Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4U9Y9

Protein Details
Accession A0A4Q4U9Y9    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
464-483RQSHRGGRGRSRSRSPDGGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-478PPGKANRGGRQSHRGGRGRSRSRS
Subcellular Location(s) plas 24, mito 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001425  Arc/bac/fun_rhodopsins  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
IPR033744  RRM_RBM8  
IPR043476  Yro2-like_7TM  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd15239  7tm_YRO2_fungal-like  
cd12324  RRM_RBM8  
Amino Acid Sequences MGILVRDNDALDINPPAGDEYFTTNGSNWLWAVTAVYGFLFLVFFALGFRARFGEKIFHYIFTITLLAGTIAYYAHAANLGWTLRAVVNSRPSPDWIRQIFWVKYVYHLVEFPAIAIALGLLSGVSWASIAYNVALAWTWIVAYIIAALTTSNYKWGFFAFGTFAYLILAYNTLLHGHTGANRVGVARDYIMLAGWTNLIWLCYPIAFGVSDGGNVIGVTPGAIFFGVLDFLLAPLIALGFLVLSRNWDYGRLNLAFTRYGRVHHAGEHPEKATTATGTGTATQPTVVAIMEASEAPAEALKLTAHIRPYHIVSYCIAFESPNFDNTMADTEMEIDEPGSLQQAEQAEATVAAPQAKDRDMQTHAKATAVRSIEGWIIMVTNVHEEADEEALHDKFAEFGEIKNLHLNLDRRSGYGYALIEYPTLQEARAAIDGAHQTKLLEQTVNVDFAFVRPPPGKANRGGRQSHRGGRGRSRSRSPDGGKDEEVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.12
6 0.11
7 0.16
8 0.18
9 0.19
10 0.2
11 0.19
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.06
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.16
41 0.22
42 0.22
43 0.3
44 0.3
45 0.29
46 0.3
47 0.29
48 0.27
49 0.21
50 0.2
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.05
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.15
74 0.16
75 0.24
76 0.27
77 0.3
78 0.3
79 0.33
80 0.36
81 0.39
82 0.44
83 0.38
84 0.38
85 0.4
86 0.47
87 0.43
88 0.41
89 0.4
90 0.31
91 0.31
92 0.33
93 0.29
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.19
98 0.18
99 0.15
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.12
146 0.14
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.18
246 0.14
247 0.14
248 0.17
249 0.2
250 0.19
251 0.2
252 0.25
253 0.27
254 0.29
255 0.3
256 0.27
257 0.24
258 0.23
259 0.21
260 0.17
261 0.11
262 0.09
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.04
288 0.03
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.12
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.19
297 0.21
298 0.2
299 0.19
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.09
306 0.09
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.17
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.17
347 0.21
348 0.27
349 0.29
350 0.33
351 0.33
352 0.33
353 0.33
354 0.3
355 0.31
356 0.27
357 0.24
358 0.18
359 0.2
360 0.18
361 0.16
362 0.15
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.24
391 0.24
392 0.22
393 0.28
394 0.31
395 0.26
396 0.33
397 0.33
398 0.29
399 0.32
400 0.31
401 0.26
402 0.26
403 0.23
404 0.17
405 0.17
406 0.17
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.1
419 0.15
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.19
424 0.18
425 0.21
426 0.25
427 0.22
428 0.18
429 0.16
430 0.21
431 0.23
432 0.25
433 0.21
434 0.18
435 0.16
436 0.16
437 0.2
438 0.15
439 0.19
440 0.18
441 0.21
442 0.29
443 0.36
444 0.41
445 0.45
446 0.55
447 0.58
448 0.65
449 0.7
450 0.69
451 0.71
452 0.74
453 0.74
454 0.74
455 0.73
456 0.72
457 0.75
458 0.79
459 0.79
460 0.79
461 0.8
462 0.78
463 0.78
464 0.8
465 0.76
466 0.75
467 0.72
468 0.7