Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VJ96

Protein Details
Accession A0A4Q4VJ96    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-118GVWVIRKQTRRKRQGGDDDDHydrophilic
312-339TPKTPTGTLPAKPKRRKSKQGTTTPTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-330KTPTGTLPAKPKRRKSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MATNSKEPPLDEIQWRHPQLAQQMQGIHSNSVLFYFAESPFFDRTSNNAVLTSQAMHNANMFPVIQTREAFEGRLKTMSGLEFVVAQEPAEMAPGTGTGVWVIRKQTRRKRQGGDDDDVTVHATYYVVGDNIYMAPTLADILGFRMATISSALSKCFPAADSARTWSPSVGHAYKPLPSTNGTANPRARALESKEATPAPLVESQGTAATKKTATAMQDAALDARLAEQSFYIHMQYGGEYMDENPIAGKPGDFHLSSTGRKPDVGKLQIPPPGGAGLPASSFGGGGDAKPAGVSKAATGKDEKGGATTPKTPKTPTGTLPAKPKRRKSKQGTTTPTSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.52
4 0.48
5 0.47
6 0.48
7 0.51
8 0.46
9 0.4
10 0.41
11 0.41
12 0.45
13 0.42
14 0.34
15 0.25
16 0.22
17 0.18
18 0.16
19 0.16
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.16
31 0.21
32 0.25
33 0.27
34 0.25
35 0.23
36 0.22
37 0.23
38 0.23
39 0.21
40 0.14
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.15
49 0.1
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.22
62 0.2
63 0.17
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.13
90 0.19
91 0.27
92 0.37
93 0.48
94 0.57
95 0.66
96 0.73
97 0.77
98 0.8
99 0.83
100 0.79
101 0.74
102 0.64
103 0.56
104 0.48
105 0.4
106 0.32
107 0.2
108 0.14
109 0.08
110 0.07
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.17
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.2
164 0.16
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.24
169 0.24
170 0.28
171 0.29
172 0.29
173 0.28
174 0.27
175 0.25
176 0.21
177 0.24
178 0.27
179 0.26
180 0.26
181 0.27
182 0.26
183 0.26
184 0.22
185 0.17
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.1
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.18
243 0.22
244 0.24
245 0.28
246 0.3
247 0.28
248 0.29
249 0.31
250 0.32
251 0.37
252 0.41
253 0.39
254 0.39
255 0.43
256 0.45
257 0.44
258 0.37
259 0.29
260 0.25
261 0.21
262 0.18
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.17
284 0.19
285 0.21
286 0.23
287 0.25
288 0.27
289 0.29
290 0.26
291 0.22
292 0.25
293 0.27
294 0.28
295 0.34
296 0.38
297 0.42
298 0.45
299 0.46
300 0.49
301 0.53
302 0.55
303 0.5
304 0.53
305 0.53
306 0.55
307 0.63
308 0.66
309 0.69
310 0.73
311 0.8
312 0.81
313 0.86
314 0.91
315 0.91
316 0.92
317 0.91
318 0.93
319 0.91