FuNGI

J8LI80

Protein Details

Accession

J8LI80

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
401-411	RKKEAFERRKG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 12, mito 7.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEEQPQVVDGVILPLDYSAPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLVMAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAQVENEAREEVMRQREEVGEIIDDAVRNKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWTAFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRKRNNIKDTMNMTEEEKQFLQKQNSEQPFLWLHINVLREYLSAELWVPGLPFTFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRENSIDILLDIWKVVLPRLKTYMTCDGVLNLPSVETLLQHLGSREGDIFKTRHIQEARKKEAFERRKGQKNMSKGQDRHPIVATEQLQMYDTHGNLAKGSWNLTTSDMVRLKKELMLANEGNEDAIAIVKEQSDKNNELMKDISKEEIDDAVSKANKSNFNLAEVMKQKLIHKKHNLEKDNEEEEDISKNTKKIKAEKTESEGDLDTEIKAEIEADVNDREDTENTDLPVKNTVIIGEAPQNGVFDTDEYVKLFEPGYHERYYTAKFRVAPHDIDQLRKDMVKCYIEGVAWVLTYYYQGCASWNWFYPYHYAPLATDFHGFSHLEIKFEEGTPFLPFEQLMSVLPAASGHALPKIFRTLMSESDSEIIDFYPEEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDQDRLLTVVRAQYPLLSEAERARNVRGKPVLLISNKNANFERFSKKLYSKENNNTVEIKFQHFRSGLSGIVSKDVEGFELNGKMICPIQGGSLPDLSTSLILKMSYRLIPLPSRNKSIILNGFIPSEQVLTAYDLDSIMYKYNNQNYSRRWNFGNDLKQNIVPVGPKGITQYKPRTGGYRAFFYFAELNRSNTQNVNNYSKNSHNTQSGFNNSRYNSGNNNYGNNYRQNSNYRNNNYTGNRNGGQYGGNGYSQNNSQSRYDNSRLNRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.59
7	0.59
8	0.57
9	0.52
10	0.46
11	0.38
12	0.34
13	0.3
14	0.23
15	0.15
16	0.11
17	0.08
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.13
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.19
31	0.19
32	0.2
33	0.21
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.43
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.78
107	0.77
108	0.75
109	0.73
110	0.67
111	0.58
112	0.63
113	0.59
114	0.49
115	0.42
116	0.33
117	0.26
118	0.24
119	0.24
120	0.2
121	0.24
122	0.25
123	0.24
124	0.26
125	0.27
126	0.28
127	0.27
128	0.22
129	0.15
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.18
136	0.17
137	0.17
138	0.19
139	0.24
140	0.29
141	0.33
142	0.4
143	0.4
144	0.44
145	0.5
146	0.51
147	0.45
148	0.39
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.17
164	0.16
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.16
169	0.17
170	0.19
171	0.25
172	0.26
173	0.27
174	0.31
175	0.31
176	0.27
177	0.28
178	0.27
179	0.2
180	0.21
181	0.19
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.3
201	0.31
202	0.33
203	0.37
204	0.38
205	0.37
206	0.44
207	0.39
208	0.4
209	0.4
210	0.35
211	0.35
212	0.33
213	0.31
214	0.21
215	0.19
216	0.16
217	0.17
218	0.16
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.3
243	0.31
244	0.33
245	0.34
246	0.39
247	0.38
248	0.44
249	0.46
250	0.44
251	0.52
252	0.54
253	0.52
254	0.53
255	0.55
256	0.51
257	0.49
258	0.46
259	0.38
260	0.38
261	0.34
262	0.3
263	0.25
264	0.24
265	0.27
266	0.33
267	0.35
268	0.32
269	0.37
270	0.44
271	0.47
272	0.48
273	0.44
274	0.41
275	0.37
276	0.35
277	0.31
278	0.21
279	0.19
280	0.18
281	0.19
282	0.15
283	0.15
284	0.13
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.16
328	0.18
329	0.17
330	0.17
331	0.2
332	0.2
333	0.19
334	0.19
335	0.14
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.08
345	0.1
346	0.11
347	0.13
348	0.17
349	0.19
350	0.19
351	0.24
352	0.3
353	0.29
354	0.28
355	0.26
356	0.23
357	0.24
358	0.24
359	0.19
360	0.11
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.13
378	0.13
379	0.13
380	0.2
381	0.2
382	0.26
383	0.28
384	0.36
385	0.41
386	0.51
387	0.57
388	0.53
389	0.53
390	0.52
391	0.6
392	0.6
393	0.59
394	0.59
395	0.6
396	0.67
397	0.69
398	0.72
399	0.67
400	0.67
401	0.67
402	0.66
403	0.66
404	0.58
405	0.62
406	0.63
407	0.59
408	0.53
409	0.46
410	0.39
411	0.3
412	0.34
413	0.28
414	0.2
415	0.18
416	0.16
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.12
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.11
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.11
436	0.17
437	0.2
438	0.21
439	0.21
440	0.21
441	0.2
442	0.2
443	0.23
444	0.19
445	0.16
446	0.21
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.18
451	0.15
452	0.12
453	0.1
454	0.04
455	0.04
456	0.03
457	0.03
458	0.04
459	0.04
460	0.06
461	0.07
462	0.1
463	0.13
464	0.15
465	0.18
466	0.22
467	0.22
468	0.21
469	0.22
470	0.2
471	0.19
472	0.18
473	0.16
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.08
480	0.08
481	0.1
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.16
486	0.18
487	0.18
488	0.24
489	0.22
490	0.23
491	0.25
492	0.23
493	0.24
494	0.24
495	0.24
496	0.18
497	0.19
498	0.21
499	0.27
500	0.32
501	0.35
502	0.41
503	0.48
504	0.54
505	0.62
506	0.62
507	0.59
508	0.57
509	0.55
510	0.49
511	0.41
512	0.35
513	0.25
514	0.22
515	0.2
516	0.17
517	0.13
518	0.12
519	0.13
520	0.17
521	0.21
522	0.24
523	0.31
524	0.39
525	0.46
526	0.51
527	0.53
528	0.54
529	0.54
530	0.5
531	0.43
532	0.35
533	0.26
534	0.2
535	0.17
536	0.12
537	0.08
538	0.07
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.06
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.1
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.17
557	0.17
558	0.17
559	0.2
560	0.17
561	0.14
562	0.14
563	0.13
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.06
576	0.07
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.12
586	0.16
587	0.2
588	0.2
589	0.2
590	0.21
591	0.23
592	0.26
593	0.25
594	0.24
595	0.23
596	0.25
597	0.28
598	0.34
599	0.35
600	0.34
601	0.32
602	0.38
603	0.36
604	0.36
605	0.34
606	0.29
607	0.27
608	0.26
609	0.24
610	0.18
611	0.22
612	0.21
613	0.2
614	0.19
615	0.2
616	0.17
617	0.17
618	0.15
619	0.1
620	0.09
621	0.08
622	0.06
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.08
631	0.11
632	0.13
633	0.14
634	0.16
635	0.17
636	0.18
637	0.21
638	0.21
639	0.21
640	0.19
641	0.18
642	0.15
643	0.18
644	0.18
645	0.16
646	0.16
647	0.13
648	0.13
649	0.15
650	0.15
651	0.12
652	0.17
653	0.16
654	0.16
655	0.15
656	0.17
657	0.16
658	0.17
659	0.17
660	0.1
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.1
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.08
681	0.08
682	0.09
683	0.1
684	0.13
685	0.13
686	0.13
687	0.17
688	0.17
689	0.2
690	0.24
691	0.22
692	0.2
693	0.21
694	0.21
695	0.16
696	0.14
697	0.1
698	0.07
699	0.07
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.1
707	0.14
708	0.13
709	0.14
710	0.15
711	0.14
712	0.16
713	0.18
714	0.18
715	0.15
716	0.15
717	0.15
718	0.18
719	0.19
720	0.17
721	0.15
722	0.13
723	0.12
724	0.13
725	0.11
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.09
730	0.1
731	0.09
732	0.1
733	0.14
734	0.16
735	0.17
736	0.16
737	0.14
738	0.16
739	0.17
740	0.17
741	0.13
742	0.13
743	0.17
744	0.23
745	0.25
746	0.25
747	0.27
748	0.32
749	0.33
750	0.39
751	0.37
752	0.33
753	0.31
754	0.35
755	0.38
756	0.35
757	0.38
758	0.34
759	0.4
760	0.4
761	0.42
762	0.39
763	0.34
764	0.34
765	0.35
766	0.38
767	0.31
768	0.34
769	0.38
770	0.41
771	0.47
772	0.52
773	0.57
774	0.6
775	0.67
776	0.73
777	0.69
778	0.67
779	0.63
780	0.53
781	0.51
782	0.43
783	0.39
784	0.33
785	0.3
786	0.34
787	0.32
788	0.32
789	0.29
790	0.29
791	0.24
792	0.22
793	0.25
794	0.18
795	0.21
796	0.2
797	0.16
798	0.16
799	0.15
800	0.13
801	0.11
802	0.11
803	0.11
804	0.12
805	0.12
806	0.11
807	0.11
808	0.11
809	0.11
810	0.11
811	0.09
812	0.08
813	0.1
814	0.13
815	0.14
816	0.15
817	0.16
818	0.16
819	0.15
820	0.15
821	0.14
822	0.12
823	0.1
824	0.09
825	0.09
826	0.09
827	0.1
828	0.11
829	0.14
830	0.15
831	0.16
832	0.17
833	0.2
834	0.26
835	0.34
836	0.42
837	0.44
838	0.48
839	0.48
840	0.48
841	0.46
842	0.48
843	0.45
844	0.4
845	0.37
846	0.32
847	0.32
848	0.29
849	0.28
850	0.2
851	0.15
852	0.1
853	0.09
854	0.09
855	0.1
856	0.11
857	0.1
858	0.1
859	0.09
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.1
864	0.1
865	0.14
866	0.2
867	0.28
868	0.35
869	0.38
870	0.44
871	0.49
872	0.59
873	0.61
874	0.58
875	0.53
876	0.52
877	0.55
878	0.57
879	0.61
880	0.55
881	0.54
882	0.54
883	0.52
884	0.47
885	0.41
886	0.34
887	0.25
888	0.21
889	0.21
890	0.18
891	0.18
892	0.22
893	0.29
894	0.32
895	0.39
896	0.46
897	0.49
898	0.54
899	0.55
900	0.55
901	0.53
902	0.56
903	0.53
904	0.52
905	0.46
906	0.43
907	0.41
908	0.39
909	0.4
910	0.33
911	0.36
912	0.3
913	0.33
914	0.35
915	0.37
916	0.35
917	0.34
918	0.38
919	0.38
920	0.42
921	0.46
922	0.45
923	0.47
924	0.49
925	0.52
926	0.52
927	0.49
928	0.48
929	0.47
930	0.45
931	0.48
932	0.51
933	0.54
934	0.53
935	0.51
936	0.53
937	0.47
938	0.5
939	0.47
940	0.44
941	0.41
942	0.41
943	0.46
944	0.42
945	0.45
946	0.45
947	0.46
948	0.47
949	0.48
950	0.47
951	0.42
952	0.46
953	0.5
954	0.54
955	0.58
956	0.64
957	0.64
958	0.65
959	0.65
960	0.67
961	0.64
962	0.65
963	0.61
964	0.58
965	0.52
966	0.49
967	0.47
968	0.39
969	0.35
970	0.28
971	0.26
972	0.21
973	0.21
974	0.2
975	0.2
976	0.22
977	0.23
978	0.29
979	0.28
980	0.29
981	0.3
982	0.34
983	0.4
984	0.46
985	0.49
986	0.49

J8LI80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer