Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8LNQ4

Protein Details
Accession J8LNQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-225AATAAAKKPRKPRQTKKAKAQAQAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-219AAKKPRKPRQTKKAK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MESIIPADTKLEDLEVKLAKNENETRDNVCKQINEARNEILPLRLQFNEFIQSMANIDHDGTKQGDRMVKYLHIRDSILQLNDRFQSLSSHLETLQPLFNTVPEYLRTADNKDRSFQLLEPLSTYNQNGTVTGPAAAVANTSHSTAASTPTTTPHANSNAHTHSLSNPNTTTAMMQQNPMAGKRGPKGSTTIGTPNSAAAAATAAAKKPRKPRQTKKAKAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVYAHPSAVQTPITASMTAALPNPTPNIINSVSPTNVMGTPLTNMMSPMTNAYSMVAPNQGGQPAMSQFTNHSNGTNPNPTTNANNTPLQSQLNLNNLTPANILNMSMNNDFQQQQQQQQQPQQPQQQQYNMNTMNNNGKELDSLDLNNLELGGLNMDFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.23
5 0.27
6 0.26
7 0.33
8 0.38
9 0.38
10 0.41
11 0.43
12 0.46
13 0.51
14 0.52
15 0.48
16 0.46
17 0.4
18 0.4
19 0.47
20 0.48
21 0.44
22 0.45
23 0.43
24 0.41
25 0.42
26 0.38
27 0.31
28 0.27
29 0.25
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.23
34 0.24
35 0.26
36 0.22
37 0.2
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.13
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.21
52 0.25
53 0.24
54 0.26
55 0.27
56 0.3
57 0.35
58 0.38
59 0.38
60 0.36
61 0.36
62 0.35
63 0.37
64 0.36
65 0.33
66 0.31
67 0.28
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.23
72 0.18
73 0.19
74 0.18
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.17
84 0.17
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.19
94 0.2
95 0.23
96 0.3
97 0.35
98 0.36
99 0.36
100 0.36
101 0.35
102 0.36
103 0.31
104 0.31
105 0.27
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.16
139 0.15
140 0.16
141 0.17
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.27
146 0.26
147 0.27
148 0.26
149 0.23
150 0.21
151 0.27
152 0.27
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.18
159 0.14
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.12
169 0.15
170 0.17
171 0.23
172 0.22
173 0.22
174 0.25
175 0.24
176 0.25
177 0.24
178 0.25
179 0.21
180 0.21
181 0.2
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.11
193 0.14
194 0.19
195 0.28
196 0.38
197 0.47
198 0.58
199 0.68
200 0.74
201 0.83
202 0.88
203 0.88
204 0.89
205 0.86
206 0.81
207 0.78
208 0.74
209 0.68
210 0.63
211 0.53
212 0.46
213 0.39
214 0.35
215 0.28
216 0.23
217 0.17
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.13
294 0.18
295 0.22
296 0.21
297 0.2
298 0.21
299 0.25
300 0.31
301 0.36
302 0.32
303 0.29
304 0.31
305 0.32
306 0.35
307 0.36
308 0.36
309 0.33
310 0.35
311 0.34
312 0.33
313 0.34
314 0.3
315 0.26
316 0.24
317 0.24
318 0.28
319 0.29
320 0.27
321 0.3
322 0.28
323 0.28
324 0.25
325 0.2
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.12
330 0.14
331 0.17
332 0.18
333 0.19
334 0.17
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.28
339 0.28
340 0.34
341 0.42
342 0.49
343 0.53
344 0.61
345 0.67
346 0.66
347 0.71
348 0.74
349 0.73
350 0.73
351 0.73
352 0.72
353 0.72
354 0.66
355 0.67
356 0.61
357 0.57
358 0.5
359 0.47
360 0.49
361 0.42
362 0.4
363 0.32
364 0.28
365 0.26
366 0.26
367 0.25
368 0.18
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.12
376 0.09
377 0.09
378 0.08