Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VJB9

Protein Details
Accession A0A4Q4VJB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-128AGSSRYGRSRSPRSRRSRSPRRRETRRCAHCQRESHYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-116RNSRAGSSRYGRSRSPRSRRSRSPRRRET
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MSSNRSSGSEPYDQSSRRESRRESRSSGGDRAGRDDGSAYVGPDRLMSADPVLRDSFLQRAIISRSGYLEITVDGPNEASQYSPAERRNSRAGSSRYGRSRSPRSRRSRSPRRRETRRCAHCQRESHYSRECVGPMVPMSYLSGTCVECEETGHVYGPRCPKWEETKNKAAMKLIWFRQNKPEIESDINLTDLLQERLDAGDEHWLGARNFFLPWTGLFAWNYQREQEALQGPGHWRGHRYSFVGRPDLEAPRRPSDPRRGLCADAREAIQKLRDTGYAADEARPDADASRSSSRRAASSVTGGRSRSGSVISVYDAQPDECTNCDQPGHSGLLCHLPCGACGSAEHKYWHCPKTSDACICRAHPRNLLEHCQVACEVCGDDVPAHPAVECDVICQYCGQKGHSALHQCRPMIHMFNGICRICKIGRHLLQHCDVSWCPDAEYNDWIGCREHCMTCGSPKDLDIQRQQDGGPPHSCQWHKIGNPEKPGSGVYLQCSACGHKIASSRDLHDVRLSACPPSPSIHPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.5
4 0.51
5 0.57
6 0.61
7 0.63
8 0.71
9 0.75
10 0.72
11 0.7
12 0.72
13 0.7
14 0.68
15 0.65
16 0.59
17 0.53
18 0.52
19 0.48
20 0.38
21 0.33
22 0.28
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.17
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.2
46 0.17
47 0.2
48 0.24
49 0.27
50 0.26
51 0.23
52 0.23
53 0.24
54 0.24
55 0.2
56 0.17
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.12
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.11
69 0.15
70 0.2
71 0.25
72 0.32
73 0.35
74 0.39
75 0.47
76 0.47
77 0.47
78 0.5
79 0.49
80 0.49
81 0.53
82 0.56
83 0.55
84 0.55
85 0.57
86 0.57
87 0.64
88 0.66
89 0.71
90 0.73
91 0.76
92 0.82
93 0.88
94 0.9
95 0.91
96 0.91
97 0.92
98 0.93
99 0.93
100 0.95
101 0.95
102 0.94
103 0.94
104 0.92
105 0.91
106 0.9
107 0.89
108 0.86
109 0.83
110 0.77
111 0.77
112 0.7
113 0.66
114 0.62
115 0.55
116 0.48
117 0.44
118 0.39
119 0.3
120 0.27
121 0.23
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.2
144 0.26
145 0.27
146 0.28
147 0.29
148 0.33
149 0.41
150 0.5
151 0.54
152 0.55
153 0.62
154 0.67
155 0.68
156 0.64
157 0.56
158 0.5
159 0.46
160 0.46
161 0.41
162 0.42
163 0.42
164 0.43
165 0.49
166 0.52
167 0.47
168 0.43
169 0.42
170 0.37
171 0.38
172 0.36
173 0.29
174 0.23
175 0.22
176 0.18
177 0.15
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.19
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.22
221 0.23
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.23
226 0.24
227 0.26
228 0.24
229 0.28
230 0.3
231 0.32
232 0.29
233 0.28
234 0.29
235 0.31
236 0.29
237 0.29
238 0.3
239 0.3
240 0.32
241 0.33
242 0.35
243 0.41
244 0.47
245 0.43
246 0.46
247 0.45
248 0.45
249 0.45
250 0.43
251 0.34
252 0.26
253 0.25
254 0.2
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.12
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.21
285 0.16
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.21
293 0.21
294 0.16
295 0.13
296 0.11
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.11
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.19
321 0.19
322 0.18
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.17
327 0.16
328 0.09
329 0.09
330 0.13
331 0.15
332 0.18
333 0.2
334 0.18
335 0.25
336 0.32
337 0.34
338 0.33
339 0.32
340 0.34
341 0.39
342 0.46
343 0.47
344 0.42
345 0.44
346 0.44
347 0.45
348 0.5
349 0.5
350 0.47
351 0.45
352 0.45
353 0.47
354 0.48
355 0.52
356 0.45
357 0.42
358 0.38
359 0.33
360 0.31
361 0.24
362 0.19
363 0.14
364 0.12
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.15
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.22
389 0.25
390 0.3
391 0.38
392 0.39
393 0.45
394 0.47
395 0.43
396 0.41
397 0.41
398 0.39
399 0.35
400 0.31
401 0.31
402 0.27
403 0.31
404 0.37
405 0.35
406 0.32
407 0.27
408 0.3
409 0.24
410 0.27
411 0.29
412 0.32
413 0.39
414 0.46
415 0.5
416 0.52
417 0.56
418 0.54
419 0.48
420 0.43
421 0.37
422 0.33
423 0.32
424 0.26
425 0.22
426 0.24
427 0.26
428 0.23
429 0.25
430 0.23
431 0.22
432 0.21
433 0.22
434 0.2
435 0.18
436 0.21
437 0.22
438 0.2
439 0.2
440 0.24
441 0.25
442 0.31
443 0.36
444 0.35
445 0.32
446 0.32
447 0.39
448 0.39
449 0.44
450 0.45
451 0.45
452 0.44
453 0.44
454 0.44
455 0.41
456 0.41
457 0.39
458 0.34
459 0.32
460 0.32
461 0.39
462 0.4
463 0.38
464 0.39
465 0.42
466 0.42
467 0.48
468 0.55
469 0.54
470 0.62
471 0.62
472 0.57
473 0.49
474 0.47
475 0.42
476 0.37
477 0.31
478 0.26
479 0.3
480 0.29
481 0.28
482 0.29
483 0.28
484 0.26
485 0.26
486 0.24
487 0.22
488 0.29
489 0.32
490 0.38
491 0.39
492 0.4
493 0.46
494 0.47
495 0.44
496 0.41
497 0.39
498 0.34
499 0.37
500 0.34
501 0.28
502 0.3
503 0.3
504 0.28
505 0.29