Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J8PI63

Protein Details
Accession J8PI63    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
556-602NNSNNLDKPKAKRPRKNTKKSESGTPAPKKKRVTKKKQSASGTPSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
563-592KPKAKRPRKNTKKSESGTPAPKKKRVTKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSANSPAGNDPHVFGIPVNATPSSMGSPGSPVNVPPPMNPAAATVNNPIVRSNSNNNSNEVTRTLTREQIQQLQQRQRLLLQQRLLEQQRKQQALQNYEAQFYQMLMTLNKRPKRLYNFVEDSDSILKKYEQYLHSFEFHIYENNYKICAPANSRLQQQQKQPELTSDGLILTKNNETLKEFLEYVARGRIPDAIMEVLRDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVIPKENKSNTNASSSSPSNSGNAQDNSKIKQPPEPSNGVANTTANTANKKPSFKRPRVYRTLLKPNDLTTYYDMMSYADNARFSDSIYQQFESEILTLTKRNLSLNVPLNPYEHRDMLEEKAFTEPHWDDQKKSFVHEYRAESTREGTKGIVGHIEEHEEFPQHSSNYEQLMLIMNERTTTITNSTFAVSLTKNAMEIATSNPNGVRGISSSTSNSASNTRNNSLANGNQVALAAAAAAAAVGSSMGNDNNQFSRLKFIEQWRVNKEKRKQQALSANINPTPFNARISMTAPLTPQQQLLQKQQQALEQQQNGGATKNSSKRSNNNAASSNNNNSNNLDKPKAKRPRKNTKKSESGTPAPKKKRVTKKKQSASGTPSSTTIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.18
4 0.18
5 0.2
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.19
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.2
20 0.25
21 0.26
22 0.23
23 0.28
24 0.28
25 0.28
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.26
30 0.28
31 0.26
32 0.29
33 0.31
34 0.31
35 0.29
36 0.26
37 0.28
38 0.31
39 0.36
40 0.38
41 0.46
42 0.47
43 0.49
44 0.51
45 0.49
46 0.46
47 0.39
48 0.35
49 0.28
50 0.32
51 0.32
52 0.34
53 0.34
54 0.38
55 0.41
56 0.45
57 0.51
58 0.53
59 0.59
60 0.63
61 0.65
62 0.61
63 0.58
64 0.52
65 0.53
66 0.52
67 0.51
68 0.46
69 0.44
70 0.45
71 0.52
72 0.56
73 0.54
74 0.51
75 0.52
76 0.56
77 0.57
78 0.54
79 0.52
80 0.54
81 0.52
82 0.53
83 0.53
84 0.45
85 0.43
86 0.41
87 0.36
88 0.27
89 0.22
90 0.18
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.16
95 0.24
96 0.32
97 0.37
98 0.39
99 0.41
100 0.48
101 0.56
102 0.61
103 0.58
104 0.6
105 0.61
106 0.59
107 0.6
108 0.51
109 0.45
110 0.42
111 0.37
112 0.27
113 0.23
114 0.21
115 0.19
116 0.23
117 0.27
118 0.24
119 0.29
120 0.34
121 0.35
122 0.37
123 0.36
124 0.32
125 0.26
126 0.24
127 0.23
128 0.19
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.2
137 0.22
138 0.26
139 0.34
140 0.36
141 0.4
142 0.48
143 0.53
144 0.55
145 0.58
146 0.61
147 0.59
148 0.59
149 0.56
150 0.51
151 0.47
152 0.42
153 0.34
154 0.25
155 0.19
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.15
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.13
210 0.12
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.23
215 0.25
216 0.27
217 0.25
218 0.3
219 0.28
220 0.3
221 0.29
222 0.27
223 0.29
224 0.27
225 0.25
226 0.22
227 0.21
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.23
236 0.25
237 0.29
238 0.3
239 0.25
240 0.29
241 0.33
242 0.37
243 0.4
244 0.41
245 0.37
246 0.39
247 0.39
248 0.34
249 0.29
250 0.22
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.2
258 0.23
259 0.28
260 0.3
261 0.39
262 0.48
263 0.53
264 0.61
265 0.64
266 0.69
267 0.73
268 0.76
269 0.72
270 0.7
271 0.74
272 0.67
273 0.6
274 0.52
275 0.45
276 0.42
277 0.36
278 0.29
279 0.2
280 0.2
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.13
303 0.11
304 0.08
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.18
315 0.24
316 0.27
317 0.27
318 0.27
319 0.27
320 0.26
321 0.28
322 0.24
323 0.18
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.21
329 0.17
330 0.15
331 0.17
332 0.16
333 0.14
334 0.18
335 0.16
336 0.18
337 0.28
338 0.28
339 0.28
340 0.32
341 0.39
342 0.34
343 0.36
344 0.37
345 0.31
346 0.36
347 0.4
348 0.41
349 0.39
350 0.41
351 0.4
352 0.33
353 0.32
354 0.31
355 0.26
356 0.22
357 0.17
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.14
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.08
407 0.09
408 0.11
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.13
417 0.08
418 0.12
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.16
423 0.18
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.21
428 0.25
429 0.29
430 0.29
431 0.3
432 0.3
433 0.31
434 0.3
435 0.28
436 0.27
437 0.23
438 0.21
439 0.19
440 0.18
441 0.16
442 0.12
443 0.1
444 0.05
445 0.03
446 0.03
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.04
456 0.04
457 0.06
458 0.07
459 0.09
460 0.1
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.2
465 0.2
466 0.23
467 0.27
468 0.33
469 0.42
470 0.48
471 0.55
472 0.55
473 0.63
474 0.66
475 0.7
476 0.72
477 0.71
478 0.74
479 0.76
480 0.72
481 0.71
482 0.74
483 0.72
484 0.72
485 0.68
486 0.63
487 0.55
488 0.53
489 0.44
490 0.36
491 0.35
492 0.27
493 0.23
494 0.2
495 0.19
496 0.21
497 0.23
498 0.25
499 0.21
500 0.22
501 0.21
502 0.22
503 0.24
504 0.23
505 0.22
506 0.22
507 0.27
508 0.31
509 0.39
510 0.46
511 0.46
512 0.49
513 0.5
514 0.5
515 0.49
516 0.51
517 0.5
518 0.43
519 0.4
520 0.39
521 0.38
522 0.35
523 0.31
524 0.24
525 0.19
526 0.25
527 0.31
528 0.35
529 0.41
530 0.47
531 0.54
532 0.62
533 0.7
534 0.69
535 0.68
536 0.67
537 0.63
538 0.63
539 0.61
540 0.59
541 0.56
542 0.52
543 0.47
544 0.44
545 0.46
546 0.46
547 0.46
548 0.45
549 0.44
550 0.48
551 0.57
552 0.66
553 0.72
554 0.75
555 0.8
556 0.84
557 0.89
558 0.93
559 0.94
560 0.93
561 0.93
562 0.87
563 0.87
564 0.84
565 0.82
566 0.81
567 0.81
568 0.81
569 0.79
570 0.82
571 0.81
572 0.83
573 0.85
574 0.86
575 0.87
576 0.88
577 0.9
578 0.93
579 0.93
580 0.91
581 0.89
582 0.85
583 0.83
584 0.76
585 0.66