FuNGI

A0A4Q4VDW7

Protein Details

Accession

A0A4Q4VDW7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
748-770	VSANGQRGKKRKRGPDTGAGNKM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
754-761	RGKKRKRG

Subcellular Location(s)

cyto 9, cyto_mito 8.833, mito 7.5, cyto_nucl 6.833, extr 5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MDIHRCRFVPYPPSAINAVAFSHPYVAGVQKSALVRLAVGRANGDIEIWNPLKGQWHQEIILHGGKDRSIDGLVWVNEPDQVLQDGTKMIGRSRLFSIGYTSTITEWDLEKGRPKKQASGIHGDIWCLAAQPLVDPSKSRDKTQANRVAQTGKKLVAGTIDGSLVLYSIDDDDLQFDRVLVKSSSKKTRMVSMTFQNRNVVVVGCSDSAIRVYDMRNGNMLSKMTLGSDLAGGAREIIVWSVKCLNGRDIVSGDSTGQVCIFDGKTYTQAQRLQSHKQDVLSLATSADGSTIVSGGMDRKTVLYRRTRGSTSRWGKVWHRRYHSHDVKTMASFEGLGMSVVVSGGPDASPIVLPLQEAGMENHRTLPCLPQDPPLRSAAKARLIVSWWEREVHIWRLRQPLNDLVNVSDGESAVAKNRKLLARILIKGEANITSAAISDDGSLLVVSTSSDIKAFHLKSRGDARKEELRISKVEVPEAAAAQGATRIQVSPDGKWLCLVQEGSKVCAFQLVQDSYSESKPAIHPKAIRLQRIGRKLPKHIALGGLGQYERTVSHISFSPDSRMLAVADLAGYIDTWVLRDSTQRLQDDIDDSENESASDASGSDNENDGSGIPSDGVRWVRNPNGALIPRLHAAPTVLSFSNHIPDTTIRPQGVRDQEHPDDYILLAITAKPQILLLNPGVGSITAWSRRNPLSRFPVEFRNIRDLVKGALWEGDRVWLYGNNFLVMLDLTKDIVEAGPEGKPSSAMVSANGQRGKKRKRGPDTGAGNKMGVGALGPTKVVRHVRGQTDEELSLDAPAAAGPDPMDTDATSGPGEEESDSEDSEDERRGELALLRGAQGRKRESEGAGDIAFWCTYKYRPILGIVPLLACCDRPAEEGAGRVAGNGDTDIAYVNGNGEQPRRRMLEVAIVERPLWEVDMPDRYFADGEYDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.42
3	0.36
4	0.29
5	0.26
6	0.19
7	0.19
8	0.16
9	0.16
10	0.15
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.17
16	0.17
17	0.19
18	0.2
19	0.2
20	0.21
21	0.17
22	0.16
23	0.18
24	0.22
25	0.2
26	0.19
27	0.19
28	0.18
29	0.19
30	0.18
31	0.16
32	0.12
33	0.1
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.16
38	0.17
39	0.24
40	0.26
41	0.32
42	0.3
43	0.33
44	0.34
45	0.36
46	0.37
47	0.35
48	0.37
49	0.31
50	0.27
51	0.24
52	0.23
53	0.22
54	0.2
55	0.17
56	0.14
57	0.14
58	0.15
59	0.2
60	0.2
61	0.2
62	0.2
63	0.19
64	0.19
65	0.19
66	0.17
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.11
71	0.12
72	0.11
73	0.12
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.2
78	0.21
79	0.23
80	0.26
81	0.29
82	0.27
83	0.27
84	0.31
85	0.25
86	0.26
87	0.24
88	0.22
89	0.18
90	0.18
91	0.17
92	0.14
93	0.13
94	0.15
95	0.17
96	0.19
97	0.28
98	0.34
99	0.4
100	0.47
101	0.49
102	0.53
103	0.59
104	0.66
105	0.63
106	0.66
107	0.63
108	0.6
109	0.58
110	0.5
111	0.41
112	0.33
113	0.26
114	0.17
115	0.14
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.13
120	0.14
121	0.15
122	0.16
123	0.21
124	0.31
125	0.33
126	0.35
127	0.39
128	0.46
129	0.54
130	0.64
131	0.69
132	0.63
133	0.65
134	0.65
135	0.64
136	0.57
137	0.55
138	0.48
139	0.39
140	0.36
141	0.33
142	0.3
143	0.24
144	0.23
145	0.18
146	0.15
147	0.14
148	0.11
149	0.11
150	0.1
151	0.08
152	0.06
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.08
160	0.09
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.11
165	0.12
166	0.15
167	0.13
168	0.19
169	0.25
170	0.33
171	0.43
172	0.45
173	0.5
174	0.49
175	0.57
176	0.57
177	0.54
178	0.52
179	0.53
180	0.59
181	0.58
182	0.58
183	0.51
184	0.45
185	0.41
186	0.36
187	0.27
188	0.17
189	0.14
190	0.14
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.17
201	0.21
202	0.21
203	0.23
204	0.23
205	0.24
206	0.24
207	0.24
208	0.17
209	0.15
210	0.15
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.07
226	0.07
227	0.09
228	0.11
229	0.13
230	0.16
231	0.17
232	0.19
233	0.21
234	0.22
235	0.22
236	0.2
237	0.2
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.13
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.13
253	0.16
254	0.18
255	0.21
256	0.26
257	0.3
258	0.36
259	0.4
260	0.44
261	0.47
262	0.51
263	0.47
264	0.43
265	0.41
266	0.34
267	0.33
268	0.26
269	0.2
270	0.14
271	0.12
272	0.11
273	0.09
274	0.08
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.04
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.12
288	0.16
289	0.22
290	0.29
291	0.34
292	0.38
293	0.43
294	0.44
295	0.44
296	0.47
297	0.51
298	0.5
299	0.5
300	0.47
301	0.48
302	0.53
303	0.59
304	0.63
305	0.61
306	0.61
307	0.63
308	0.69
309	0.75
310	0.76
311	0.7
312	0.65
313	0.59
314	0.55
315	0.49
316	0.42
317	0.31
318	0.22
319	0.17
320	0.12
321	0.1
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.03
330	0.02
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.04
338	0.05
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.17
350	0.17
351	0.17
352	0.17
353	0.2
354	0.19
355	0.22
356	0.23
357	0.25
358	0.32
359	0.33
360	0.35
361	0.35
362	0.33
363	0.3
364	0.34
365	0.31
366	0.31
367	0.31
368	0.29
369	0.26
370	0.26
371	0.29
372	0.27
373	0.24
374	0.19
375	0.17
376	0.17
377	0.18
378	0.2
379	0.24
380	0.27
381	0.27
382	0.3
383	0.37
384	0.39
385	0.39
386	0.38
387	0.37
388	0.35
389	0.34
390	0.3
391	0.22
392	0.22
393	0.2
394	0.18
395	0.11
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.09
401	0.13
402	0.12
403	0.14
404	0.18
405	0.19
406	0.2
407	0.22
408	0.25
409	0.28
410	0.29
411	0.3
412	0.28
413	0.27
414	0.25
415	0.24
416	0.17
417	0.12
418	0.1
419	0.08
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.12
441	0.13
442	0.15
443	0.21
444	0.21
445	0.24
446	0.34
447	0.39
448	0.36
449	0.37
450	0.38
451	0.4
452	0.41
453	0.42
454	0.35
455	0.31
456	0.3
457	0.32
458	0.31
459	0.24
460	0.24
461	0.19
462	0.17
463	0.15
464	0.14
465	0.1
466	0.06
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.09
476	0.11
477	0.1
478	0.17
479	0.18
480	0.17
481	0.18
482	0.18
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.09
487	0.14
488	0.15
489	0.16
490	0.17
491	0.16
492	0.14
493	0.15
494	0.14
495	0.1
496	0.16
497	0.14
498	0.14
499	0.15
500	0.17
501	0.16
502	0.17
503	0.15
504	0.1
505	0.1
506	0.13
507	0.2
508	0.21
509	0.23
510	0.25
511	0.28
512	0.37
513	0.4
514	0.4
515	0.36
516	0.41
517	0.44
518	0.5
519	0.54
520	0.52
521	0.52
522	0.55
523	0.56
524	0.53
525	0.48
526	0.41
527	0.36
528	0.29
529	0.26
530	0.22
531	0.17
532	0.12
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.09
541	0.12
542	0.14
543	0.16
544	0.17
545	0.18
546	0.17
547	0.18
548	0.17
549	0.14
550	0.12
551	0.1
552	0.1
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.04
564	0.05
565	0.05
566	0.07
567	0.11
568	0.16
569	0.22
570	0.22
571	0.23
572	0.23
573	0.24
574	0.24
575	0.22
576	0.18
577	0.13
578	0.13
579	0.13
580	0.12
581	0.11
582	0.09
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.09
603	0.11
604	0.11
605	0.13
606	0.17
607	0.2
608	0.23
609	0.24
610	0.22
611	0.27
612	0.27
613	0.27
614	0.24
615	0.23
616	0.21
617	0.2
618	0.18
619	0.12
620	0.11
621	0.1
622	0.1
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.13
627	0.13
628	0.16
629	0.16
630	0.15
631	0.13
632	0.14
633	0.21
634	0.24
635	0.27
636	0.23
637	0.24
638	0.25
639	0.31
640	0.37
641	0.35
642	0.34
643	0.37
644	0.39
645	0.4
646	0.39
647	0.32
648	0.25
649	0.21
650	0.18
651	0.1
652	0.08
653	0.07
654	0.06
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.12
663	0.1
664	0.12
665	0.12
666	0.12
667	0.12
668	0.11
669	0.1
670	0.08
671	0.11
672	0.14
673	0.15
674	0.17
675	0.21
676	0.26
677	0.33
678	0.35
679	0.4
680	0.44
681	0.48
682	0.52
683	0.51
684	0.54
685	0.52
686	0.53
687	0.49
688	0.48
689	0.44
690	0.39
691	0.38
692	0.3
693	0.27
694	0.24
695	0.2
696	0.13
697	0.15
698	0.15
699	0.14
700	0.13
701	0.15
702	0.14
703	0.14
704	0.15
705	0.14
706	0.15
707	0.18
708	0.18
709	0.15
710	0.15
711	0.14
712	0.13
713	0.11
714	0.1
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.08
726	0.09
727	0.1
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.12
733	0.11
734	0.12
735	0.18
736	0.22
737	0.28
738	0.32
739	0.31
740	0.35
741	0.45
742	0.53
743	0.56
744	0.61
745	0.66
746	0.71
747	0.79
748	0.81
749	0.81
750	0.82
751	0.81
752	0.78
753	0.68
754	0.59
755	0.48
756	0.41
757	0.31
758	0.21
759	0.12
760	0.07
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.08
765	0.09
766	0.15
767	0.19
768	0.21
769	0.27
770	0.34
771	0.4
772	0.46
773	0.48
774	0.46
775	0.46
776	0.43
777	0.35
778	0.3
779	0.23
780	0.18
781	0.14
782	0.1
783	0.07
784	0.06
785	0.07
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.07
791	0.08
792	0.09
793	0.08
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.09
801	0.1
802	0.08
803	0.08
804	0.11
805	0.12
806	0.12
807	0.12
808	0.12
809	0.12
810	0.14
811	0.17
812	0.14
813	0.13
814	0.14
815	0.14
816	0.15
817	0.17
818	0.18
819	0.19
820	0.19
821	0.19
822	0.24
823	0.27
824	0.29
825	0.33
826	0.34
827	0.34
828	0.39
829	0.41
830	0.38
831	0.41
832	0.4
833	0.37
834	0.32
835	0.29
836	0.24
837	0.22
838	0.21
839	0.15
840	0.13
841	0.11
842	0.13
843	0.19
844	0.21
845	0.23
846	0.25
847	0.29
848	0.33
849	0.34
850	0.36
851	0.3
852	0.28
853	0.25
854	0.25
855	0.22
856	0.17
857	0.15
858	0.13
859	0.14
860	0.15
861	0.18
862	0.2
863	0.21
864	0.23
865	0.23
866	0.23
867	0.21
868	0.19
869	0.17
870	0.13
871	0.12
872	0.1
873	0.1
874	0.08
875	0.08
876	0.09
877	0.08
878	0.08
879	0.07
880	0.08
881	0.09
882	0.11
883	0.14
884	0.2
885	0.25
886	0.28
887	0.35
888	0.37
889	0.38
890	0.38
891	0.37
892	0.41
893	0.4
894	0.43
895	0.4
896	0.37
897	0.35
898	0.33
899	0.32
900	0.23
901	0.18
902	0.13
903	0.12
904	0.16
905	0.25
906	0.26
907	0.26
908	0.26
909	0.26
910	0.26
911	0.24

A0A4Q4VDW7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer