FuNGI

J8LHC2

Protein Details

Accession

J8LHC2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
535-574	ESSAKRNKNTTINKVQKRKVLELKKKRKAKCLEKFLQGHD	Hydrophilic
582-609	ERWLPLKDRSTYRPKKKQQGGKQTQGGA	Hydrophilic
618-640	LDISKKGKPAAVKKTKNKKKGRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
548-564	KVQKRKVLELKKKRKAK
594-603	RPKKKQQGGK
612-613	KK
619-640	DISKKGKPAAVKKTKNKKKGRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11, pero 4, mito 2, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72

Amino Acid Sequences

MAKDNLTNLLSQLNIQLSQDEHSQVEQTCVKLLESGCENPADVFRRCLVAVIQQDKYQRALHYLRKFKLIDEKFSRKFALEKLYIFYKLNISDEFNRLYAKVVTDDLDTVLQKDIKSLRGILHVRAQYCYKNGLYQEAFKIYQHLASHNERGQDSQIELACNERVPLSVETALMNKSPLVTPIDESSYDLLFNESFILTSLDKYNEAIELLERALQAATNEGYKNDINTIKLQLSFVLQMMGETTKSKEILKSLLKELETTSPFYLICQNNLHAFVDFSKYNTNFNLLLRELNVERLNTFNLQTFTNKQWSNIQRNILFLRLFNNVKVHSQDSILSKTADKYSKLVDNVTLESYKTQAKKLYHHATKTVLSGTDGSVIGLLLLTLQLLIIEKEWENAIRITELFLNESWKTSFEKFNDSQAIACYILFELYKIKGRNHSKSTLLKKLGSVKTQLGGKIQENIPFWKHVGFELLSMGNIRESKALLREISRFGKDNEDELVDRIVSSNSLDTAQGINLVTDIDVNELIQLGVKPLESSAKRNKNTTINKVQKRKVLELKKKRKAKCLEKFLQGHDVSKLPDPERWLPLKDRSTYRPKKKQQGGKQTQGGAMSKKSEQALDISKKGKPAAVKKTKNKKKGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.17
4	0.16
5	0.18
6	0.21
7	0.19
8	0.18
9	0.18
10	0.21
11	0.2
12	0.25
13	0.25
14	0.23
15	0.24
16	0.23
17	0.22
18	0.23
19	0.23
20	0.23
21	0.24
22	0.26
23	0.25
24	0.24
25	0.25
26	0.21
27	0.27
28	0.27
29	0.24
30	0.25
31	0.24
32	0.26
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.25
37	0.32
38	0.34
39	0.35
40	0.36
41	0.4
42	0.4
43	0.42
44	0.39
45	0.31
46	0.33
47	0.38
48	0.44
49	0.5
50	0.58
51	0.57
52	0.61
53	0.6
54	0.56
55	0.59
56	0.54
57	0.54
58	0.55
59	0.62
60	0.58
61	0.61
62	0.59
63	0.5
64	0.49
65	0.44
66	0.44
67	0.38
68	0.36
69	0.36
70	0.39
71	0.4
72	0.37
73	0.34
74	0.29
75	0.26
76	0.27
77	0.25
78	0.26
79	0.28
80	0.3
81	0.31
82	0.27
83	0.26
84	0.24
85	0.25
86	0.22
87	0.19
88	0.17
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.17
93	0.15
94	0.16
95	0.15
96	0.14
97	0.16
98	0.16
99	0.15
100	0.19
101	0.21
102	0.21
103	0.23
104	0.24
105	0.23
106	0.3
107	0.32
108	0.31
109	0.36
110	0.36
111	0.35
112	0.36
113	0.37
114	0.31
115	0.31
116	0.33
117	0.25
118	0.26
119	0.26
120	0.31
121	0.3
122	0.31
123	0.32
124	0.32
125	0.32
126	0.27
127	0.3
128	0.23
129	0.25
130	0.22
131	0.22
132	0.23
133	0.27
134	0.33
135	0.32
136	0.35
137	0.31
138	0.32
139	0.31
140	0.27
141	0.23
142	0.21
143	0.2
144	0.18
145	0.17
146	0.18
147	0.16
148	0.14
149	0.14
150	0.1
151	0.09
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.14
156	0.15
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.13
161	0.12
162	0.09
163	0.1
164	0.09
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.13
169	0.15
170	0.17
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.14
175	0.13
176	0.12
177	0.11
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.09
185	0.08
186	0.09
187	0.12
188	0.12
189	0.12
190	0.13
191	0.12
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.12
210	0.12
211	0.12
212	0.14
213	0.16
214	0.15
215	0.17
216	0.19
217	0.18
218	0.19
219	0.18
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.11
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.1
234	0.11
235	0.12
236	0.13
237	0.19
238	0.23
239	0.24
240	0.26
241	0.28
242	0.28
243	0.27
244	0.27
245	0.27
246	0.23
247	0.22
248	0.2
249	0.17
250	0.17
251	0.17
252	0.23
253	0.17
254	0.19
255	0.18
256	0.19
257	0.2
258	0.21
259	0.21
260	0.13
261	0.13
262	0.11
263	0.13
264	0.12
265	0.11
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.17
270	0.19
271	0.17
272	0.17
273	0.19
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.15
278	0.12
279	0.15
280	0.15
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.13
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.14
291	0.16
292	0.18
293	0.23
294	0.23
295	0.21
296	0.29
297	0.35
298	0.4
299	0.41
300	0.43
301	0.37
302	0.39
303	0.39
304	0.33
305	0.26
306	0.19
307	0.18
308	0.18
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.16
313	0.17
314	0.19
315	0.17
316	0.14
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.18
321	0.17
322	0.16
323	0.15
324	0.16
325	0.2
326	0.2
327	0.18
328	0.17
329	0.19
330	0.22
331	0.22
332	0.21
333	0.19
334	0.18
335	0.18
336	0.18
337	0.16
338	0.12
339	0.11
340	0.12
341	0.15
342	0.14
343	0.15
344	0.19
345	0.22
346	0.26
347	0.35
348	0.44
349	0.45
350	0.45
351	0.46
352	0.43
353	0.42
354	0.39
355	0.3
356	0.21
357	0.16
358	0.15
359	0.13
360	0.12
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.02
369	0.02
370	0.02
371	0.02
372	0.02
373	0.02
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.16
398	0.17
399	0.22
400	0.2
401	0.28
402	0.28
403	0.32
404	0.34
405	0.32
406	0.3
407	0.25
408	0.26
409	0.18
410	0.17
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.16
419	0.17
420	0.2
421	0.28
422	0.36
423	0.44
424	0.48
425	0.5
426	0.51
427	0.58
428	0.63
429	0.63
430	0.59
431	0.52
432	0.5
433	0.56
434	0.53
435	0.47
436	0.43
437	0.35
438	0.35
439	0.37
440	0.34
441	0.27
442	0.26
443	0.24
444	0.27
445	0.27
446	0.28
447	0.27
448	0.3
449	0.28
450	0.27
451	0.26
452	0.22
453	0.21
454	0.16
455	0.18
456	0.15
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.12
469	0.15
470	0.18
471	0.17
472	0.2
473	0.22
474	0.27
475	0.31
476	0.32
477	0.3
478	0.29
479	0.35
480	0.33
481	0.32
482	0.28
483	0.26
484	0.24
485	0.23
486	0.23
487	0.15
488	0.14
489	0.13
490	0.12
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.1
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.17
522	0.17
523	0.25
524	0.34
525	0.44
526	0.47
527	0.51
528	0.57
529	0.59
530	0.66
531	0.68
532	0.69
533	0.69
534	0.76
535	0.82
536	0.82
537	0.77
538	0.75
539	0.75
540	0.74
541	0.74
542	0.76
543	0.77
544	0.83
545	0.87
546	0.9
547	0.87
548	0.87
549	0.86
550	0.86
551	0.86
552	0.85
553	0.83
554	0.83
555	0.82
556	0.76
557	0.74
558	0.65
559	0.56
560	0.48
561	0.42
562	0.35
563	0.35
564	0.37
565	0.29
566	0.3
567	0.35
568	0.38
569	0.43
570	0.45
571	0.44
572	0.44
573	0.52
574	0.56
575	0.56
576	0.57
577	0.58
578	0.65
579	0.72
580	0.77
581	0.79
582	0.82
583	0.86
584	0.89
585	0.92
586	0.91
587	0.92
588	0.91
589	0.9
590	0.87
591	0.8
592	0.72
593	0.66
594	0.59
595	0.52
596	0.45
597	0.39
598	0.33
599	0.34
600	0.33
601	0.29
602	0.26
603	0.28
604	0.34
605	0.37
606	0.42
607	0.41
608	0.42
609	0.45
610	0.45
611	0.43
612	0.42
613	0.45
614	0.5
615	0.58
616	0.66
617	0.73
618	0.83
619	0.9
620	0.92

J8LHC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer