0.49
39 0.5
40 0.5
41 0.53
42 0.57
43 0.62
44 0.65
45 0.69
46 0.76
47 0.79
48 0.81
49 0.81
50 0.78
51 0.75
52 0.73
53 0.69
54 0.66
55 0.6
56 0.53
57 0.54
58 0.54
59 0.51
60 0.49
61 0.5
62 0.51
63 0.51
64 0.52
65 0.52
66 0.54
67 0.59
68 0.57
69 0.56
70 0.47
71 0.42
72 0.43
73 0.35
74 0.28
75 0.23
76 0.19
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.22
85 0.2
86 0.22
87 0.26
88 0.3
89 0.33
90 0.37
91 0.36
92 0.33
93 0.36
94 0.37
95 0.37
96 0.36
97 0.39
98 0.41
99 0.49
100 0.49
101 0.46
102 0.48
103 0.49
104 0.48
105 0.44
106 0.4
107 0.4
108 0.45
109 0.46
110 0.42
111 0.38
112 0.42
113 0.47
114 0.43
115 0.4
116 0.39
117 0.42
118 0.42
119 0.45
120 0.45
121 0.42
122 0.44
123 0.4
124 0.39
125 0.37
126 0.35
127 0.32
128 0.27
129 0.32
130 0.36
131 0.35
132 0.33
133 0.32
134 0.36
135 0.36
136 0.36
137 0.29
138 0.24
139 0.26
140 0.26
141 0.23
142 0.19
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.18
164 0.18
165 0.23
166 0.32
167 0.38
168 0.37
169 0.39
170 0.47
171 0.51
172 0.52
173 0.49
174 0.46
175 0.47
176 0.5
177 0.48
178 0.43
179 0.37
180 0.36
181 0.34
182 0.34
183 0.28
184 0.24
185 0.23
186 0.25
187 0.31
188 0.31
189 0.32
190 0.27
191 0.26
192 0.26
193 0.27
194 0.26
195 0.17
196 0.17
197 0.14
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.2
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.18
207 0.22
208 0.26
209 0.3
210 0.27
211 0.24
212 0.24
213 0.25
214 0.25
215 0.22
216 0.19
217 0.12
218 0.17
219 0.23
220 0.24
221 0.27
222 0.34
223 0.38
224 0.46
225 0.5
226 0.46
227 0.43
228 0.46
229 0.43
230 0.38
231 0.36
232 0.29
233 0.33
234 0.31
235 0.3
236 0.32
237 0.32
238 0.31
239 0.32
240 0.3
241 0.24
242 0.3
243 0.35
244 0.34
245 0.36
246 0.36
247 0.33
248 0.33
249 0.3
250 0.25
251 0.21
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.2
257 0.21
258 0.27
259 0.32
260 0.31
261 0.34
262 0.36
263 0.44
264 0.45
265 0.45
266 0.46
267 0.49
268 0.5
269 0.54
270 0.6
271 0.57
272 0.64
273 0.7
274 0.69
275 0.64
276 0.61
277 0.53
278 0.46
279 0.4
280 0.34
281 0.33
282 0.3
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.34
288 0.36
289 0.36
290 0.4
291 0.47
292 0.51
293 0.59
294 0.62
295 0.59
296 0.59
297 0.55
298 0.48
299 0.41
300 0.35
301 0.26
302 0.19
303 0.15
304 0.09
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.11
313 0.14
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.17
320 0.21
321 0.21
322 0.24
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.25
327 0.21
328 0.15
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.15
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.32
352 0.37
353 0.4
354 0.44
355 0.42
356 0.39
357 0.37
358 0.38
359 0.4
360 0.43
361 0.49
362 0.53
363 0.59
364 0.65
365 0.7
366 0.71
367 0.73
368 0.75
369 0.77
370 0.8
371 0.83
372 0.85
373 0.9