Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8LJ79

Protein Details
Accession J8LJ79    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-354NTTANTVPKGHKKKKSGIFVRNAGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-274KR
340-344HKKKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MKSLRTLCEISLMRNHSNIQSVSNVPYHLLKKILQKVKIPQLSKLEKSNVLLVFDDDELWLEFLKQDFPTNVHEQFVSKRDSICKYYLNFIRDNDMELYRSDQELIESCLRQSVLKDTRNNKYRIPYRMLYAKYQQEVEKKQEESAERLRLEMQKLQHEREKKQTIVVDHTVYFKKKNPRKTTRSDNGPHSQLYMKSLKDHESRLKHFKDGGFNIAKRHAQRVAFGGKAGRQPSSLKQDPAPFKKETSKINRQIDPPTAENKNAPPPSTPVKKRRSESPSIFLNRKKPALSRAVSKTNNASSRPPSIPITNDHRPHIHPYIDTTSSTVPNTTANTVPKGHKKKKSGIFVRNAGDDGDTSTHVTSTGPTTRPYIYDPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.33
4 0.38
5 0.35
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.27
12 0.23
13 0.28
14 0.28
15 0.26
16 0.27
17 0.28
18 0.35
19 0.45
20 0.51
21 0.51
22 0.55
23 0.62
24 0.69
25 0.72
26 0.65
27 0.61
28 0.63
29 0.66
30 0.63
31 0.61
32 0.56
33 0.51
34 0.51
35 0.51
36 0.43
37 0.37
38 0.33
39 0.27
40 0.24
41 0.21
42 0.19
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.12
52 0.11
53 0.14
54 0.15
55 0.17
56 0.23
57 0.27
58 0.28
59 0.26
60 0.26
61 0.25
62 0.28
63 0.3
64 0.28
65 0.24
66 0.26
67 0.31
68 0.35
69 0.38
70 0.37
71 0.38
72 0.35
73 0.42
74 0.45
75 0.42
76 0.4
77 0.37
78 0.39
79 0.34
80 0.35
81 0.3
82 0.25
83 0.22
84 0.2
85 0.23
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.21
101 0.26
102 0.32
103 0.4
104 0.45
105 0.54
106 0.61
107 0.63
108 0.58
109 0.59
110 0.59
111 0.58
112 0.59
113 0.51
114 0.47
115 0.52
116 0.5
117 0.45
118 0.44
119 0.43
120 0.37
121 0.38
122 0.38
123 0.37
124 0.39
125 0.41
126 0.4
127 0.36
128 0.35
129 0.37
130 0.35
131 0.34
132 0.36
133 0.36
134 0.31
135 0.3
136 0.32
137 0.31
138 0.32
139 0.3
140 0.26
141 0.29
142 0.32
143 0.35
144 0.37
145 0.39
146 0.4
147 0.46
148 0.49
149 0.4
150 0.42
151 0.41
152 0.39
153 0.39
154 0.38
155 0.3
156 0.25
157 0.28
158 0.26
159 0.25
160 0.24
161 0.24
162 0.32
163 0.36
164 0.46
165 0.53
166 0.61
167 0.67
168 0.73
169 0.78
170 0.75
171 0.79
172 0.73
173 0.7
174 0.64
175 0.59
176 0.51
177 0.42
178 0.36
179 0.27
180 0.26
181 0.22
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.28
188 0.31
189 0.35
190 0.4
191 0.45
192 0.45
193 0.42
194 0.43
195 0.42
196 0.41
197 0.36
198 0.38
199 0.35
200 0.34
201 0.34
202 0.34
203 0.35
204 0.29
205 0.31
206 0.29
207 0.24
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.24
212 0.23
213 0.21
214 0.2
215 0.23
216 0.23
217 0.19
218 0.17
219 0.19
220 0.25
221 0.32
222 0.33
223 0.3
224 0.33
225 0.4
226 0.47
227 0.5
228 0.49
229 0.41
230 0.41
231 0.47
232 0.48
233 0.49
234 0.51
235 0.55
236 0.6
237 0.66
238 0.67
239 0.63
240 0.63
241 0.6
242 0.55
243 0.47
244 0.43
245 0.38
246 0.34
247 0.33
248 0.32
249 0.35
250 0.33
251 0.32
252 0.28
253 0.3
254 0.37
255 0.45
256 0.5
257 0.51
258 0.58
259 0.65
260 0.66
261 0.72
262 0.71
263 0.72
264 0.69
265 0.66
266 0.65
267 0.63
268 0.66
269 0.61
270 0.61
271 0.57
272 0.54
273 0.5
274 0.45
275 0.46
276 0.49
277 0.47
278 0.48
279 0.49
280 0.55
281 0.55
282 0.54
283 0.53
284 0.51
285 0.53
286 0.47
287 0.45
288 0.4
289 0.45
290 0.44
291 0.41
292 0.37
293 0.36
294 0.36
295 0.37
296 0.41
297 0.43
298 0.45
299 0.45
300 0.45
301 0.45
302 0.5
303 0.49
304 0.44
305 0.36
306 0.38
307 0.4
308 0.39
309 0.36
310 0.31
311 0.29
312 0.28
313 0.28
314 0.23
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.23
321 0.26
322 0.3
323 0.36
324 0.44
325 0.53
326 0.6
327 0.64
328 0.69
329 0.76
330 0.8
331 0.85
332 0.84
333 0.83
334 0.83
335 0.81
336 0.77
337 0.69
338 0.6
339 0.5
340 0.4
341 0.31
342 0.25
343 0.19
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.12
351 0.16
352 0.22
353 0.22
354 0.24
355 0.28
356 0.3
357 0.32
358 0.36